Паттерн метилирования ДНК в участках генома с наследуемыми CNV
Аннотация
Роль CNV в патогенезе умственной отсталости и аутизма значительна. Тем не менее, при анализе CNV-ассоциированных заболеваний дискуссионным вопросом остается выделение патогенетически значимых CNV, при этом механизмы фенотипического проявления унаследованных полиморфных вариантов и их неполной пенетрантности остаются во многом неясными. В настоящее время неполная пенетрантность CNV объясняется, в основном, с точки зрения аллельных взаимодействий различных генетических вариантов. При этом эпигенетические механизмы регуляции экспрессии генов в контексте структурных вариаций генома остаются практически неизученными. Целью настоящей работы являлся поиск дифференциально метилированных CpG-сайтов, локализованных в регионах с унаследованными CNV, в семьях с умственной отсталостью и аутизмом. В результате проведенной работы идентифицировано дифференциальное метилирование внутригенных CpG-сайтов гена IMMP2L в семье больного с умственной отсталостью и микроделецией 7q31.1. Полученные данные указывают на возможность участия метилирования ДНК в реализации механизмов неполной пенетрантности CNV-ассоциированных патологических состояний.
Об авторах
Н. А. Скрябин
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
С. А. Васильев
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
Е. Н. Толмачева
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
А. Р. Шорина
Новосибирский областной детский клинический психоневрологический диспансер
Россия
Россия
Р. Р. Савченко
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики
Россия
Россия
А. А. Кашеварова
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
И. Н. Лебедев
ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
Список литературы
1. Hochstenbach R, Buizer-Voskamp JE, Vorstman JAS et al. Genome arrays for the detection of copy number variations in idiopathic mental retardation, idiopathic generalized epilepsy and neuropsychiatric disorders: Lessons for diagnostic workflow and research. Cytogenet Genome Res. 2011;135(3-4):174-202.
2. Persico AM, Napolioni V. Autism genetics. Behav Brain Research. 2013; 251:95-112.
3. Beckmann JS, Estivill X, Antonarakis SE. Copy number variants and genetic traits: closer to the resolution of phenotypic to genotypic variability. Nat Rev Genet. 2007;8(8):639-46.
4. Lee C, Scherer SW. The clinical context of copy number variation in the human genome. Expert Rev Mol Med. 2010;12(March):e8.
5. Smith AC, Suzuki M, Thompson R, et al. Maternal gametic transmission of translocations or inversions of human chromosome 11p15.5 results in regional DNA hypermethylation and downregulation of CDKN1C expression. Genomics. 2012;99(1):25-35.
6. Gimelli S, Capra V, Di Rocco M, et al. Interstitial 7q31.1 copy number variations disrupting IMMP2L gene are associated with a wide spectrum of neurodevelopmental disorders. Mol Cytogenet. 2014;7:54.
7. Bertelsen B, Melchior L, Jensen LR et al. Intragenic deletions affecting two alternative transcripts of the IMMP2L gene in patients with Tourette syndrome. Eur J Hum Genet. 2014;22(11):1283-1289.
8. Jjingo D, Conley AB, Yi SV et al. On the presence and role of human gene-body DNA methylation. Oncotarget. 2012;3(4):462-474.
Рецензия
Для цитирования:
Скрябин Н.А., Васильев С.А., Толмачева Е.Н., Шорина А.Р., Савченко Р.Р., Кашеварова А.А., Лебедев И.Н. Паттерн метилирования ДНК в участках генома с наследуемыми CNV. Медицинская генетика. 2017;16(12):27-30.
For citation:
Skryabin N.A., Vasiliev S.A., Tolmacheva E.N., Shorina A.R., Savchenko R.R., Kashevarova A.A., Lebedev I.N. DNA methylation pattern in regions of the genome with inherited CNV. Medical Genetics. 2017;16(12):27-30. (In Russ.)
Просмотров: 566
Послать статью по эл. почте 