Изучение редкого варианта гена CFTR c.1329_1350del в гомозиготном состоянии у ребенка с муковисцидозом с помощью функциональных тестов

   Изучение редких вариантов в гене CFTR является актуальным в эпоху таргетной терапии CFTR-модуляторами. В данном исследовании изучена клиническая картина муковисцидоза, а также функция CFTR-канала у гомозиготного носителя редкого патогенного варианта c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19), относящегося к I классу нарушений в гене CFTR. Получена полная корреляция результатов функциональных тестов с фенотипической картиной муковисцидоза и потовым тестом. Метод определения разности кишечных потенциалов продемонстрировал отсутствие функциональной активности хлорного CFTR канала в ректальном биоптате; при стимулировании форсколином органоиды пациента не ответили набуханием, что свидетельствует о полном нарушении образования функционального белка CFTR. Воздействие на кишечные органоиды всеми зарегистрированными для терапии таргетными препаратами не привело к их набуханию, в отличие от контрольной культуры, гомозиготной по F508del, таким образом, хлорный канал пациента с генотипом p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 оказался нечувствителен ни к одному CFTR-модулятору.

1. Egan M.E. Genetics of Cystic Fibrosis. Clin. Chest Med. 2016; 37; 9–16

2. Marson F.A.L., Bertuzzo C.S., Ribeiro J.D. Classification of CFTR mutation classes. Lancet Respir. Med. 2016; 4; e37–8

3. Pereira S.V.-N., Ribeiro J.D. Ribeiro A.F., et al. Novel, rare and common pathogenic variants in the CFTR gene screened by high-throughput sequencing technology and predicted by in silico tools. Sci. Rep. 2019; 9; 6234

4. Noordhoek J., Gulmans V., Van Der Ent K., et al. Intestinal organoids and personalized medicine in cystic fibrosis: A successful patient-oriented research collaboration. Curr. Opin. Pulm. Med. 2016; 22; 610–6

5. Boj S.F., Vonk A.M., Statia M., et al. Forskolin-induced swelling in intestinal organoids: An in vitro assay for assessing drug response in cystic fibrosis patients. J. Vis. Exp. 2017; 2017; 1–12

6. Muilwijk D., de Poel E., van Mourik P., et al. Forskolin-induced organoid swelling is associated with long-term cystic fibrosis disease progression. Eur. Respir. J. 2022; 60

7. Регистр пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации. 2020 год. Под редакцией Е.И. Кондратьевой, С.А. Красовского, М.А. Стариновой, А.Ю. Воронковой, Е.Л. Амелиной, Н.Ю. Каширской, С.Н. Авдеева, С.И. Куцева.: ИД «Медпрактика-М». 2022: 68 с.

8. Castellani C., Duff A.J.A., Bell S.C., et al. ECFS best practice guidelines: the 2018 revision. J. Cyst. Fibros. 2018; 17; 153–78

9. Клинические рекомендации. Кистозный Фиброз (Муковисцидоз). 2021 https://cr.minzdrav.gov.ru/schema/372_2

10. Dekkers J.F., van der Ent C.K., Beekman J.M. Novel opportunities for CFTR-targeting drug development using organoids. Rare Dis. 2013; 1; 1–6

11. Vonk A.M., van Mourik P., Ramalho A.S., et al. Protocol for Application, Standardization and Validation of the Forskolin-Induced Swelling Assay in Cystic Fibrosis Human Colon Organoids. STAR Protoc. 2020; 1; 1–31

12. Dekkers J.F., Berkers G., Kruisselbrink E., et al. Characterizing responses to CFTR-modulating drugs using rectal organoids derived from subjects with cystic fibrosis. Sci. Transl. Med. 2016; 8

13. Ramalho A.S., Förstová E., Vonk A.M., et al. Correction of CFTR function in intestinal organoids to guide treatment of cystic fibrosis. Eur. Respir. J. 2021; 57

14. Melyanovskaya J.L., Kondratieva E.I., Kutsev S.I. Determination of reference values for the method of intestinal current measurement in the Russian Federation. Med. News North Caucasus 2020; 15

15. Guimbellot J., Sharma J., Rowe S.M. Toward inclusive therapy with CFTR modulators: Progress and challenges. Pediatr. Pulmonol. 2017; 52; S4–14

16. Derichs N., Sanz J., Von Kanel T., et al. Intestinal current measurement for diagnostic classification of patients with questionable cystic fibrosis: Validation and reference data. Thorax 2010; 65; 594–9

17. Clancy J.P., Szczesniak R.D., Ashlock M.A., et al. Multicenter Intestinal Current Measurements in Rectal Biopsies from CF and Non-CF Subjects to Monitor CFTR Function. PLoS One 2013; 8; 1–13

18. Kondratyeva E., Melyanovskaya Y., Efremova A., et al. Clinical and Genetic Characteristics of a Patient with Cystic Fibrosis with a Complex Allele [E217G;G509D] and Functional Evaluation of the CFTR Channel. Genes (Basel). 2023; 14; 1705

19. Kondratyeva E., Melyanovskaya Y., Bulatenko N., et al. Clinical and Functional Characteristics of the E92K CFTR Gene Variant in the Russian and Turkish Population of People with Cystic Fibrosis. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24; 6351

20. Kondratyeva E., Bulatenko N. Melyanovskaya Y., et al. Personalized Selection of a CFTR Modulator for a Patient with a Complex Allele [L467F;F508del]. Curr. Issues Mol. Biol. 2022; 44; 5126–38

21. Kondratyeva E., Bukharova T., Efremova A., et al. Health characteristics of patients with cystic fibrosis whose genotype includes a variant of the nucleotide sequence c.3140-16T>A and functional analysis of this variant. Genes (Basel). 2021; 12.