Влияние генотипа и среды на метилирование ДНК в пересекающихся индексных локусах шизофрении и интеллекта

М. В. Алфимова; Н. В. Кондратьев; М. И. Болгов; М. В. Габаева; В. Е. Голимбет

doi:10.25557/2073-7998.2020.04.10-11

Влияние генотипа и среды на метилирование ДНК в пересекающихся индексных локусах шизофрении и интеллекта

М. В. Алфимова, Н. В. Кондратьев, М. И. Болгов, М. В. Габаева, В. Е. Голимбет

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.04.10-11

Полный текст:

PDF (Rus)

сгенерировать QR код

Аннотация

Целью работы была оценка вклада гаплотипов и полисредового риска (ПСР) в вариативность метилирования ДНК в локусах риска шизофрении. В периферической крови 70 пациентов методом одномолекулярного секвенирования Pacbio бисульфитно-конвертированной ДНК исследовали фрагменты внутри генов MIR137HR и CYP17A1 и вблизи SLC39A8. Из почти 1000 изученных цитозинов восемь были вариативно метилированы. Для семи из них обнаружено влияние генотипа. Дополнительно в одном случае найден эффект взаимодействия генотипа и ПСР и в одном - главный эффект ПСР. Таким образом, у больных в изученных участках вариативность метилирования преимущественно обусловлена структурой ДНК.