medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.1234/XXXX-XXXX-2015-11-3-8medgen-63Research ArticleНАУЧНЫЕ ОБЗОРЫREVIEWФолатный цикл: обзор и практические рекомендации по интерпретации генетических тестовFolate cycle: review and practical recommendations for the interpretation of genetic testsКохН. В.KokhN. V.natalikohh@gmail.comСлепухинаА. А.SlepukhinaA. A.noemail@neicon.ruЛифшицГ. И.LifshitsG. I.noemail@neicon.ruИнститут химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SBRASRussian Federation201516062016141138Copyright © Кох Н.В., Слепухина А.А., Лифшиц Г.И., 20162016Кох Н.В., Слепухина А.А., Лифшиц Г.И.Kokh N.V., Slepukhina A.A., Lifshits G.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/63

Многочисленные исследования ассоциаций однонуклеотидных полиморфизмов генов фолатного цикла с различными патологическими состояниями привели к предложениям тестирования генетических маркёров фолатного цикла для пациентов в рутинной практике. При этом существуют различия в интерпретации результатов, в некоторых случаях возникает неоднозначность понимания, какой конкретно маркёр был проанализирован. В данный обзор включены описание физиологических эффектов ферментов фолатного цикла, влияния наиболее исследованных полиморфных замен и вариант заключения при выявлении минорных аллелей у пациента.

The existence of numerous studies the association of single nucleotide polymorphisms (SNP) of folate cycle with various pathological conditions has led to testing genetic markers of folate cycle for patients in routine practice in some laboratories. At the same time, there are some differences issuing opinions and interpretation of results, in some cases, there is ambiguity in understanding what specific marker was analyzed. This review includes a description of the physiological effects of folate cycle enzymes, the influence of the most studied polymorphic replacements and the option to enter into the detection of minor alleles in the patient.

фолатный циклфолиевая кислотаполиморфизмMTHFRMTRMTRRfolate cyclepolymorphismfolic acidMTHFRMTRMTRRReferencesБолдырев А.А. Молекулярные механизмы токсичности гомоцистеина // Биохимия. - 2009. - Т. 74, №6. - С. 725-736.Болдырев А.А. Молекулярные механизмы токсичности гомоцистеина // Биохимия. - 2009. - Т. 74, №6. - С. 725-736.Вайнер А.С., Воронина Е.Н., Кострыкина Н.А. и др. Полиморфные варианты генов фолатного цикла в популяции жителей Новосибирска // Вестник НГУ. Серия биология и клиническая медицина. - 2008. - Т. 6, №2. - С. 13-19.Вайнер А.С., Воронина Е.Н., Кострыкина Н.А. и др. Полиморфные варианты генов фолатного цикла в популяции жителей Новосибирска // Вестник НГУ. Серия биология и клиническая медицина. - 2008. - Т. 6, №2. - С. 13-19.Кох Н.В., Воронина Е.Н., Пасман Н.М., и др. Исследование влияния генетической предрасположенности к тромбофилии на течение беременности //Вестник Новосибирского государственного университета. Серия: Биология, клиническая медицина. - 2008. - Т. 6. №2. - С. 20-24.Кох Н.В., Воронина Е.Н., Пасман Н.М., и др. Исследование влияния генетической предрасположенности к тромбофилии на течение беременности //Вестник Новосибирского государственного университета. Серия: Биология, клиническая медицина. - 2008. - Т. 6. №2. - С. 20-24.Лифшиц Г.И., Отева Э.А., Николаев К.Ю., и др. Особенности формирования факторов риска ишемической болезни сердца у детей с отягощённым анамнезом и подходы к профилактике // Консилиум. - 1999. - №6. - С. 60-63.Лифшиц Г.И., Отева Э.А., Николаев К.Ю., и др. Особенности формирования факторов риска ишемической болезни сердца у детей с отягощённым анамнезом и подходы к профилактике // Консилиум. - 1999. - №6. - С. 60-63.Николаева А.А., Отева Э.А., Егорова Н.А., и др. Кабинет семейного консультирования в крупной поликлинике города как первое звено профилактики сердечно-сосудистых заболеваний // Педиатрия. - 2001. - Т. 80, №2. - С. 102-104.Николаева А.А., Отева Э.А., Егорова Н.А., и др. Кабинет семейного консультирования в крупной поликлинике города как первое звено профилактики сердечно-сосудистых заболеваний // Педиатрия. - 2001. - Т. 80, №2. - С. 102-104.Appling D.R. Compartmentation of folate-mediated one-carbon metabolism in eukaryotes // FASEB journal. - 1991. - Vol. 5, №12. - P. 2645-2651.Appling D.R. Compartmentation of folate-mediated one-carbon metabolism in eukaryotes // FASEB journal. - 1991. - Vol. 5, №12. - P. 2645-2651.Beaudin A.E., Stover P.J. Folate-mediated one-carbon metabolism and neural tube defects: balancing genome synthesis and gene expression // Birth defects research. Part C. - 2007. - Vol. 81, №3. - P. 183-203.Beaudin A.E., Stover P.J. Folate-mediated one-carbon metabolism and neural tube defects: balancing genome synthesis and gene expression // Birth defects research. Part C. - 2007. - Vol. 81, №3. - P. 183-203.Blount B.C., Ames B.N. DNA damage in folate deficiency // Baillieres Clinical Haematology. - 1995. - Vol. 8, №3. - P. 461-478.Blount B.C., Ames B.N. DNA damage in folate deficiency // Baillieres Clinical Haematology. - 1995. - Vol. 8, №3. - P. 461-478.Blount B.C., Mack M.M., Wehr C.M. et al. Folate deficiency causes uracil misincorporation into human DNA and chromosome breakage: implications for cancer and neuronal damage // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1997. - Vol. 94, №7. - P. 3290-3295.Blount B.C., Mack M.M., Wehr C.M. et al. Folate deficiency causes uracil misincorporation into human DNA and chromosome breakage: implications for cancer and neuronal damage // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1997. - Vol. 94, №7. - P. 3290-3295.Chango А., Emery-Fillon N., De Courcy G.P. et al. A polymorphism (80G->A) in the reduced folate carrier gene and its associations with folate status and homocysteinemia // Molecular genetics and metabolism. - 2000. - Vol. 70, №4. - P. 310-315.Chango А., Emery-Fillon N., De Courcy G.P. et al. A polymorphism (80G->A) in the reduced folate carrier gene and its associations with folate status and homocysteinemia // Molecular genetics and metabolism. - 2000. - Vol. 70, №4. - P. 310-315.Christensen K.E., Rohlicek C.V., Andelfinger G.U. et al. The MTHFD1 p.Arg653Gln variant alters enzyme function and increases risk for congenital heart defects // Human mutation. - 2009. - Vol. 30, №2. - P. 212-220.Christensen K.E., Rohlicek C.V., Andelfinger G.U. et al. The MTHFD1 p.Arg653Gln variant alters enzyme function and increases risk for congenital heart defects // Human mutation. - 2009. - Vol. 30, №2. - P. 212-220.Duthie S.J., Narayanan S., Blum et al. Folate Deficiency In Vitro Induces Uracil Misincorporation and DNA Hypomethylation and Inhibits DNA Excision Repair in Immortalized Normal Human Colon Epithelial Cells // Nutrition and Cancer. - 2013. - Vol. 37, №2. - P. 37-41.Duthie S.J., Narayanan S., Blum et al. Folate Deficiency In Vitro Induces Uracil Misincorporation and DNA Hypomethylation and Inhibits DNA Excision Repair in Immortalized Normal Human Colon Epithelial Cells // Nutrition and Cancer. - 2013. - Vol. 37, №2. - P. 37-41.Herbig K., Chiang E.-P., Lee L.-R. et al. Cytoplasmic serine hydroxymethyltransferase mediates competition between folate-dependent deoxyribonucleotide and S-adenosylmethionine biosyntheses // The Journal of biological chemistry. - 2002. - Vol. 277, №41. - P. 38381-38389.Herbig K., Chiang E.-P., Lee L.-R. et al. Cytoplasmic serine hydroxymethyltransferase mediates competition between folate-dependent deoxyribonucleotide and S-adenosylmethionine biosyntheses // The Journal of biological chemistry. - 2002. - Vol. 277, №41. - P. 38381-38389.Lucock M. Folic acid: nutritional biochemistry, molecular biology, and role in disease processes // Molecular genetics and metabolism. - 2000. - Vol. 71, №1-2. - P. 121-138.Lucock M. Folic acid: nutritional biochemistry, molecular biology, and role in disease processes // Molecular genetics and metabolism. - 2000. - Vol. 71, №1-2. - P. 121-138.Ni W., Li H., Wu A. et al. Lack of association between genetic polymorphisms in three folate-related enzyme genes and male infertility in the Chinese population //Journal of Assisted Reproduction and Genetics. - 2015. - Vol. 32(3). - P. 363-374.Ni W., Li H., Wu A. et al. Lack of association between genetic polymorphisms in three folate-related enzyme genes and male infertility in the Chinese population //Journal of Assisted Reproduction and Genetics. - 2015. - Vol. 32(3). - P. 363-374.Parе G., Chasman D.I., Parker A.N. et al. Novel associations of CPS1, MUT, NOX4, and DPEP1 with plasma homocysteine in a healthy population: a genome-wide evaluation of 13 974 participants in the Women’s Genome Health Study // Circ. Cardiovasc. Genet. - 2009. - Vol. 2(2). - P. 142-150.Parе G., Chasman D.I., Parker A.N. et al. Novel associations of CPS1, MUT, NOX4, and DPEP1 with plasma homocysteine in a healthy population: a genome-wide evaluation of 13 974 participants in the Women’s Genome Health Study // Circ. Cardiovasc. Genet. - 2009. - Vol. 2(2). - P. 142-150.Tsang B.L., Devine O.J., Cordero A.M. et al. Assessing the association between the methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) 677C>T polymorphism and blood folate concentrations: a systematic review and meta-analysis of trials and observational studies // Am. J. Clin. Nutr. - 2015. - Vol. 101(6). - P. 1286-1294.Tsang B.L., Devine O.J., Cordero A.M. et al. Assessing the association between the methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) 677C>T polymorphism and blood folate concentrations: a systematic review and meta-analysis of trials and observational studies // Am. J. Clin. Nutr. - 2015. - Vol. 101(6). - P. 1286-1294.Wald D.S., Law M., Morris J.K. Homocysteine and cardiovascular disease: evidence on causality from a meta-analysis // BMJ. - 2002. - Vol. 325, №7374. - P. 1202.Wald D.S., Law M., Morris J.K. Homocysteine and cardiovascular disease: evidence on causality from a meta-analysis // BMJ. - 2002. - Vol. 325, №7374. - P. 1202.Zeisel S.H. Epigenetic mechanisms for nutrition determinants of later health outcomes // Am. J. Clin. Nutr. - 2009. - Vol. 89(5). - P. 1488-1493.Zeisel S.H. Epigenetic mechanisms for nutrition determinants of later health outcomes // Am. J. Clin. Nutr. - 2009. - Vol. 89(5). - P. 1488-1493.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.