medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2018.11.25-28medgen-600Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHCNVs в нозологической структуре врожденных пороков сердцаCNVs in the nosological structure of congenital heart diseaseСлепухинаА. А.SlepukhinaA. A.a.slepukhina@medgenetics.ruСкрябинН. А.SkryabinN. A.noemail@neicon.ruКашевароваА. А.KashevarovaA. A.noemail@neicon.ruЛифшицГ. И.LifshitsG. I.noemail@neicon.ruЛебедевИ. Н.LebedevI. N.noemail@neicon.ruИнститут химической биологии и фундаментальной медицины СО РАНРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of Russian Academy of SciencesRussian FederationНаучно исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАНРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center of Russian Academy of SciencesRussian Federation20180111201817112528Copyright © Слепухина А.А., Скрябин Н.А., Кашеварова А.А., Лифшиц Г.И., Лебедев И.Н., 20182018Слепухина А.А., Скрябин Н.А., Кашеварова А.А., Лифшиц Г.И., Лебедев И.Н.Slepukhina A.A., Skryabin N.A., Kashevarova A.A., Lifshits G.I., Lebedev I.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/600

Вариации числа копий ДНК (CNVs) являются одной из генетических причин врожденных пороков сердца (ВПС). Существующие представления о CNVs в этиологии ВПС не могут полностью объяснить формирование того или иного порока сердца, поэтому актуально более глубокое изучение этого явления. Полученные знания будут направлены на разработку новых подходов для улучшения диагностики геномного дисбаланса у пациентов с ВПС. Цель. Изучить представленность патогенетически значимых CNVs в нозологической структуре ВПС и обнаружить связь между патогенетически значимыми CNVs и аномальным строением сердца. Материалы и методы. 31 ребенок с ВПС, сочетающимся с экстракардиальной патологией был включен в исследование. Образцы ДНК были проанализированы с использованием ДНК-микрочипов высокой плотности SurePrint G3 Human Genome CGH+SNP Microarray Kit, 8х60K (Agilent Technologies, США). Для описания нозологической структуры использовали МКБ-11. Результаты. У 32% (10/31) пациентов с ВПС и экстракардиальной патологией были выявлены патогенетически значимые CNVs. CNVs были представлены в следующих категориях ВПС: аномалии желудочков и их перегородки; аномалии межпредсердной перегородки; аномалии вентрикуло-артериального клапана или смежных областей; аномалии вен средостения. 8 из 10 пациентов с патогенными и потенциально патогенными CNVs имели септальные дефекты или конотрункальные пороки сердца, у 9 из 10 - порок сердца включал более одной аномалии. Выводы. У пациентов c конотрункальными, септальными или сложными ВПС и экстракардиальной патологией с большей вероятностью возможно обнаружение клинически значимых CNVs.

Copy number variations (CNVs) are one of the genetic causes of congenital heart disease. Existing views on CNVs in the etiology of the congenital heart disease (CHD) does not fully explain the formation of a specific heart defect. The obtained knowledge will be directed to the development of new approaches for improving the diagnosis of genomic imbalance in patients with CHD. This study aim at investigating the presence of pathogenetically significant CNVs in the nosological structure of CHD. Materials and methods. 31 children with CHD, combined with extracardiac pathology were included in the study. Samples of DNA were analyzed using high-density DNA microarrays SurePrint G3 Human Genome CGH + SNP Microarray Kit, 8 х 60K (Agilent Technologies, USA). ICD-11 was used to describe the nosological structure. Results. Pathogenic and likely pathogenic CNVs were detected in 32% (10/31) of patients with CHD and extracardiac pathology. CNVs were identified in the categories of CHD: anomaly of a ventricle or the ventricular septum; anomaly of atrial septum; anomaly of a ventriculo-arterial valve or adjacent regions; anomaly of the mediastinal vein. Conclusions. The detection of pathogenic or likely pathogenic CNVs is more often associated with conotruncal, septal or complex heart defects.

вариации числа копий ДНКCNVврожденные пороки сердцаcopy number variationsCNVscongenital heart diseaseReferencesFranklin RCG, Bеland MJ, Colan SD, et al. Nomenclature for congenital and paediatric cardiac disease: the International Paediatric and Congenital Cardiac Code (IPCCC) and the Eleventh Iteration of the International Classification of Diseases (ICD-11). Cardiol Young. 2017;27(10):1872-1938. doi:10.1017/S1047951117002244.Franklin RCG, Bеland MJ, Colan SD, et al. Nomenclature for congenital and paediatric cardiac disease: the International Paediatric and Congenital Cardiac Code (IPCCC) and the Eleventh Iteration of the International Classification of Diseases (ICD-11). Cardiol Young. 2017;27(10):1872-1938. doi:10.1017/S1047951117002244.Lang RM, Bierig M, Devereux RB, et al. Рекомендации по количественной оценке структуры и функции камер сердца. Российский кардиологический журнал. 2012;3(95):3-28.Lang RM, Bierig M, Devereux RB, et al. Рекомендации по количественной оценке структуры и функции камер сердца. Российский кардиологический журнал. 2012;3(95):3-28.Автор. 2017.Автор. 2017.Esplin ED, Li B, Slavotinek A, et al. Nine patients with Xp22.31 microduplication, cognitive deficits, seizures, and talipes anomalies. Am J Med Genet Part A. 2014;164(8):2097-2103. doi:10.1002/ajmg.a.36598.Esplin ED, Li B, Slavotinek A, et al. Nine patients with Xp22.31 microduplication, cognitive deficits, seizures, and talipes anomalies. Am J Med Genet Part A. 2014;164(8):2097-2103. doi:10.1002/ajmg.a.36598.Lage K, Greenway SC, Rosenfeld JA, et al. Genetic and environmental risk factors in congenital heart disease functionally converge in protein networks driving heart development. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109(35):14035-40. doi:10.1073/pnas.1210730109.Lage K, Greenway SC, Rosenfeld JA, et al. Genetic and environmental risk factors in congenital heart disease functionally converge in protein networks driving heart development. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109(35):14035-40. doi:10.1073/pnas.1210730109.van der Linde D, Konings EEM, Slager MA, et al. Birth Prevalence of Congenital Heart Disease Worldwide. J Am Coll Cardiol. 2011;58(21):2241-2247. doi:10.1016/j.jacc.2011.08.025.van der Linde D, Konings EEM, Slager MA, et al. Birth Prevalence of Congenital Heart Disease Worldwide. J Am Coll Cardiol. 2011;58(21):2241-2247. doi:10.1016/j.jacc.2011.08.025.Geng J, Picker J, Zheng Z, et al. Chromosome microarray testing for patients with congenital heart defects reveals novel disease causing loci and high diagnostic yield. BMC Genomics. 2014;15(1):1127. doi:10.1186/1471-2164-15-1127.Geng J, Picker J, Zheng Z, et al. Chromosome microarray testing for patients with congenital heart defects reveals novel disease causing loci and high diagnostic yield. BMC Genomics. 2014;15(1):1127. doi:10.1186/1471-2164-15-1127.Lalani SR, Belmont JW. Genetic basis of congenital cardiovascular malformations. Eur J Med Genet. 2014;57(8):402-13. doi:10.1016/j.ejmg.2014.04.010.Lalani SR, Belmont JW. Genetic basis of congenital cardiovascular malformations. Eur J Med Genet. 2014;57(8):402-13. doi:10.1016/j.ejmg.2014.04.010.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.