medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.1234/XXXX-XXXX-2015-10-25-28medgen-58Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHОпределение функциональной значимости варианта c.423-6A>G в гене APC у пациента с клиническими признаками семейного аденоматоза толстой кишкиInvestigation of the functional significance of variant c.423-6A>G in the APC gene in a patient with familial adenomatous polyposisЦукановА. С.TsukanovA. S.info@gnck.ruПоспеховаН. И.PospekhovaN. I.noemail@neicon.ruШубинВ. П.ShubinV. P.noemail@neicon.ruКузьминовА. М.KuzminovA. M.noemail@neicon.ruСачковИ. Ю.SachkovI. Yu.noemail@neicon.ruКашниковВ. Н.KashnikovV. N.noemail@neicon.ruФроловС. А.FrolovS. A.noemail@neicon.ruШелыгинЮ. А.ShelyginJu. A.noemail@neicon.ruФедеральное государственное бюджетное учреждение «Государственный научный центр колопроктологии им. А.Н. Рыжих» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияState Scientific Center of ColoproctologyRussian Federation20151606201614102528Copyright © Цуканов А.С., Поспехова Н.И., Шубин В.П., Кузьминов А.М., Сачков И.Ю., Кашников В.Н., Фролов С.А., Шелыгин Ю.А., 20162016Цуканов А.С., Поспехова Н.И., Шубин В.П., Кузьминов А.М., Сачков И.Ю., Кашников В.Н., Фролов С.А., Шелыгин Ю.А.Tsukanov A.S., Pospekhova N.I., Shubin V.P., Kuzminov A.M., Sachkov I.Y., Kashnikov V.N., Frolov S.A., Shelygin J.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/58

До 1% всех случаев колоректального рака возникает на фоне семейного аденоматоза толстой кишки. Этот наследственный синдром в большинстве случаев обусловлен герминальными мутациями в гене APC . Около 85% унаследованных мутаций являются небольшими делециями/инсерциями и нонсенс-мутациями, оставшиеся 15% - большие делеции, миссенс-мутации и мутации сайта сплайсинга. Однако далеко не для всех миссенс-мутаций и интронных вариантов в гене APC определена функциональная значимость. В работе проведено выяснение патогенного значения ранее не описанного варианта c.423-6A>G в гене APC у пациента с клиническими признаками классической формы семейного аденоматоза толстой кишки. Нами выполнен анализ мутационных изменений на уровне мРНК, который выявил изменения транскрипта, обусловленные нарушением процесса сплайсинга. Полученные данные однозначно указывают на то, что вариант c.423-6A>G в гене APC является патогенной мутацией.

Up to 1% of all colorectal cancers appear as a result of familial adenomatous polyposis. This hereditary syndrome in most cases is driven by APC gene germline mutations. Around 85% of mutations are small deletions/insertions and nonsence mutations, while other 15% are large deletions, missence and splice site mutations. Meanwhile, functional significance of some of missence mutations and intronic variants of APC gene is not described. We determined pathogenic significance of a previously not described c.423-6A>G variant of APC gene in a patient with familial adenomatous polyposis. We analyzed mutation changes on mRNA level revealing changes of transcript as a result of disturbed splicing process. Data strongly suggests that c.423-6A>G variant of APC gene is a pathogenic mutation.

ген APCколоректальный раксемейный аденоматоз толстой кишкиAPC genecolorectal cancerfamilial adenomatous polyposisReferencesЦуканов А.С., Шубин В.П., Поспехова Н.И. и др. Наследственные раки желудочно-кишечного тракта // Практическая онкология. - 2014. - Т. 15, № 3. - С. 126-133.Цуканов А.С., Шубин В.П., Поспехова Н.И. и др. Наследственные раки желудочно-кишечного тракта // Практическая онкология. - 2014. - Т. 15, № 3. - С. 126-133.Шелыгин Ю.А., Кашников В.Н., Фролов С.А. и др. Молекулярно-генетическое исследование наследственной предрасположенности к разным формам полипоза толстой кишки // Колопроктология. - 2013. - № 1 (43). - С. 9-14.Шелыгин Ю.А., Кашников В.Н., Фролов С.А. и др. Молекулярно-генетическое исследование наследственной предрасположенности к разным формам полипоза толстой кишки // Колопроктология. - 2013. - № 1 (43). - С. 9-14.Aretz S., Uhlhaas S., Sun Y. et al. Familial adenomatous polyposis: aberrant splicing due to missense or silent mutations in the APC gene // Hum. Mutat. - 2004. - Vol. 24, № 5. - P. 370-380.Aretz S., Uhlhaas S., Sun Y. et al. Familial adenomatous polyposis: aberrant splicing due to missense or silent mutations in the APC gene // Hum. Mutat. - 2004. - Vol. 24, № 5. - P. 370-380.Charames G., Cheng H., Gilpin C. et al. A novel aberrant splice site mutation in the APC gene // J. Med. Genet. - 2002. - Vol. 39, № 10. - P. 754-757.Charames G., Cheng H., Gilpin C. et al. A novel aberrant splice site mutation in the APC gene // J. Med. Genet. - 2002. - Vol. 39, № 10. - P. 754-757.Han S., Ryu J., Kim Y. et al. Mutation analysis of the APC gene in unrelated Korean patients with FAP: four novel mutations with unusual phenotype // Fam. Cancer. - 2011. - Vol. 10, № 1. - P. 21-26.Han S., Ryu J., Kim Y. et al. Mutation analysis of the APC gene in unrelated Korean patients with FAP: four novel mutations with unusual phenotype // Fam. Cancer. - 2011. - Vol. 10, № 1. - P. 21-26.Kastrinos F., Syngal S. Inherited Colorectal Cancer Syndromes // Cancer J. - 2011. - Vol. 17, № 6. - P. 405-415.Kastrinos F., Syngal S. Inherited Colorectal Cancer Syndromes // Cancer J. - 2011. - Vol. 17, № 6. - P. 405-415.Kerr S., Thomas C., Thibodeau S. et al. APC germline mutations in individuals being evaluated for familial adenomatous polyposis: a review of the Mayo Clinic experience with 1591 consecutive tests // J. Mol. Diagn. - 2013. - Vol. 15. - P. 31-43.Kerr S., Thomas C., Thibodeau S. et al. APC germline mutations in individuals being evaluated for familial adenomatous polyposis: a review of the Mayo Clinic experience with 1591 consecutive tests // J. Mol. Diagn. - 2013. - Vol. 15. - P. 31-43.Lal G., Gallinger S. Familial adenomatous polyposis // Seminars in Surgical Oncology. - 2000. - Vol. 18. - P. 314-323.Lal G., Gallinger S. Familial adenomatous polyposis // Seminars in Surgical Oncology. - 2000. - Vol. 18. - P. 314-323.Nieuwenhuis M., Vasen F. Correlations between mutation site in APC and phenotype of familial adenomatous polyposis (FAP): A review of the literature // Crit. Rev. Oncol. Hematol. - 2007. - Vol. 61. - P. 153-161.Nieuwenhuis M., Vasen F. Correlations between mutation site in APC and phenotype of familial adenomatous polyposis (FAP): A review of the literature // Crit. Rev. Oncol. Hematol. - 2007. - Vol. 61. - P. 153-161.Wallis Y., Morton D., McKeown C., Macdonald F. Molecular analysis of the APC gene in 205 families: extended genotype-phenotype correlations in FAP and evidence for the role of APC amino acid changes in colorectal cancer predisposition // J. Med. Genet. - 1999. - Vol. 36, №1. - P. 14-20.Wallis Y., Morton D., McKeown C., Macdonald F. Molecular analysis of the APC gene in 205 families: extended genotype-phenotype correlations in FAP and evidence for the role of APC amino acid changes in colorectal cancer predisposition // J. Med. Genet. - 1999. - Vol. 36, №1. - P. 14-20.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.