medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2018.02.29-34medgen-395Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHИсследование генетической компоненты при разных клинических проявлениях туберкулезаStudying the role of genetic component in development of different clinical forms of TBГараеваА. Ф.GaraevaA. F.anna-garaeva@medgenetics.ruРудкоА. А.RudloA. A.noemail@neicon.ruБрагинаЕ. Ю.BraginaE. Yu.noemail@neicon.ruБабушкинаН. П.BabushkinaN. P.noemail@neicon.ruКолоколоваО. В.KolokolovaO. V.noemail@neicon.ruЛипаенковаО. Н.LipaenkovaO. N.noemail@neicon.ruПузыревВ. П.PuzyrevV. P.noemail@neicon.ruФрейдинМ. Б.FreidinM. B.noemail@neicon.ruФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетикиРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk NRMCRussian FederationФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет»РоссияSiberian State Medical UniversityRussian FederationОГБУЗ «Томский фтизиопульмонологический медицинский центр»РоссияTuberculosis hospitalRussian FederationФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» Научно-исследовательский институт медицинской генетики; ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет»РоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk NRMC; Siberian State Medical UniversityRussian Federation2018030420181722934Copyright © Гараева А.Ф., Рудко А.А., Брагина Е.Ю., Бабушкина Н.П., Колоколова О.В., Липаенкова О.Н., Пузырев В.П., Фрейдин М.Б., 20182018Гараева А.Ф., Рудко А.А., Брагина Е.Ю., Бабушкина Н.П., Колоколова О.В., Липаенкова О.Н., Пузырев В.П., Фрейдин М.Б.Garaeva A.F., Rudlo A.A., Bragina E.Y., Babushkina N.P., Kolokolova O.V., Lipaenkova O.N., Puzyrev V.P., Freidin M.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/395

Туберкулез (ТБ) является глобальной проблемой здравоохранения как во всем мире, так и в нашей стране, особенно на территории Сибирского федерального округа и Дальнего Востока. Общеизвестным является факт наличия генетических факторов, влияющих на предрасположенность к ТБ. Целью данной работы было изучение роли полиморфизмов генов системы IL-12/IFN-g в развитии разных клинических форм ТБ. Исследование проведено в выборке русских жителей г. Томска: больные ТБ (n = 331) и здоровые доноры (n = 279). Среди больных были выделены подгруппы пациентов с первичным (n = 61) и вторичным (n = 270) ТБ, а также пациенты с инфильтративной (n = 155) и диссеминированной формами (n = 68) ТБ. Показана ассоциация аллеля А и генотипа AA гена STAT1 (rs2066797) с развитием вторичного ТБ (p = 0,0097). Кроме того, установлена ассоциация аллеля С и генотипа СС гена IL12RB1 (rs17882555) с развитием инфильтративной формы заболевания (p<0,001). Полученные результаты свидетельствуют о различиях в генетической подверженности отдельным клиническим формам ТБ.

Tuberculosis (TB) is a global health problem, both in the world and in our country, especially in the Siberia and the Far East. Well known that there are genetic factors that influence to TB predisposition. The aim of this work was studying the role of IL-12 / IFN-g gene polymorphisms in the development of different clinical forms of TB. The study was conducted in a population of russians in Tomsk: TB patients (n = 331) and healthy donors (n = 279). Patients were divided into subgroups: patients with primary (n = 61) and secondary (n = 270) TB. As well as patients with infiltrative (n = 155) and disseminated (n = 68) TB. The effect of allele A and genotype AA of the STAT1 gene on the development of secondary TB (p = 0.0097) was shown. Also, the association of the C allele of the IL12RB1 gene and the CC genotype with the development of infiltrative TB has been identified. Our results suggest differences in genetic predisposition to various forms of TB.

туберкулезполиморфизмгенетическая подверженностьсиндром атипичных семейных микобактериозовtuberculosispolymorphismgenetic susceptibilitysyndrome of atypical family mycobacteriosisReferencesLin PL, Flynn JAL. Understanding latent tuberculosis: a moving target. J. Immunol. 2010 Jul 1;185(1):15-22.Lin PL, Flynn JAL. Understanding latent tuberculosis: a moving target. J. Immunol. 2010 Jul 1;185(1):15-22.Шилова МВ. Взгляд на эпидемическую ситуацию с туберкулезом в российской федерации (в современных социально-экономических условиях). Российский электронный журнал лучевой диагностики. 2014;4(1):34-42.Шилова МВ. Взгляд на эпидемическую ситуацию с туберкулезом в российской федерации (в современных социально-экономических условиях). Российский электронный журнал лучевой диагностики. 2014;4(1):34-42.World Health Organization. Global tuberculosis report 2014. Geneva: WHO; 2014.World Health Organization. Global tuberculosis report 2014. Geneva: WHO; 2014.Ridruechai C, Mahasirimongkol S, Phromjai J et al. Association analysis of susceptibility candidate region on chromosome 5q31 for tuberculosis. Genes and Immunity. 2010 Jul;11(5):416-422.Ridruechai C, Mahasirimongkol S, Phromjai J et al. Association analysis of susceptibility candidate region on chromosome 5q31 for tuberculosis. Genes and Immunity. 2010 Jul;11(5):416-422.Cruz AT, Starke RS. Clinical manifestations of tuberculosis in children. Paediatr. Respir. Rev. 2007 Jun;8(2):107-117.Cruz AT, Starke RS. Clinical manifestations of tuberculosis in children. Paediatr. Respir. Rev. 2007 Jun;8(2):107-117.Ernst JD. The immunological life cycle of tuberculosis. Nat. Rev. Immunol. 2012 Jul 13;12(8):581-591.Ernst JD. The immunological life cycle of tuberculosis. Nat. Rev. Immunol. 2012 Jul 13;12(8):581-591.Abel L, El-Baghdadi J, Bousfiha AA et al. Human genetics of tuberculosis: a long and winding road. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2014 May 12;369(1645):20130428.Abel L, El-Baghdadi J, Bousfiha AA et al. Human genetics of tuberculosis: a long and winding road. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2014 May 12;369(1645):20130428.Рудко АА, Пузырев ВП. Генетическая подверженность туберкулезу. Генетика бронхолегочных заболеваний: под ред. ЛМ Огородовой, ВП Пузырева (Серия монографий Российского респираторного общества; Гл. ред. Серии Чучалин АГ). - М.: Издательский холдинг «Атмосфера», 2010. С. 122 - 139.Рудко АА, Пузырев ВП. Генетическая подверженность туберкулезу. Генетика бронхолегочных заболеваний: под ред. ЛМ Огородовой, ВП Пузырева (Серия монографий Российского респираторного общества; Гл. ред. Серии Чучалин АГ). - М.: Издательский холдинг «Атмосфера», 2010. С. 122 - 139.Cottle LE. Mendelian susceptibility to mycobacterial disease. Clin. Genet. 2011 Jan;79(1):17-22.Cottle LE. Mendelian susceptibility to mycobacterial disease. Clin. Genet. 2011 Jan;79(1):17-22.Рудко АА, Гараева АФ, Брагина ЕЮ и др. Скрининг мутаций генов атипичных семейных микобактериозов. Медицинская генетика. 2013;(12):14-19.Рудко АА, Гараева АФ, Брагина ЕЮ и др. Скрининг мутаций генов атипичных семейных микобактериозов. Медицинская генетика. 2013;(12):14-19.Вейр Б. Анализ генетических данных: Пер. с англ. - М.: Мир, 1995. - 400 с.Вейр Б. Анализ генетических данных: Пер. с англ. - М.: Мир, 1995. - 400 с.Pearce N. What does the odds ratio estimate in a case-control study? Int. J. Epidemiol. 1993;26(6):1189-1192.Pearce N. What does the odds ratio estimate in a case-control study? Int. J. Epidemiol. 1993;26(6):1189-1192.Akahoshi M, Nakashima H, Miyake K et al. Influence of interleukin-12 receptor b1 polymorphisms on tuberculosis. Hum. Genet. 2003 Mar;112(3):237-43.Akahoshi M, Nakashima H, Miyake K et al. Influence of interleukin-12 receptor b1 polymorphisms on tuberculosis. Hum. Genet. 2003 Mar;112(3):237-43.Remus N, El Baghdadi J, Fieschi C et al. Association of IL12RB1 polymorphisms with pulmonary tuberculosis in adults in Morocco. JID. 2004 Aug 1;190(3):580-587.Remus N, El Baghdadi J, Fieschi C et al. Association of IL12RB1 polymorphisms with pulmonary tuberculosis in adults in Morocco. JID. 2004 Aug 1;190(3):580-587.Lee HW, Lee HS, Kim DK et al. Lack of an association between interleukin-12 receptor b1 polymorphisms and tuberculosis in Koreans. Respiration. 2005 Jul-Aug;72(4):365-8Lee HW, Lee HS, Kim DK et al. Lack of an association between interleukin-12 receptor b1 polymorphisms and tuberculosis in Koreans. Respiration. 2005 Jul-Aug;72(4):365-8Sahiratmadja E, Baak-Pablo R, de Visser AW et al. Association of polymorphisms in IL-12/IFN-g pathway genes with susceptibility to pulmonary tuberculosis in Indonesia. Tuberculosis. 2007 Jul;87(4):303-311.Sahiratmadja E, Baak-Pablo R, de Visser AW et al. Association of polymorphisms in IL-12/IFN-g pathway genes with susceptibility to pulmonary tuberculosis in Indonesia. Tuberculosis. 2007 Jul;87(4):303-311.Awomoyi AA, Nejentsev S, Richardson A et al. No association between interferon-g receptor-1 gene polymorphism and pulmonary tuberculosis in a Gambian population sample. Thorax. 2004 Apr;59(4):291-594.Awomoyi AA, Nejentsev S, Richardson A et al. No association between interferon-g receptor-1 gene polymorphism and pulmonary tuberculosis in a Gambian population sample. Thorax. 2004 Apr;59(4):291-594.Hijikata M, Shojima J, Matsushita I et al. Association of IFNGR2 gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis among the Vietnamese. Hum. Genet. 2012 May;131(5):675-82.Hijikata M, Shojima J, Matsushita I et al. Association of IFNGR2 gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis among the Vietnamese. Hum. Genet. 2012 May;131(5):675-82.Kusuhara K, Yamamoto K, Okada K et al. Association of IL12RB1 polymorphisms with susceptibility to and severity of tuberculosis in Japanese: a gene-based association analysis of 21 candidate genes. Int. J. Immunogenetics. 2007 Feb;34(1):35-44.Kusuhara K, Yamamoto K, Okada K et al. Association of IL12RB1 polymorphisms with susceptibility to and severity of tuberculosis in Japanese: a gene-based association analysis of 21 candidate genes. Int. J. Immunogenetics. 2007 Feb;34(1):35-44.He J, Wang J, Lei D et al. Analysis of functional SNP in Ifng?Ifngr1 in chinese Han population with tuberculosis. 2010 Jun;71(6):452-458.He J, Wang J, Lei D et al. Analysis of functional SNP in Ifng?Ifngr1 in chinese Han population with tuberculosis. 2010 Jun;71(6):452-458.Lь J, Pan H, Chen Y et al. Genetic polymorphisms of IFHG and IFNGR1 in association with the risk of pulmonary tuberculosis. Gene. 2014 Jun 10;543(1):140-144.Lь J, Pan H, Chen Y et al. Genetic polymorphisms of IFHG and IFNGR1 in association with the risk of pulmonary tuberculosis. Gene. 2014 Jun 10;543(1):140-144.Cooke GS, Campbell SJ, Sillah J et al. Polymorphism within the Interferon-g/Receptor complex is associated with pulmonary tuberculosis. Am. J. Respir. Crit. Care. Med. 2006 Aug 1;174(3):339-343.Cooke GS, Campbell SJ, Sillah J et al. Polymorphism within the Interferon-g/Receptor complex is associated with pulmonary tuberculosis. Am. J. Respir. Crit. Care. Med. 2006 Aug 1;174(3):339-343.Stein CM, Zalwango S, Chiunda AB et al. Linkage and association analysis of candidate genes for TB and TNFa cytokine expression: evidence for association with IFNGR1, IL-10, and TNF receptor 1 genes. Hum. Genet. 2007 Jul;121(6):663-673.Stein CM, Zalwango S, Chiunda AB et al. Linkage and association analysis of candidate genes for TB and TNFa cytokine expression: evidence for association with IFNGR1, IL-10, and TNF receptor 1 genes. Hum. Genet. 2007 Jul;121(6):663-673.Chapgier A, Kong XF, Boisson-Dupuis S et al. A partial form of recessive STAT1 deficiency in humans. J. Clin. Invest. 2009 Jun;119(6):1502-1514.Chapgier A, Kong XF, Boisson-Dupuis S et al. A partial form of recessive STAT1 deficiency in humans. J. Clin. Invest. 2009 Jun;119(6):1502-1514.Chapgier A, Boisson-Dupuis S, Jouanguy E et al. Novel STAT1 alleles in otherwise healthy patients with mycobacterial disease. PLoS Genet. 2006 Aug 18;2(8):e131.Chapgier A, Boisson-Dupuis S, Jouanguy E et al. Novel STAT1 alleles in otherwise healthy patients with mycobacterial disease. PLoS Genet. 2006 Aug 18;2(8):e131.Bikmaeva AR, Sibiryak SV, Khusnutdinova EK. Insertion Polymorphism of the CYP2E1 gene in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis from Bashkortostan. Molecular Biology. 2004;38(2):196-199.Bikmaeva AR, Sibiryak SV, Khusnutdinova EK. Insertion Polymorphism of the CYP2E1 gene in patients with infiltrative pulmonary tuberculosis from Bashkortostan. Molecular Biology. 2004;38(2):196-199.Garaeva AF, Babushkina NP, Rudko AA et al. Differential genetic background of primary and secondary tuberculosis in Russians. Meta Gene. 2017;11:178-180.Garaeva AF, Babushkina NP, Rudko AA et al. Differential genetic background of primary and secondary tuberculosis in Russians. Meta Gene. 2017;11:178-180.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.