medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2018.01.32-36medgen-380Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHЭволюционно-генетический анализ роли регуляторных участков гена NDRG1 в формировании структуры наследственной предрасположенности к преэклампсии в популяциях различного этнического происхожденияEvolutionary-genetic analysis of the role of regulatory regions in NDRG1 gene in the formation of the hereditary predisposition structure to preeclampsia in different ethnic groupsСереброваВ. Н.SerebrovaV. N.vika.serebrova@medgenetics.ruТрифоноваЕ. А.TrifonovaE. A.noemail@neicon.ruСтепановВ. А.StepanovV. A.noemail@neicon.ruНаучно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center, Russian Academy of SciencesRussian Federation2018260320181713236Copyright © Сереброва В.Н., Трифонова Е.А., Степанов В.А., 20182018Сереброва В.Н., Трифонова Е.А., Степанов В.А.Serebrova V.N., Trifonova E.A., Stepanov V.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/380

Регуляторные однонуклеотидные полиморфные варианты (rSNP) представляют большой интерес для исследователей, поскольку играют значимую роль в развитии различных патологических состояний человека путем изменения уровня экспрессии кандидатных генов, однако относятся к наименее изученной функциональной группе SNP. Целью данного исследования было изучение генетической компоненты преэклампсии (ПЭ) по системе rSNP нового гена-кандидата NDRG1 и выявление роли естественного отбора в ее формировании. В представленной работе изучено четыре rSNP. Исследование проводилось в различных этнических группах (русские, якуты и буряты). Полученные данные показали ассоциацию с развитием ПЭ трех rSNP гена NDRG1: rs12678229, rs2227262 и rs3802252. Выявлено действие слабого отрицательного отбора для rs2227262. Результаты исследования могут свидетельствовать о значимой роли rSNP нового гена-кандидата NDRG1 в формировании вариабельности уровня экспрессии плацентарной ткани при физиологично протекающей беременности и ПЭ.

Regulatory single nucleotide polymorphisms (rSNPs) are of substantial interest, because they play a significant role in the development of human pathology by altering the level of candidate genes expression. However they represent the least studied group of single nucleotide polymorphisms (SNPs). The purpose of this research was to study preeclampsia (PE) genetics components via the regulatory polymorphic variants of the new NDRG1 candidate gene and to detect the role of natural selection in its formation. In this work, we analyzed four rSNPs. Three ethnic group have been studied (Yakut, Russian, Buryat). We have detected significant associations of PE with three rSNPs NDRG1 gene: rs12678229, rs2227262 and rs3802252. We demonstrated the effect of weak negative selection for rs2227262. The results of this study provide evidence for a significant role of the new NDRG1 candidate gene in the variability of the placental tissue expression between normal pregnancy and PE.

преэклампсиярегуляторный однонуклеотидный полиморфный вариант (rSNP)ассоциативное исследованиеплацентатранскриптоместественный отборpreeclampsiaregulatory single-nucleotide polymorphisms (rSNPs)association studyplacentatranscriptomenatural selectionReferencesСтепанов ВА. Эволюция генетического разнообразия и болезни человека. Генетика. 2016;52(7):852-864.Степанов ВА. Эволюция генетического разнообразия и болезни человека. Генетика. 2016;52(7):852-864.Saeb AT, Al-Naqeb D. The Impact of Evolutionary Driving Forces on Human Complex Diseases: A Population Genetics Approach. Scientifica (Cairo). 2016;doi:10.1155/2016/2079704.Saeb AT, Al-Naqeb D. The Impact of Evolutionary Driving Forces on Human Complex Diseases: A Population Genetics Approach. Scientifica (Cairo). 2016;doi:10.1155/2016/2079704.Scheinfeldt LB, Tishkoff SA. Recent human adaptation: genomic approaches, interpretation and insights. Nat.Rev.Genet. 2013;14(10):692-702.Scheinfeldt LB, Tishkoff SA. Recent human adaptation: genomic approaches, interpretation and insights. Nat.Rev.Genet. 2013;14(10):692-702.Tannetta D, Sargent I. Placental disease and the maternal syndrome of preeclampsia: missing links? Curr.Hypertens.Rep. 2013;15(6):590-599.Tannetta D, Sargent I. Placental disease and the maternal syndrome of preeclampsia: missing links? Curr.Hypertens.Rep. 2013;15(6):590-599.Louwen F, Muschol-Steinmetz C, Reinhard J, et al. A lesson for cancer research: placental microarray gene analysis in preeclampsia. Oncotarget. 2012;3(8):759-773.Louwen F, Muschol-Steinmetz C, Reinhard J, et al. A lesson for cancer research: placental microarray gene analysis in preeclampsia. Oncotarget. 2012;3(8):759-773.Трифонова ЕА, Габидулина ТВ, Ершов НИ, и др. Характеристика транскриптома плацентарной ткани у женщин с физиологической беременностью и преэклампсией. Acta Naturae. 2014;6(2):77-90.Трифонова ЕА, Габидулина ТВ, Ершов НИ, и др. Характеристика транскриптома плацентарной ткани у женщин с физиологической беременностью и преэклампсией. Acta Naturae. 2014;6(2):77-90.Антонцева ЕВ, Брызгалов ЛО, Матвеева МЮ, и др. Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011;15(4):644 - 652.Антонцева ЕВ, Брызгалов ЛО, Матвеева МЮ, и др. Поиск регуляторных SNPs, связанных с развитием рака толстой кишки, в генах АРС и МLH1. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011;15(4):644 - 652.Jones BL, Swallow DM. The impact of cis-acting polymorphisms on the human phenotype. Hugo J. 2011;5(1-4):13-23.Jones BL, Swallow DM. The impact of cis-acting polymorphisms on the human phenotype. Hugo J. 2011;5(1-4):13-23.Elliot M.G. Oxidative stress and the evolutionary origins of preeclampsia. J.Reprod.Immunol. 2016;114:75-80.Elliot M.G. Oxidative stress and the evolutionary origins of preeclampsia. J.Reprod.Immunol. 2016;114:75-80.Nishizawa H, Ota S, Suzuki M, et al. Comparative gene expression profiling of placentas from patients with severe pre-eclampsia and unexplained fetal growth restriction. Reprod.Biol.Endocrinol. 2011;doi:10.1186/1477-7827-9-107.Nishizawa H, Ota S, Suzuki M, et al. Comparative gene expression profiling of placentas from patients with severe pre-eclampsia and unexplained fetal growth restriction. Reprod.Biol.Endocrinol. 2011;doi:10.1186/1477-7827-9-107.Sitras V, Paulssen RH, Gronaas H, et al. Differential placental gene expression in severe preeclampsia. Placenta. 2009;30(5):424-433.Sitras V, Paulssen RH, Gronaas H, et al. Differential placental gene expression in severe preeclampsia. Placenta. 2009;30(5):424-433.Сереброва ВН, Трифонова ЕА, Габидулина ТВ, и др. Выявление новых маркеров предрасположенности к преэклампсии путем анализа регуляторных участков генов, демонстрирующих дифференциальную экспрессию в плацентарной ткани. Молекулярная биология. 2016;50(5):870-879.Сереброва ВН, Трифонова ЕА, Габидулина ТВ, и др. Выявление новых маркеров предрасположенности к преэклампсии путем анализа регуляторных участков генов, демонстрирующих дифференциальную экспрессию в плацентарной ткани. Молекулярная биология. 2016;50(5):870-879.Степанов ВА, Трифонова ЕА. Мультиплексное генотипирование однонуклеотидных полиморфных маркеров методом масс-спектрометрии MALDI-TOF: частоты 56 SNP в генах иммунного ответа в популяциях человека. Молекулярная биология. 2013;47(6):976-986.Степанов ВА, Трифонова ЕА. Мультиплексное генотипирование однонуклеотидных полиморфных маркеров методом масс-спектрометрии MALDI-TOF: частоты 56 SNP в генах иммунного ответа в популяциях человека. Молекулярная биология. 2013;47(6):976-986.Gronau I, Arbiza L, Mohammed J, et al. Inference of natural selection from interspersed genomic elements based on polymorphism and divergence. Mol.Biol.Evol. 2013;30(5):1159-1171.Gronau I, Arbiza L, Mohammed J, et al. Inference of natural selection from interspersed genomic elements based on polymorphism and divergence. Mol.Biol.Evol. 2013;30(5):1159-1171.Ellen TP, Ke Q, Zhang P, et al. NDRG1, a growth and cancer related gene: regulation of gene expression and function in normal and disease states. Carcinogenesis. 2008;29(1):2-8.Ellen TP, Ke Q, Zhang P, et al. NDRG1, a growth and cancer related gene: regulation of gene expression and function in normal and disease states. Carcinogenesis. 2008;29(1):2-8.Choi SJ, Oh SY, Kim JH, et al. Increased expression of N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1) in placentas from pregnancies complicated by intrauterine growth restriction or preeclampsia. Am.J.Obstet.Gynecol. 2007;196(1):45.e1-7.Choi SJ, Oh SY, Kim JH, et al. Increased expression of N-myc downstream-regulated gene 1 (NDRG1) in placentas from pregnancies complicated by intrauterine growth restriction or preeclampsia. Am.J.Obstet.Gynecol. 2007;196(1):45.e1-7.Chen B, Nelson DM, Sadovsky Y. N-Myc downregulated gene 1 (Ndrg1) modulates the response of term human trophoblasts to hypoxic injury. J.Biol.Chem. 2006;281(5):2764-2772.Chen B, Nelson DM, Sadovsky Y. N-Myc downregulated gene 1 (Ndrg1) modulates the response of term human trophoblasts to hypoxic injury. J.Biol.Chem. 2006;281(5):2764-2772.Crosley EJ, Elliot MG, Christians JK. Placental invasion, preeclampsia risk and adaptive molecular evolution at the origin of the great apes: evidence from genome-wide analyses. Placenta. 2013;34(2):127-132.Crosley EJ, Elliot MG, Christians JK. Placental invasion, preeclampsia risk and adaptive molecular evolution at the origin of the great apes: evidence from genome-wide analyses. Placenta. 2013;34(2):127-132.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.