117198, г. Москва, ул. Саморы Машела, д. 1
1 Samory Mashela st., Moscow, 117198
117198, г. Москва, ул. Саморы Машела, д. 1
1 Samory Mashela st., Moscow, 117198
117198, г. Москва, ул. Саморы Машела, д. 1
1 Samory Mashela st., Moscow, 117198
117198, г. Москва, ул. Саморы Машела, д. 1
125993, г. Москва, ул. Баррикадная, д.2/1, стр.1
1 Samory Mashela st., Moscow, 117198
2/1 Barrikadnaya st., Moscow, 125993
Введение. Альвеолярная рабдомиосаркома (АРМС) характеризуется типичными химерными транскриптами и иногда сопровождается амплификацией онкогенов, в частности CDK4.
Цель: определить частоту амплификации CDK4 в когорте пациентов с АРМС и оценить связь амплификации с транслокационным статусом опухоли.
Методы. Выполнено ретроспективное исследование 155 образцов АРМС и РМС БДУ (без дополнительных уточнений). Амплификация CDK4 определялась методом интерфазной FISH; транскриптовые варианты идентифицировались с помощью ОТ-ПЦР и РНК-секвенирования. Статистическая обработка включала расчёт долевых показателей и 95% доверительных интервалов методом Клоппера-Пирсона; сравнение долей – с использованием χ² критерия; уровень значимости p<0,05. Результаты. Амплификация CDK4 выявлена в 22,6% (35/155) образцов; варианты амплификации включали низкокопийную (1,5–4 копий), высококопийную (>4 копий) и кластерную. Частота амплификации была различной в подгруппах: PAX3::FOXO1 – 24,7% (25/101), PAX7::FOXO1 – 18,8% (3/16), PAX3::NCOA1 – 25% (1/4), отсутствие транслокации – 17,6% (6/34). Статистически значимых корреляций между статусом CDK4 и клинико-анатомическими или молекулярно-генетическими параметрами не выявлено (p>0,05).
Заключение. Амплификация CDK4 является достаточно распространённым событием при АРМС; её роль как клинически значимого биомаркера требует дальнейшей молекулярной и функциональной валидации.
Introduction. Alveolar rhabdomyosarcoma (ARMS) is commonly associated with characteristic fusion transcripts and, in some cases, with oncogene amplifications, including CDK4.
Objective: to determine the prevalence of CDK4 amplification in a cohort of ARMS cases and to evaluate its association with translocation status.
Methods. A retrospective study of 155 formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples was performed. CDK4 copy number was assessed by interphase FISH; fusion transcripts were identified by RT-PCR and RNA sequencing. Statistical analysis included calculation of proportions with 95% Clopper-Pearson CIs and χ² tests for comparisons; p<0.05 considered significant.
Results. CDK4 amplification was detected in 22.6% (35/155) of samples. Amplification patterns included low-level (1.5–4 copies), high-level (>4 copies) and clustered signals. Frequencies by translocation subgroup were: PAX3::FOXO1 — 24.7% (25/101), PAX7::FOXO1 — 18.8% (3/16), PAX3::NCOA1 — 25% (1/4), fusion-negative — 17.6% (6/34). No statistically significant associations were found between CDK4 status and clinicopathologic or molecular parameters (p>0.05).
Conclusion. CDK4 amplification is a relatively common genomic event in ARMS; its clinical utility requires further molecular and functional validation.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.