medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLCmedgen-337Research ArticleКЛИНИЧЕСКИЕ СЛУЧАИCLINICAL CASEРедкие вариации числа копий ДНК: микродупликация 20p13 материнского происхождения у пациента с комплексным пороком сердца и аномалией бронховRare copy number variations: maternal microduplication 20p13 region in a patient with complex heart disease and bronchial anomalyСлепухинаА. А.SlepukhinaA. A.a.slepukhina@medgenetics.ruСкрябинН. А.SkryabinN. A.noemail@neicon.ruКашевароваА. А.KashevarovaA. A.noemail@neicon.ruНовиковаМ. А.NovikovaM. A.noemail@neicon.ruЛифшицГ. И.LifshitsG. I.noemail@neicon.ruЛебедевИ. Н.LebedevI. N.noemail@neicon.ruНаучно исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской Академии НаукРоссияResearch Institute of Medical Genetics of Tomsk National Research Medical Center; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine Siberian Branch of the Russian Academy of SciencesRussian FederationНаучно исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Национальный исследовательский Томский государственный университетРоссияResearch Institute of Medical Genetics of Tomsk National Research Medical Center; National Research Tomsk State UniversityRussian FederationСибирский федеральный биомедицинский исследовательский центр им. академика Е.Н. МешалкинаРоссияMeshalkin Siberian Federal Biomedical Research CenterRussian FederationИнститут химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской Академии НаукРоссияInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine Siberian Branch of the Russian Academy of SciencesRussian Federation20172002201816104750Copyright © Слепухина А.А., Скрябин Н.А., Кашеварова А.А., Новикова М.А., Лифшиц Г.И., Лебедев И.Н., 20182018Слепухина А.А., Скрябин Н.А., Кашеварова А.А., Новикова М.А., Лифшиц Г.И., Лебедев И.Н.Slepukhina A.A., Skryabin N.A., Kashevarova A.A., Novikova M.A., Lifshits G.I., Lebedev I.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/337

В работе представлены клинические данные и молекулярно-цитогенетическое описание редкой микродупликации в регионе 20p13 у пациентки с комплексным пороком сердца, аномалией бронхов, дисморфичными фенотипическими чертами, гидроцефалией. Материалы и методы. Пациентке в возрасте 4 месяцев, был проведен полногеномный анализ с использованием ДНК-микрочипов высокого разрешения SurePrint G3 Human Genome CGH+SNP Microarray Kit, 8 х 60K. Результаты. Унаследованная от матери микродупликация включает 46 генов. Фенотип пациентки и данные анамнеза могут быть частично объяснены входящими в перестройку генами. Дупликация генов GnRH-II, OXT у матери могла повлиять на преждевременное рождение ребенка. Гены EBF4 , CENPB , участвуют в процессах клеточного деления и миграции клеток, активации MAP-киназного пути, и таким образом могут быть вовлечены в эмбриогенез. Ген ADAM33 влияет на межклеточные взаимодействия в легких и возможно, связан с развитием брониальных аномалий у ребенка. Дальнейшее наблюдение за ребенком и обследование матери позволят уточнить влияние микродупликации 20p13 на фенотип.

This paper presents clinical data and molecular-cytogenetic description of rare microduplication 20p13 region in a patient with complex heart disease, bronchial anomaly, dysmorphic phenotypic traits, hydrocephalus. Materials and methods. A 4-month-old patient underwent a full-genomic analysis using high-resolution DNA microarrays SurePrint G3 Human Genome CGH + SNP Microarray Kit, 8 х 60K. Results. The microduplication inherited from the mother includes 46 genes. The patient’s phenotype and medical history can be partially explained by the genes involved in rearrangement. The duplication of the genes GnRH-II, OXT in the mother could affect the premature birth of the child. Genes EBF4, CENPB participate in the processes of cell division and cell migration, activation of the MAP-kinase pathway, and thus can be involved in embryogenesis. The gene ADAM33 influences the intercellular interactions in the lungs and is possibly associated with the development of bronchial abnormalities in the child. Further monitoring of the patient and a mother’s examination will make it possible to clarify the effect of microduplication 20p13 on the phenotype.

вариации числа копий повторовврожденные пороки сердцамикродупликация20p13GnRH-IIгонадотропин-рилизинг гормонCopy number variationscongenital heart defectsmicroduplication20p13GnRH-IIgonadotropin-releasing hormoneReferencesKearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011;13(7):680-5. doi:10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011;13(7):680-5. doi:10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.Fahed AC, Gelb BD, Seidman JG, Seidman CE. Genetics of congenital heart disease: the glass half empty. Circ Res. 2013;112(4):707-20. doi:10.1161/CIRCRESAHA.112.300853.Fahed AC, Gelb BD, Seidman JG, Seidman CE. Genetics of congenital heart disease: the glass half empty. Circ Res. 2013;112(4):707-20. doi:10.1161/CIRCRESAHA.112.300853.Lang RM, Bierig M, Devereux RB, и др. Рекомендации по количественной оценке структуры и функции камер сердца. Российский кардиологический журнал. 2012;3(95):3-28.Lang RM, Bierig M, Devereux RB, и др. Рекомендации по количественной оценке структуры и функции камер сердца. Российский кардиологический журнал. 2012;3(95):3-28.Слепухина АA, Кашеварова АА, Скрябин НА, Новикова МА, Лифшиц ГИ, Лебедев ИН. Алгоритм молекулярно-цитогенетической диагностики микроделеционных синдромов врожденных пороков развития. В: Методические рекомендации по медицинским технологиям диагностики и лечения хромосомных, орфанных и многофакторных заболеваний человека/ под редакцией проф. В.А. Степанова. Академизда. Новосибирск; 2016:175-194.Слепухина АA, Кашеварова АА, Скрябин НА, Новикова МА, Лифшиц ГИ, Лебедев ИН. Алгоритм молекулярно-цитогенетической диагностики микроделеционных синдромов врожденных пороков развития. В: Методические рекомендации по медицинским технологиям диагностики и лечения хромосомных, орфанных и многофакторных заболеваний человека/ под редакцией проф. В.А. Степанова. Академизда. Новосибирск; 2016:175-194.Wang X, Li W, Huang K, и др. Genetic variants in ADAM33 are associated with airway inflammation and lung function in COPD. BMC Pulm Med. 2014;14:173. doi:10.1186/1471-2466-14-173.Wang X, Li W, Huang K, и др. Genetic variants in ADAM33 are associated with airway inflammation and lung function in COPD. BMC Pulm Med. 2014;14:173. doi:10.1186/1471-2466-14-173.Robitaille G, Christin M-S, Clеment I, Senеcal J-L, Raymond Y. Nuclear autoantigen CENP-B transactivation of the epidermal growth factor receptor via chemokine receptor 3 in vascular smooth muscle cells. Arthritis Rheum. 2009;60(9):2805-16. doi:10.1002/art.24765.Robitaille G, Christin M-S, Clеment I, Senеcal J-L, Raymond Y. Nuclear autoantigen CENP-B transactivation of the epidermal growth factor receptor via chemokine receptor 3 in vascular smooth muscle cells. Arthritis Rheum. 2009;60(9):2805-16. doi:10.1002/art.24765.Martin MM, Vanzo RJ, Sdano MR, Baxter AL, South ST. Mosaic deletion of 20pter due to rescue by somatic recombination. Am J Med Genet Part A. 2016;170(1):243-248. doi:10.1002/ajmg.a.37407.Martin MM, Vanzo RJ, Sdano MR, Baxter AL, South ST. Mosaic deletion of 20pter due to rescue by somatic recombination. Am J Med Genet Part A. 2016;170(1):243-248. doi:10.1002/ajmg.a.37407.Ohlsson B. Gonadotropin-Releasing Hormone and Its Role in the Enteric Nervous System. Front Endocrinol (Lausanne). 2017;8:110. doi:10.3389/fendo.2017.00110.Ohlsson B. Gonadotropin-Releasing Hormone and Its Role in the Enteric Nervous System. Front Endocrinol (Lausanne). 2017;8:110. doi:10.3389/fendo.2017.00110.Mafra F, Mazzotti D, Pellegrino R, и др. Copy number variation analysis reveals additional variants contributing to endometriosis development. J Assist Reprod Genet. 2017;34(1):117-124. doi:10.1007/s10815-016-0822-1.Mafra F, Mazzotti D, Pellegrino R, и др. Copy number variation analysis reveals additional variants contributing to endometriosis development. J Assist Reprod Genet. 2017;34(1):117-124. doi:10.1007/s10815-016-0822-1.DiVasta AD, Laufer MR. The use of gonadotropin releasing hormone analogues in adolescent and young patients with endometriosis. Curr Opin Obstet Gynecol. 2013;25(4):287-292. doi:10.1097/GCO.0b013e32836343eb.DiVasta AD, Laufer MR. The use of gonadotropin releasing hormone analogues in adolescent and young patients with endometriosis. Curr Opin Obstet Gynecol. 2013;25(4):287-292. doi:10.1097/GCO.0b013e32836343eb.Firth HV. DECIPHER: Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans using Ensembl Resources. Am J Hum Genet. 2009;84:524-533.Firth HV. DECIPHER: Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans using Ensembl Resources. Am J Hum Genet. 2009;84:524-533.Гринберг КН, Кухаренко ВИ. Реализация фенотипического эффекта хромосомных аномалий у человека. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013;17(1):32-39.Гринберг КН, Кухаренко ВИ. Реализация фенотипического эффекта хромосомных аномалий у человека. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013;17(1):32-39.Fakhro KA, Choi M, Ware SM, и др. Rare copy number variations in congenital heart disease patients identify unique genes in left-right patterning. Proc Natl Acad Sci. 2011;108(7):2915-2920. doi:10.1073/pnas.1019645108.Fakhro KA, Choi M, Ware SM, и др. Rare copy number variations in congenital heart disease patients identify unique genes in left-right patterning. Proc Natl Acad Sci. 2011;108(7):2915-2920. doi:10.1073/pnas.1019645108.Hitz M-P, Lemieux-Perreault L-P, Marshall C, и др. Rare Copy Number Variants Contribute to Congenital Left-Sided Heart Disease. Spinner NB, ред. PLoS Genet. 2012;8(9):e1002903. doi:10.1371/journal.pgen.1002903.Hitz M-P, Lemieux-Perreault L-P, Marshall C, и др. Rare Copy Number Variants Contribute to Congenital Left-Sided Heart Disease. Spinner NB, ред. PLoS Genet. 2012;8(9):e1002903. doi:10.1371/journal.pgen.1002903.Priest JR, Girirajan S, Vu TH, Olson A, Eichler EE, Portman MA. Rare copy number variants in isolated sporadic and syndromic atrioventricular septal defects. Am J Med Genet Part A. 2012;158A(6):1279-1284. doi:10.1002/ajmg.a.35315.Priest JR, Girirajan S, Vu TH, Olson A, Eichler EE, Portman MA. Rare copy number variants in isolated sporadic and syndromic atrioventricular septal defects. Am J Med Genet Part A. 2012;158A(6):1279-1284. doi:10.1002/ajmg.a.35315.Lalani SR, Shaw C, Wang X, и др. Rare DNA copy number variants in cardiovascular malformations with extracardiac abnormalities. Eur J Hum Genet. 2013;21(2):173-81. doi:10.1038/ejhg.2012.155.Lalani SR, Shaw C, Wang X, и др. Rare DNA copy number variants in cardiovascular malformations with extracardiac abnormalities. Eur J Hum Genet. 2013;21(2):173-81. doi:10.1038/ejhg.2012.155.Xie L, Chen J-L, Zhang W-Z, и др. Rare De Novo Copy Number Variants in Patients with Congenital Pulmonary Atresia. Zwick ME, ред. PLoS One. 2014;9(5):e96471. doi:10.1371/journal.pone.0096471.Xie L, Chen J-L, Zhang W-Z, и др. Rare De Novo Copy Number Variants in Patients with Congenital Pulmonary Atresia. Zwick ME, ред. PLoS One. 2014;9(5):e96471. doi:10.1371/journal.pone.0096471.Weiss LA, Arking DE, Gene Discovery Project of Johns Hopkins & the Autism Consortium TGDP of JH the A, Daly MJ, Chakravarti A. A genome-wide linkage and association scan reveals novel loci for autism. Nature. 2009;461(7265):802-8. doi:10.1038/nature08490.Weiss LA, Arking DE, Gene Discovery Project of Johns Hopkins & the Autism Consortium TGDP of JH the A, Daly MJ, Chakravarti A. A genome-wide linkage and association scan reveals novel loci for autism. Nature. 2009;461(7265):802-8. doi:10.1038/nature08490.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.