medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLCmedgen-336Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHРезультаты использования новой медицинской технологии комплексной ДНК-диагностики ретинобластомыThe results of the use of new medical technology for comprehensive DNA analysis in retinoblastomaАлексееваЕ. А.AlekseevaE. A.ekater.alekseeva@gmail.comБабенкоО. В.BabenkoO. V.noemail@neicon.ruКозловаВ. М.KozlovaV. M.noemail@neicon.ruУшаковаТ. Л.UshakovaT. L.noemail@neicon.ruСаакянС. В.SaakyanS. V.noemail@neicon.ruТанасА. С.TanasA. S.noemail@neicon.ruНемцоваМ. В.NemtsovaM. V.noemail@neicon.ruСтрельниковВ. В.StrelnikovV. V.noemail@neicon.ruЗалетаевД. В.ZaletayevD. V.noemail@neicon.ruФГБНУ «Медико-генетический научный центр»РоссияResearch Centre for Medical Genetics; I.M. Sechenov First Moscow State Medical UniversityRussian FederationФГБНУ «Медико-генетический научный центр»РоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationФГБУ «Российский онкологический научный центр им. Н.Н. Блохина» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияN.N. Blockin Russian Research Center for OncologyRussian FederationФГБУ «Московский научно-исследовательский институт глазных болезней им. Гельмгольца» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияHelmholtz Moscow Research Institute of Eye DiseasesRussian FederationФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияResearch Centre for Medical Genetics; Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationФГБОУ ВПО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияI.M. Sechenov First Moscow State Medical UniversityRussian FederationФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияResearch Centre for Medical Genetics; I.M. Sechenov First Moscow State Medical University; Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian Federation20172002201816104146Copyright © Алексеева Е.А., Бабенко О.В., Козлова В.М., Ушакова Т.Л., Саакян С.В., Танас А.С., Немцова М.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., 20182018Алексеева Е.А., Бабенко О.В., Козлова В.М., Ушакова Т.Л., Саакян С.В., Танас А.С., Немцова М.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В.Alekseeva E.A., Babenko O.V., Kozlova V.M., Ushakova T.L., Saakyan S.V., Tanas A.S., Nemtsova M.V., Strelnikov V.V., Zaletayev D.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/336

Проведено комплексное молекулярно-генетическое обследование больных с ретинобластомой. Для диагностики заболевания использовалась внедренная в практическую деятельность ФГБНУ «МГНЦ» новая медицинская технология, включающая методы таргетного высокопроизводительного параллельного секвенирования ДНК и мультиплексной амплификации лигированных зондов (MLPA). Поиск точковый мутаций и коротких инсерций/делеций в гене RВ1 осуществляли с пременением секвенирования нового поколения на приборе Ion Torrent PGM. Для выявления протяженных делеций в гене RВ1 использовали метод MLPA. В группе пациентов с билатеральной формой ретинобластомы мутации в гене RB1 выявлены в 96,4% случаев. В выборке больных с односторонней формой заболевания генетические нарушения обнаружены у 31,7% пациентов. Методом MLPA выявлены соматические делеции в гене RВ1 в ДНК опухолей у 47,6% пациентов и герминальные делеции - у 4,4% больных.

We performed a comprehensive molecular genetic examination of patients with retinoblastoma. For establish molecular diagnosis of the disease, we applied a set of new medical technologies, including targeted high-throughput parallel DNA sequencing (NGS) and multiplex ligation probe amplification (MLPA). Search for point mutations and small indels in RB1 gene was carried out with next generation sequencing on the Ion Torrent PGM. To detect extended deletions in the RB1 gene MLPA method was used. In a group of patients with a bilateral form of the disease, mutations in the RB1 gene were detected in 96.4% of cases. In a sample of patients with a unilateral form of the disease, genetic abnormalities were found in 31.7% of patients. MLPA technique has allowed us to identify somatic deletions in the RB1 gene in tumors of 47.6% patients and germline deletions in 4.4% patients.

ретинобластомаген RB1медицинская технологиявысокопроизводительное параллельное секвенирование ДНКMLPAretinoblastomaRB1 genemedical technologyNGSMLPAReferencesLohmann DR, Gallie BL. Retinoblastoma. In GeneReviews [Internet]. 2000 Jul [Updated 2015 Nov].Lohmann DR, Gallie BL. Retinoblastoma. In GeneReviews [Internet]. 2000 Jul [Updated 2015 Nov].Kivela T. The epidemiological challenge of the most frequent eye cancer: retinoblastoma, an issue of birth and death. Br J Ophthalmol 2009; 93: 1129-1131.Kivela T. The epidemiological challenge of the most frequent eye cancer: retinoblastoma, an issue of birth and death. Br J Ophthalmol 2009; 93: 1129-1131.Козлова ВМ, Казубская ТП, Соколова ИН и др. Ретинобласома: диагностика и генетическое консультирование. 2015; 2(1): 30-38.Козлова ВМ, Казубская ТП, Соколова ИН и др. Ретинобласома: диагностика и генетическое консультирование. 2015; 2(1): 30-38.Dommering CJ, Mol BM, Moll AC et al. RB1 mutation spectrum in a comprehensive nationwide cohort of retinoblastoma patients. J. Med. Genet. 2014; 51; 366-374.Dommering CJ, Mol BM, Moll AC et al. RB1 mutation spectrum in a comprehensive nationwide cohort of retinoblastoma patients. J. Med. Genet. 2014; 51; 366-374.Quinonez-Silva G, Davalos-Salas M, Recillas-Targa F et al. Monoallelic germline methylation and sequence variant in thе promoter of the RB1 gene: a possible constitutive epimutatiom in hereditary retinoblastoma. Clin Epigenetics. 2016; 8:1.Quinonez-Silva G, Davalos-Salas M, Recillas-Targa F et al. Monoallelic germline methylation and sequence variant in thе promoter of the RB1 gene: a possible constitutive epimutatiom in hereditary retinoblastoma. Clin Epigenetics. 2016; 8:1.Li WL, Buckley J, Sanchez-Lara PA et al. A Rapid and Sensetive Next-Generation Sequencing Method to Detect RB1 Mutations Improves Care for Retinoblastoma Patients and Their Families. The J. of Molec. Diagnostics. 2016; 18(4): 480-493.Li WL, Buckley J, Sanchez-Lara PA et al. A Rapid and Sensetive Next-Generation Sequencing Method to Detect RB1 Mutations Improves Care for Retinoblastoma Patients and Their Families. The J. of Molec. Diagnostics. 2016; 18(4): 480-493.Babenko OV, Saakian SV, Brovkina AF et al. Spectrum and frequences of RB1 gene structural defects in retinoblastoma. Molecular Biology. 2002. 36(4): 487-492.Babenko OV, Saakian SV, Brovkina AF et al. Spectrum and frequences of RB1 gene structural defects in retinoblastoma. Molecular Biology. 2002. 36(4): 487-492.Valverde JR, Alonso J, Palacios et al. RB1 gene mutation up-date, a meta-analysis based on 932 reported mutations available in a searchable database. BMC Genet. 2005; 6: 53.Valverde JR, Alonso J, Palacios et al. RB1 gene mutation up-date, a meta-analysis based on 932 reported mutations available in a searchable database. BMC Genet. 2005; 6: 53.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.