medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2025.10.139-141medgen-3266Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTПоиск генетических маркеров ишемического инсульта посредством анализа ортологов генов крысы, дифференциально экспрессирующихся в условиях церебральной ишемииSearch for genetic markers of ischemic stroke by studying of human orthologues of rat genes expressed differentially in experimental brain ischemiaХрунинА. В.KhruninA. V.

123182, Москва, пл. Академика Курчатова, д. 2

2, Akademika Kurchatova sq., Moscow, 123182 

Khrunin_AV@nrcki.ruХворыхГ. В.KhvorykhG. V.

123182, Москва, пл. Академика Курчатова, д. 2

2, Akademika Kurchatova sq., Moscow, 123182 

ЛимборскаяС. А.LimborskaS. A.

123182, Москва, пл. Академика Курчатова, д. 2

115522, Москва, Россия, ул. Москворечье, д. 1 

2, Akademika Kurchatova sq., Moscow, 123182 

1, Moskvorechye st, Moscow,115522 

ФГБУ Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»РоссияNational Research Centre «Kurchatov Institute»Russian FederationФГБУ Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» ; ФГБНУ Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. БочковаРоссияNational Research Centre «Kurchatov Institute» ; Research Centre for Medical GeneticsRussian Federation2025241120252410139141Copyright © Хрунин А.В., Хворых Г.В., Лимборская С.А., 20252025Хрунин А.В., Хворых Г.В., Лимборская С.А.Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Limborska S.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3266

Несмотря на то, что уже известно несколько десятков генетических локусов, связанных с ишемическим инсультом, суммарно они описывают лишь около 2% фенотипической вариабельности у больных. Это указывает на необходимость продолжения исследований по поиску новых генетических факторов заболевания. В работе суммированы результаты применения разработанной нами технологии обработки транскриптомных данных, полученных в условиях моделирования церебрального инсульта у крыс, для поиска генов-кандидатов, ассоциированных с ишемическим инсультом у человека.

Although several dozen genetic loci have been associated with ischemic stroke, they describe only about 2% of the phenotypic variability in patients, indicating the potential for identifying additional genetic factors. The paper summarizes the results of applying our technology for processing transcriptomic data obtained under conditions of modeling cerebral stroke in rats to search for candidate genes associated with ischemic stroke in humans.

ишемический инсультполиморфизм ДНКгеном человекакрысиная модель ишемии мозгаischemic strokeDNA polymorphismhuman genomerat model of brain ischemiaРабота проведена в рамках выполнения государственного задания Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» (консолидация результатов исследований), а также при финансовой поддержке гранта Российского научного фонда № 23-14-00131 (биоинформатический анализ).The work was carried out within the state assignment of NRC «Kurchatov Institute» (consolidation of research results) and with financial support of the Russian Science Foundation, grant number 23-14-00131 (bioinformatic analysis).ReferencesMishra A., Malik R., Hachiya T. et al. Stroke genetics informs drug discovery and risk prediction across ancestries. Nature. 2022;611(7934):115-123. doi: 10.1038/s41586-022-05165-3Mishra A., Malik R., Hachiya T. et al. Stroke genetics informs drug discovery and risk prediction across ancestries. Nature. 2022;611(7934):115-123. doi: 10.1038/s41586-022-05165-3Khvorykh G., Khrunin A., Filippenkov I. et al. A Workflow for Selection of Single Nucleotide Polymorphic Markers for Studying of Genetics of Ischemic Stroke Outcomes. Genes (Basel). 2021;12(3):328. doi: 10.3390/genes12030328Khvorykh G., Khrunin A., Filippenkov I. et al. A Workflow for Selection of Single Nucleotide Polymorphic Markers for Studying of Genetics of Ischemic Stroke Outcomes. Genes (Basel). 2021;12(3):328. doi: 10.3390/genes12030328Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Rozhkova A.V. et al. Examination of Genetic Variants Revealed from a Rat Model of Brain Ischemia in Patients with Ischemic Stroke: A Pilot Study. Genes (Basel). 2021;12(12):1938. doi: 10.3390/genes12121938Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Rozhkova A.V. et al. Examination of Genetic Variants Revealed from a Rat Model of Brain Ischemia in Patients with Ischemic Stroke: A Pilot Study. Genes (Basel). 2021;12(12):1938. doi: 10.3390/genes12121938Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Arapova A.S. et al. The Study of the Association of Polymorphisms in LSP1, GPNMB, PDPN, TAGLN, TSPO, and TUBB6 Genes with the Risk and Outcome of Ischemic Stroke in the Russian Population. Int. J. Mol. Sci. 2023;24(7):6831. doi: 10.3390/ijms2407683Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Arapova A.S. et al. The Study of the Association of Polymorphisms in LSP1, GPNMB, PDPN, TAGLN, TSPO, and TUBB6 Genes with the Risk and Outcome of Ischemic Stroke in the Russian Population. Int. J. Mol. Sci. 2023;24(7):6831. doi: 10.3390/ijms2407683Dergunova L.V., Filippenkov I.B., Stavchansky V.V. et al. Genomewide transcriptome analysis using RNA-Seq reveals a large number of differentially expressed genes in a transient MCAO rat model. BMC Genomics. 2018:19(1):655. doi: 10.1186/s12864-018-5039-5Dergunova L.V., Filippenkov I.B., Stavchansky V.V. et al. Genomewide transcriptome analysis using RNA-Seq reveals a large number of differentially expressed genes in a transient MCAO rat model. BMC Genomics. 2018:19(1):655. doi: 10.1186/s12864-018-5039-5Luo J., Cai Y., Xiao P. et al. Inflammation-Derived and Clinical Indicator-Based Predictive Model for Ischemic Stroke Recovery. J Am Heart Assoc. 2024;13(15):e035609. doi: 10.1161/JAHA.124.035609Luo J., Cai Y., Xiao P. et al. Inflammation-Derived and Clinical Indicator-Based Predictive Model for Ischemic Stroke Recovery. J Am Heart Assoc. 2024;13(15):e035609. doi: 10.1161/JAHA.124.035609Kouchaki E., Babamohammadi A., Nikoueinejad H. et al. Association of Serum Levels of Pentraxin-3, M-ficolin, and Surfactant Protein A with the Severity of Ischemic Stroke. Iran. J. Allergy. Asthma. Immunol. 2017;16(2):140–146.Kouchaki E., Babamohammadi A., Nikoueinejad H. et al. Association of Serum Levels of Pentraxin-3, M-ficolin, and Surfactant Protein A with the Severity of Ischemic Stroke. Iran. J. Allergy. Asthma. Immunol. 2017;16(2):140–146.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.