medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2025.10.87-88medgen-3250Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTПолучение ДНК-библиотек для преимплантационного генетического тестирования на анеуплоидии из продукта полногеномной амплификации на основе амплификации с множественным замещением цепиProduction of DNA libraries for preimplantation genetic testing of aneuploidies using whole-genome amplification based on multiple-strand displacement amplificationЖигалинаД. И.ZhigalinaD. I.

634050, г. Томск, Россия, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050 

dasha_150291@mail.ruЖалсановаИ. Ж.ZhalsanovaI. Zh.

634050, г. Томск, Россия, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050 

ГосударкинаС. Н.GosudarkinaS. N.

634050, г. Томск, Россия, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050 

КанбековаО. Р.KanbekovaO. R.

634050, г. Томск, Россия, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050 

СкрябинН. А.SkryabinN. A.

634050, г. Томск, Россия, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050 

Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of SciencesRussian Federation20252411202524108788Copyright © Жигалина Д.И., Жалсанова И.Ж., Государкина С.Н., Канбекова О.Р., Скрябин Н.А., 20252025Жигалина Д.И., Жалсанова И.Ж., Государкина С.Н., Канбекова О.Р., Скрябин Н.А.Zhigalina D.I., Zhalsanova I.Z., Gosudarkina S.N., Kanbekova O.R., Skryabin N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3250

Введение. Амплификация с множественным замещением цепи (MDA) является наиболее предпочтительным методом полногеномной амплификации (ПГА) при проведении преимплантационного генетического тестирования (ПГТ) на моногенные заболевания (ПГТ-М).Цель: оценка возможности использования продукта ПГА на основе MDA для анализа анеуплоидий с помощью секвенирования нового поколения (NGS).Методы. Методом NGS был проанализирован продукт ПГА двух бластоцист человека. ПГА исследуемых образцов проводилась с помощью набора REPLI-g Mini (Qiagen). Подготовка ДНК-библиотек проводилась с использованием коммерческого набора реагентов SyntEra-DNA (Синтол). Биоинформатическая обработка данных производилась с использованием программы Genomenal (Novel Software Systems).Результаты. По результатам aCGH и NGS для бластоцист были получены молекулярные кариотипы, которые соответствовали друг другу с небольшими расхождениями.Заключение. Продукт ПГА, полученный на основе MDA, может быть успешно проанализирован методом NGS, что позволяет использовать один ампликон как для ПГТ на анеуплоидии (ПГТ-А), так и для ПГТ-М.

Background. Multiple strand displacement amplification (MDA) is the preferred method for whole genome amplification (WGA) in preimplantation genetic testing (PGT) for monogenic diseases (PGT-M).Objective. To investigate the potential of using MDA-based WGA products for aneuploidy analysis with next-generation sequencing (NGS).Methods. WGA products from two human blastocyst samples were analyzed using NGS. The WGA process was performed using the REPLi-g Mini Kit (Qiagen), and DNA libraries were generated using the SyntEra-DNA Reagent Kit (Syntol). Bioinformatics analysis was carried out using the Genomenal software (Novel Software Systems).Results. Based on aCGH and NGS results, molecular karyotypes were generated for blastocysts, which were consistent with minor discrepancies.Conclusions. The PGA product, obtained using MDA, can be successfully analyzed using NGS, allowing for the use of a single amplicon for both PGT-A and PGT-M applications.

секвенирование нового поколениябластоцистаMDAПГТ-АПГТ-Мnext-generation sequencingblastocystMDAPGT-APGT-MРабота выполнена в рамках государственного задания Минобрнауки России.The work was funded by a state assignment from the Ministry of Science and Higher Education of Russia.ReferencesСоловьёва Е.В., Склеймова М.М., Минайчева Л.И., и др. Проведение преимплантационного исследования спиноцеребеллярной атаксии первого типа. Медицинская генетика. 2022. 21(10):12-8.Soloveva E.V., Skleimova M.M., Minaycheva L.I., et al. Provedeniye preimplantatsionnogo issledovaniya spinotserebellyarnoy ataksii pervogo tipa [Preimplantation genetic testing for mucopolysaccharidosis type II: a case report. Meditsinskaya genetika [Medical Genetics]. 2022;21(10):12-18. (In Russ.)Borgström E., Paterlini M., Mold J.E., et al. Comparison of whole genome amplification techniques for human single cell exome sequencing. PLoS One. 2017;12(2):e0171566. DOI 10.1371/journal.pone.0171566.Borgström E., Paterlini M., Mold J.E., et al. Comparison of whole genome amplification techniques for human single cell exome sequencing. PLoS One. 2017;12(2):e0171566. DOI 10.1371/journal.pone.0171566.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.