<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">medgen</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Медицинская генетика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Medical Genetics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2073-7998</issn><publisher><publisher-name>Publishing House «Genius Media» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.25557/2073-7998.2025.10.52-54</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">medgen-3239</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКОЕ СООБЩЕНИЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>BRIEF REPORT</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Предиктивная эффективность анализа транскриптома для выявления генов-модификаторов на примере болезни Паркинсона, ассоциированной с мутациями в гене GBA1</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Predictive efficiency of transcriptome analysis for identifying modifier genes in Parkinson’s disease associated with GBA1 mutations</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Безрукова</surname><given-names>А. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bezrukova</surname><given-names>A. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>188350, г. Гатчина, микрорайон Орлова Роща, д. 1 </p><p>197101, г. Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, д. 6/8 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, mkr. Orlova roshcha, Gatchina, 188350 </p><p>6-8, L’va Tolstogo st., Saint Petersburg, 197022 </p></bio><email xlink:type="simple">bezrukova_ai@pnpi.nrcki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Башарова</surname><given-names>К. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Basharova</surname><given-names>K. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>188350, г. Гатчина, микрорайон Орлова Роща, д. 1 </p><p>197101, г. Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, д. 6/8 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, mkr. Orlova roshcha, Gatchina, 188350 </p><p>6-8, L’va Tolstogo st., Saint Petersburg, 197022 </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Милюхина</surname><given-names>И. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Miliukhina</surname><given-names>I. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>188350, г. Гатчина, микрорайон Орлова Роща, д. 1 </p><p>197376, г. Санкт-Петербург, ул. Академика Павлова, д.9 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, mkr. Orlova roshcha, Gatchina, 188350 </p><p>9, acad. Pavlova st., Saint Petersburg, 197022 </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Пчелина</surname><given-names>С. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pchelina</surname><given-names>S. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>188350, г. Гатчина, микрорайон Орлова Роща, д. 1 </p><p>197101, г. Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, д. 6/8 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, mkr. Orlova roshcha, Gatchina, 188350 </p><p>6-8, L’va Tolstogo st., Saint Petersburg, 197022 </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Усенко</surname><given-names>Т. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Usenko</surname><given-names>T. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>188350, г. Гатчина, микрорайон Орлова Роща, д. 1 </p><p>197101, г. Санкт-Петербург, ул. Льва Толстого, д. 6/8 </p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, mkr. Orlova roshcha, Gatchina, 188350 </p><p>6-8, L’va Tolstogo st., Saint Petersburg, 197022 </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» ; ФГБОУ ВО Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова Минздрава России</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Petersburg Nuclear Physics Institute named by B.P. Konstantinov of National Research Centre «Kurchatov Institute» ; First Pavlov State Medical University of St. Petersburg</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» ; Институт мозга человека им. Н.П. Бехтеревой РАН</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Petersburg Nuclear Physics Institute named by B.P. Konstantinov of National Research Centre «Kurchatov Institute» ;  Institute of the Human Brain RAS</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт» ; ФГБОУ ВО Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова Минздрава России</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Petersburg Nuclear Physics Institute named by B.P. Konstantinov of National Research Centre «Kurchatov Institute» ;First Pavlov State Medical University of St. Petersburg</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2025</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>24</day><month>11</month><year>2025</year></pub-date><volume>24</volume><issue>10</issue><fpage>52</fpage><lpage>54</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Безрукова А.И., Башарова К.С., Милюхина И.В., Пчелина С.Н., Усенко Т.С., 2025</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Безрукова А.И., Башарова К.С., Милюхина И.В., Пчелина С.Н., Усенко Т.С.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Bezrukova A.I., Basharova K.S., Miliukhina I.V., Pchelina S.N., Usenko T.S.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3239">https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3239</self-uri><abstract><p>Не у всех носителей мутаций в гене GBA1, кодирующий фермент глюкоцереброзидазу (GCase), развивается болезнь Паркинсона (БП) в течение жизни (GBA1-носители). Ранее нами в ходе анализа транскриптома клеток мозга мышиной модели паркинсонизма с дисфункцией GCase было показано изменение экспрессии генов, продукты которых регулируются путем PI3K/AKT/mTOR. В данном исследовании в ходе апробации результатов транскриптома ортогональным методом выявлена повышенная экспрессия гена DDIT4, вовлеченного в PI3K/AKT/mTOR, у GBA1-носителей по сравнению с пациентами с GBA1-ассоциированной БП в мононуклеарах периферической крови, что может рассматриваться как потенциальный модификатор БП у носителей мутаций в гене GBA1.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Not all GBA1-carriers develop Parkinson’s disease (PD) during their lifetime. Previously, we identified alterations in gene expression profile of the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway in the brain cells of mouse model of parkinsonism with GCase dysfunction by transcriptome analysis. In the current study orthogonal validation of transcriptome data revealed increased DDIT4 gene expression in peripheral blood mononuclear cells from GBA1-Carriers compared to GBA1-associated PD patients, that may be considered as a potential modifier of PD among carriers of mutations in the GBA1 gene.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>болезнь Паркинсона</kwd><kwd>GBA1</kwd><kwd>mTOR</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Parkinson’s disease</kwd><kwd>GBA1</kwd><kwd>mTOR</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="en">The research was carried out within the state assignment of Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation (theme №1023031500037-7-1.6.8;1.6.1;1.6.2;1.6.3).</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Usenko T., Bezrukova A., Rudenok M.M., et al. Whole Transcriptome Analysis of Substantia Nigra in Mice with MPTPInduced Parkinsonism Bearing Defective Glucocerebrosidase Activity. Int J Mol Sci. 2023; 24(15):12164.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Usenko T., Bezrukova A., Rudenok M.M., et al. Whole Transcriptome Analysis of Substantia Nigra in Mice with MPTPInduced Parkinsonism Bearing Defective Glucocerebrosidase Activity. Int J Mol Sci. 2023; 24(15):12164.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Chi J.H., Panner A., Cachola K., et al. Increased expression of the glioma-associated antigen ARF4L after loss of the tumor suppressor PTEN. Laboratory investigation. J Neurosurg. 2008;108(2):299-303.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chi J.H., Panner A., Cachola K., et al. Increased expression of the glioma-associated antigen ARF4L after loss of the tumor suppressor PTEN. Laboratory investigation. J Neurosurg. 2008;108(2):299-303.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Brugarolas J., Lei K., Hurley R.L., et al. Regulation of mTOR function in response to hypoxia by REDD1 and the TSC1/TSC2 tumor suppressor complex. Genes Dev. 2004;18(23):2893-904.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Brugarolas J., Lei K., Hurley R.L., et al. Regulation of mTOR function in response to hypoxia by REDD1 and the TSC1/TSC2 tumor suppressor complex. Genes Dev. 2004;18(23):2893-904.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mori S., Nada S., Kimura H., et al. The mTOR pathway controls cell proliferation by regulating the FoxO3a transcription factor via SGK1 kinase. PLoS One. 2014;9(2):e88891.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mori S., Nada S., Kimura H., et al. The mTOR pathway controls cell proliferation by regulating the FoxO3a transcription factor via SGK1 kinase. PLoS One. 2014;9(2):e88891.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Seo M.H., Kwon D., Kim S.H., Yeo S. Association between Decreased SGK1 and Increased Intestinal α-Synuclein in an MPTP Mouse Model of Parkinson’s Disease. Int J Mol Sci. 2023; 24(22): 16408.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Seo M.H., Kwon D., Kim S.H., Yeo S. Association between Decreased SGK1 and Increased Intestinal α-Synuclein in an MPTP Mouse Model of Parkinson’s Disease. Int J Mol Sci. 2023; 24(22): 16408.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
