medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2025.09.50-53medgen-3173Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTРазнонаправленная корреляция метилирования ДНК в различных регионах гена CARMN (MIR143HG) с экспрессией микроРНК кластера miR-143/145 в атеросклеротических бляшках сонных артерийDiscordant correlation of DNA methylation in different regions of the CARMN (MIR143HG) gene with expression of the miR-143/145 cluster in carotid atherosclerotic plaquesКоролёваЮ. А.KorolevaIu. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10 Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050

yuliya.koroleva@medgenetics.ruЗарубинА. А.ZarubinA. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10 

10 Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050

НазаренкоМ. С.NazarenkoM. S.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10 Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050

Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of SciencesRussian Federation2025131120252495053Copyright © Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Назаренко М.С., 20252025Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Назаренко М.С.Koroleva I.A., Zarubin A.A., Nazarenko M.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3173

При нарушении стабильности атеросклеротических бляшек (АСБ) сонных артерий отмечают изменение экспрессии микроРНК кластера miR-143/145. В некоторых тканях экспрессию кластера miR-143/145 регулирует изменение уровня метилирования промотора гена-хозяина CARMN (он же MIR143HG), однако возможно влияние метилирования в промоторах генов MIR143 и MIR145, приходящихся на «тело» гена CARMN. Как правило, для уровней экспрессии генов и метилирования в их промоторных регионах отмечается отрицательная корреляция. Целью работы был анализ связи экспрессии кластера микроРНК miR-143/145 с уровнем метилирования CpG-сайтов в гене CARMN в АСБ. ДНК и микроРНК для анализа выделены из АСБ пациентов с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (n=14). Анализ метилирования ДНК проведен на метилочипе, экспрессии микроРНК – методом microRNA-seq. Выявлена обратная корреляция экспрессии miR-145-3p и miR-143-3p с метилированием cg01726320, cg01558401 и cg26585864 в промоторе CARMN и прямая – с метилированием cg04317047, cg16684117 и cg21242144 в «теле» гена CARMN и в промоторах MIR143 и MIR145. Полученные результаты говорят о важной роли метилирования промотора генахозяина CARMN в регуляции экспрессии кластера miR-143/145 при атеросклеротическом поражении сонных артерий.

Impaired stability of carotid artery atherosclerotic plaques (CAAP) is associated with changes in miR-143/145 expression. In some tissues, the miR-143/145 expression is regulated by CARMN (MIR143HG) promoter methylation, however, it is possible that methylation in the promoters of the MIR143 and MIR145 genes, which are located in the CARMN gene body, may be influenced. As a rule, there is a negative correlation between methylation in promoter regions of genes and their expression. The aim of our study was to analyze the association of miR-143/145 expression with the methylation level of CpG sites in CARMN gene in CAAPs. DNA and microRNA for analysis were extracted from CAAPs of patients with advanced carotid atherosclerosis (n=14). DNA methylation analysis was performed by MethylChip, and microRNA expression was analyzed using the microRNA-seq method. We revealed an inverse correlation of miR-145-3p and miR-143-3p expression with methylation of cg01726320, cg01558401 and cg26585864 in the CARMN promoter and a direct correlation with methylation of cg04317047, cg16684117 and cg21242144 in the CARMN gene body and in the MIR143 and MIR145 promoters. These results suggest an important role of CARMN promoter methylation in the regulation of miR-143/145 expression in carotid atherosclerosis.

MIR143HGCARMNMIR143MIR145атеросклерозметилирование ДНКмикроРНКMIR143HGCARMNMIR143MIR145atherosclerosisDNA methylationmicroRNAРабота выполнена в рамках Государственного задания Министерства науки и высшего образования № 122020300041-7.The work was carried out within the framework of the State Assignment of the Ministry of Science and Higher Education No. 122020300041-7.ReferencesКоролёва Ю.А., Назаренко М.С., Кучер А.Н. Роль микроРНК в формировании нестабильности атеросклеротической бляшки. Биохимия. 2018; 83(1): 34-46.Koroleva Yu.A., Nazarenko M.S., Kucher A.N. Role of microRNA in development of instability of atherosclerotic plaque. Biokhimiya [Biochemistry]. 2018; 83(1): 34-46. (In Russ.)Riches K., Alshanwani A.R., Warburton P., et al. Elevated expression levels of miR-143/5 in saphenous vein smooth muscle cells from patients with Type 2 diabetes drive persistent changes in phenotype and function. J Mol Cell Cardiol. 2014; 74(100): 240-250.Riches K., Alshanwani A.R., Warburton P., et al. Elevated expression levels of miR-143/5 in saphenous vein smooth muscle cells from patients with Type 2 diabetes drive persistent changes in phenotype and function. J Mol Cell Cardiol. 2014; 74(100): 240-250.Ehrlich K.C., Lacey M., Ehrlich M. Tissue-specific epigenetics of atherosclerosis-related ANGPT and ANGPTL genes. Epigenomics. 2019; 11(2): 169-186.Ehrlich K.C., Lacey M., Ehrlich M. Tissue-specific epigenetics of atherosclerosis-related ANGPT and ANGPTL genes. Epigenomics. 2019; 11(2): 169-186.Huan T., Mendelson M., Joehanes R., et al. Epigenome-wide association study of DNA methylation and microRNA expression highlights novel pathways for human complex traits. Epigenetics. 2020; 15(1-2): 183-198.Huan T., Mendelson M., Joehanes R., et al. Epigenome-wide association study of DNA methylation and microRNA expression highlights novel pathways for human complex traits. Epigenetics. 2020; 15(1-2): 183-198.Deng J., Shoemaker R., Xie B., et al. Targeted bisulfite sequencing reveals changes in DNA methylation associated with nuclear reprogramming. Nat Biotechnol. 2009; 27(4): 353-360.Deng J., Shoemaker R., Xie B., et al. Targeted bisulfite sequencing reveals changes in DNA methylation associated with nuclear reprogramming. Nat Biotechnol. 2009; 27(4): 353-360.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.