medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLCmedgen-317Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHИзучение полиморфных вариантов генов 1 фазы биотрансформации ксенобиотиков у детей и подростков из г.Москвы и г.МинскаPolymorphism of xenobiotic metabolism genes in children from Moscow and MinskНовоселоваО. Г.NovoselovaO. G.noemail@neicon.ruПетроваН. В.PetrovaN. V.noemail@neicon.ruЧаковаН. Н.ChakovaN. N.noemail@neicon.ruКондратьеваЕ. И.KondratyevaE. I.noemail@neicon.ruВоловикН. О.VolovikN. O.noemail@neicon.ruБикановР. А.BikanovR. A.noemail@neicon.ruБобровничийВ. И.BobrovnichiyV. I.noemail@neicon.ruЗинченкоР. А.ZinchenkoR. A.renazinchenko@mail.ruМосква, РоссияРоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationГНУ «Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси»РоссияInstitute of Genetics and Cytology, Belarus National Academy of SciencesRussian FederationУО «Белорусский государственный медицинский университет»РоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationМосква, РоссияРоссияMoscow, RussiaRussian Federation2017200220181682731Copyright © Новоселова О.Г., Петрова Н.В., Чакова Н.Н., Кондратьева Е.И., Воловик Н.О., Биканов Р.А., Бобровничий В.И., Зинченко Р.А., 20182018Новоселова О.Г., Петрова Н.В., Чакова Н.Н., Кондратьева Е.И., Воловик Н.О., Биканов Р.А., Бобровничий В.И., Зинченко Р.А.Novoselova O.G., Petrova N.V., Chakova N.N., Kondratyeva E.I., Volovik N.O., Bikanov R.A., Bobrovnichiy V.I., Zinchenko R.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/317

В работе исследованы полиморфизмы генов CYP2C9 (1075A>C; I359L, rs1057910 и 430C>T; R144C, rs1799853), CYP2C19 (681G>A, rs4244285 и 636G>A; W212X, rs4986893), CYP2D6 (1846G>A, rs3892097), CYP3A4 (p.Met445Thr; c.1334T>C, rs4986910 и -392C>T, rs2740574) в выборках здоровых школьников: 70 из г. Москвы (Российская Федерация) и 100 из г. Минска (Республика Беларусь). Не выявлено статистически значимых различий частот аллелей и генотипов полиморфизма изученных генов первой фазы биотрансформации ксенобиотиков между сравниваемыми группами.

Polymorphic loci of genes CYP2C9 (1075A>C; I359L, rs1057910 и 430C>T; R144C, rs1799853), CYP2C19 (681G>A, rs4244285 и 636G>A; W212X, rs4986893), CYP2D6 (1846G>A, rs3892097), CYP3A4 (p.Met445Thr; c.1334T>C, rs4986910 и -392C>T, rs2740574) were studied in healthy schoolchildren: 70 from Moscow (Russian Federation) and 100 from Minsk (Republic of Belarus). Statistically significant differences of allele and genotype frequencies between two studied groups were not absent.

гены первой фазы системы биотрансформациицитохромы P450этнические особенности распределения частот аллелейgenes of the first phase biotransformation of xenobioticscytochrome P450 systemethnic peculiarities of the distribution of allele frequenciesReferencesGricman L, Vogel C, Pleiss J. Identification of universal selectivity-determining positions in cytochrome P450 monooxygenases by systematic sequence-based literature mining. Proteins. 2015 Sep;83(9):1593-603. doi:10.1002/prot.24840. PubMed PMID: 26033392.Gricman L, Vogel C, Pleiss J. Identification of universal selectivity-determining positions in cytochrome P450 monooxygenases by systematic sequence-based literature mining. Proteins. 2015 Sep;83(9):1593-603. doi:10.1002/prot.24840. PubMed PMID: 26033392.Abul-Husn NS, Owusu Obeng A, Sanderson SC, Gottesman O, Scott SA. Implementation and utilization of genetic testing in personalized medicine. Pharmgenomics Pers Med. 2014 Aug 13;7:227-40. doi: 10.2147/PGPM.S48887. Review. PubMed PMID: 25206309; PubMed Central PMCID: PMC4157398.Abul-Husn NS, Owusu Obeng A, Sanderson SC, Gottesman O, Scott SA. Implementation and utilization of genetic testing in personalized medicine. Pharmgenomics Pers Med. 2014 Aug 13;7:227-40. doi: 10.2147/PGPM.S48887. Review. PubMed PMID: 25206309; PubMed Central PMCID: PMC4157398.Cytochrome P450 2C9-CYP2C9. Van Booven D, Marsh S, McLeod H, Carrillo MW, Sangkuhl K, Klein TE, Altman RB Pharmacogenet Genomics. 2010 Apr; 20(4):277-81.Cytochrome P450 2C9-CYP2C9. Van Booven D, Marsh S, McLeod H, Carrillo MW, Sangkuhl K, Klein TE, Altman RB Pharmacogenet Genomics. 2010 Apr; 20(4):277-81.Scott SA, Sangkuhl K, Shuldiner AR, Hulot JS, Thorn CF, Altman RB, Klein TE. PharmGKB summary: very important pharmacogene information for cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19. Pharmacogenet Genomics. 2012 Feb;22(2):159-65. doi: 10.1097/FPC.0b013e32834d4962. PubMed PMID: 22027650;PubMed Central PMCID: PMC3349992.Scott SA, Sangkuhl K, Shuldiner AR, Hulot JS, Thorn CF, Altman RB, Klein TE. PharmGKB summary: very important pharmacogene information for cytochrome P450, family 2, subfamily C, polypeptide 19. Pharmacogenet Genomics. 2012 Feb;22(2):159-65. doi: 10.1097/FPC.0b013e32834d4962. PubMed PMID: 22027650;PubMed Central PMCID: PMC3349992.Werk AN, Cascorbi I. Functional gene variants of CYP3A4. Clin Pharmacol Ther. 2014 Sep;96(3):340-8. doi: 10.1038/clpt.2014.129. Review. PubMed PMID: 24926778.Werk AN, Cascorbi I. Functional gene variants of CYP3A4. Clin Pharmacol Ther. 2014 Sep;96(3):340-8. doi: 10.1038/clpt.2014.129. Review. PubMed PMID: 24926778.Lu C, Hatsis P, Berg C, Lee FW, Balani SK. Prediction of pharmacokinetic drug-drug interactions using human hepatocyte suspension in plasma and cytochrome P450 phenotypic data. II. In vitro-in vivo correlation with ketoconazole. Drug Metab. Dispos. 2008;36:1255-1260.Lu C, Hatsis P, Berg C, Lee FW, Balani SK. Prediction of pharmacokinetic drug-drug interactions using human hepatocyte suspension in plasma and cytochrome P450 phenotypic data. II. In vitro-in vivo correlation with ketoconazole. Drug Metab. Dispos. 2008;36:1255-1260.Kalow W. Ethnic differences in drug metabolism. Clin Pharmacokinet. 1982 Sep-Oct;7(5):373-400. Review. PubMed PMID: 6754206.Kalow W. Ethnic differences in drug metabolism. Clin Pharmacokinet. 1982 Sep-Oct;7(5):373-400. Review. PubMed PMID: 6754206.Mega JL, Close SL, Wiviott SD, Shen L, Hockett RD, et al. (2009) Cytochromep-450 polymorphisms and response to clopidogrel. N Engl J Med 360: 354-362.Mega JL, Close SL, Wiviott SD, Shen L, Hockett RD, et al. (2009) Cytochromep-450 polymorphisms and response to clopidogrel. N Engl J Med 360: 354-362.Luo HR, Poland RE, Lin KM, Wan YJ (2006) Genetic polymorphism of cytochrome P450 2C19 in Mexican Americans: a cross-ethnic comparative study. Clin Pharmacol Ther 80: 33-40.Luo HR, Poland RE, Lin KM, Wan YJ (2006) Genetic polymorphism of cytochrome P450 2C19 in Mexican Americans: a cross-ethnic comparative study. Clin Pharmacol Ther 80: 33-40.Корчагина Р. П. Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук. Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP2C9, CYP4F2, CYP2D6, GSTM1, GSTT1) и гена VKORC1 в популяции коренных этносов Северной Сибири. Генетика - 03.02.07 Новосибирск 2012Корчагина Р. П. Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук. Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP2C9, CYP4F2, CYP2D6, GSTM1, GSTT1) и гена VKORC1 в популяции коренных этносов Северной Сибири. Генетика - 03.02.07 Новосибирск 2012Giusti B, Gori AM, Marcucci R, Saracini C, Sestini I, et al. (2009) Relation of cytochrome P450 2C19 loss-of-function polymorphism to occurrence of drugeluting coronary stent thrombosis. Am J Cardiol 103: 806-811.Giusti B, Gori AM, Marcucci R, Saracini C, Sestini I, et al. (2009) Relation of cytochrome P450 2C19 loss-of-function polymorphism to occurrence of drugeluting coronary stent thrombosis. Am J Cardiol 103: 806-811.Bonello L, Armero S, Ait Mokhtar O, Mancini J, Aldebert P, et al. (2010) Clopidogrel loading dose adjustment according to platelet reactivity monitoring in patients carrying the 2C19*2 loss of function polymorphism. J Am Coll Cardiol 56: 1630-1636.Bonello L, Armero S, Ait Mokhtar O, Mancini J, Aldebert P, et al. (2010) Clopidogrel loading dose adjustment according to platelet reactivity monitoring in patients carrying the 2C19*2 loss of function polymorphism. J Am Coll Cardiol 56: 1630-1636.Петрова Н.В., Новоселова О.Г., Кондратьева Е.И., Биканов Р.А., Зинченко Р.А., Шерман В.Д. Влияние генов первой фазы биотрансформации ксенобиотиоа на течение муковисцидоза и ответ при проведении антибактериальной терапии. Медицинская генетика. 2016. Т. 15. № 10 (172). С. 17-24Петрова Н.В., Новоселова О.Г., Кондратьева Е.И., Биканов Р.А., Зинченко Р.А., Шерман В.Д. Влияние генов первой фазы биотрансформации ксенобиотиоа на течение муковисцидоза и ответ при проведении антибактериальной терапии. Медицинская генетика. 2016. Т. 15. № 10 (172). С. 17-24Чакова Н.Н., Михаленко Е.П., Крупнова Э.В., Чеботарева Н.В., Кругленко С.С., Золотухина С.Ф., Ковкова А.В. Генетический полиморфизм ферментов метаболизма лекарственных средств (CYP1A2, CYP2D6, CYP2C9, GST, NAT2 и MDR1) у жителей Беларуси // «Молекулярная и прикладная генетика»: сб. научн. тр. - 2009. - Т. 10. - С. 161-169.Чакова Н.Н., Михаленко Е.П., Крупнова Э.В., Чеботарева Н.В., Кругленко С.С., Золотухина С.Ф., Ковкова А.В. Генетический полиморфизм ферментов метаболизма лекарственных средств (CYP1A2, CYP2D6, CYP2C9, GST, NAT2 и MDR1) у жителей Беларуси // «Молекулярная и прикладная генетика»: сб. научн. тр. - 2009. - Т. 10. - С. 161-169.И.Л. Кляритская, Ю.С. Работягова Полиморфизм гена цитохрома CYP2C19 и клиническое значение его определения Крымский терапевтичний КТЖ 2013, №1, с 19-24]И.Л. Кляритская, Ю.С. Работягова Полиморфизм гена цитохрома CYP2C19 и клиническое значение его определения Крымский терапевтичний КТЖ 2013, №1, с 19-24]Chaudhry A.S., R. Kochhar K.K. Kohli Indian Genetic polymorphism of CYP2C19 and therapeutic response to proton pump inhibitors //J Med Res 127, June 2008, pp 521-530.Chaudhry A.S., R. Kochhar K.K. Kohli Indian Genetic polymorphism of CYP2C19 and therapeutic response to proton pump inhibitors //J Med Res 127, June 2008, pp 521-530.Bertilsson L. Geographical/interracial differences in polymorphic drug oxidation. Current state of knowledge of cytochromes P450 (CYP) 2D6 and 2C19. Clin Pharmacokinet. 1995 Sep;29(3):192-209. Review. PubMed PMID: 8521680.Bertilsson L. Geographical/interracial differences in polymorphic drug oxidation. Current state of knowledge of cytochromes P450 (CYP) 2D6 and 2C19. Clin Pharmacokinet. 1995 Sep;29(3):192-209. Review. PubMed PMID: 8521680.Lazaridis I, Patterson N, Mittnik A, Renaud G, Mallick S, Kirsanow K, Sudmant PH, Schraiber JG, Castellano S, Lipson M, Berger B, Economou C, Bollongino R, Fu Q, Bos KI, Nordenfelt S, Li H, de Filippo C, Prufer K, Sawyer S, Posth C, Haak W,Hallgren F, Fornander E, Rohland N, Delsate D, Francken M, Guinet JM, Wahl J, Ayodo G, Babiker HA, Bailliet G, Balanovska E, Balanovsky O, Barrantes R, Bedoya G, Ben-Ami H, Bene J, Berrada F, Bravi CM, Brisighelli F, Busby GB, Cali F, Churnosov M, Cole DE, Corach D, Damba L, van Driem G, Dryomov S, Dugoujon JM, Fedorova SA, Gallego Romero I, Gubina M, Hammer M, Henn BM, Hervig T, Hodoglugil U, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Khusainova R, Khusnutdinova E, Kittles R, Kivisild T, Klitz W, Kucinskas V, Kushniarevich A, Laredj L, Litvinov S, Loukidis T, Mahley RW, Melegh B, Metspalu E, Molina J, Mountain J, Nаkkаlаjаrvi K, Nesheva D, Nyambo T, Osipova L, Parik J, Platonov F, Posukh O, Romano V, Rothhammer F, Rudan I, Ruizbakiev R, Sahakyan H, Sajantila A, Salas A, Starikovskaya EB, Tarekegn A, Toncheva D, Turdikulova S, Uktveryte I, Utevska O, Vasquez R, Villena M, Voevoda M, Winkler CA, Yepiskoposyan L, Zalloua P, Zemunik T, Cooper A, Capelli C, Thomas MG, Ruiz-Linares A, Tishkoff SA, Singh L, Thangaraj K, Villems R, Comas D, Sukernik R, Metspalu M, Meyer M, Eichler EE, Burger J, Slatkin M, Pааbo S, Kelso J, Reich D, Krause J. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature. 2014 Sep 18;513(7518):409-13. doi: 10.1038/nature13673. PubMed PMID: 25230663; PubMedCentral PMCID: PMC4170574.Lazaridis I, Patterson N, Mittnik A, Renaud G, Mallick S, Kirsanow K, Sudmant PH, Schraiber JG, Castellano S, Lipson M, Berger B, Economou C, Bollongino R, Fu Q, Bos KI, Nordenfelt S, Li H, de Filippo C, Prufer K, Sawyer S, Posth C, Haak W,Hallgren F, Fornander E, Rohland N, Delsate D, Francken M, Guinet JM, Wahl J, Ayodo G, Babiker HA, Bailliet G, Balanovska E, Balanovsky O, Barrantes R, Bedoya G, Ben-Ami H, Bene J, Berrada F, Bravi CM, Brisighelli F, Busby GB, Cali F, Churnosov M, Cole DE, Corach D, Damba L, van Driem G, Dryomov S, Dugoujon JM, Fedorova SA, Gallego Romero I, Gubina M, Hammer M, Henn BM, Hervig T, Hodoglugil U, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Khusainova R, Khusnutdinova E, Kittles R, Kivisild T, Klitz W, Kucinskas V, Kushniarevich A, Laredj L, Litvinov S, Loukidis T, Mahley RW, Melegh B, Metspalu E, Molina J, Mountain J, Nаkkаlаjаrvi K, Nesheva D, Nyambo T, Osipova L, Parik J, Platonov F, Posukh O, Romano V, Rothhammer F, Rudan I, Ruizbakiev R, Sahakyan H, Sajantila A, Salas A, Starikovskaya EB, Tarekegn A, Toncheva D, Turdikulova S, Uktveryte I, Utevska O, Vasquez R, Villena M, Voevoda M, Winkler CA, Yepiskoposyan L, Zalloua P, Zemunik T, Cooper A, Capelli C, Thomas MG, Ruiz-Linares A, Tishkoff SA, Singh L, Thangaraj K, Villems R, Comas D, Sukernik R, Metspalu M, Meyer M, Eichler EE, Burger J, Slatkin M, Pааbo S, Kelso J, Reich D, Krause J. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature. 2014 Sep 18;513(7518):409-13. doi: 10.1038/nature13673. PubMed PMID: 25230663; PubMedCentral PMCID: PMC4170574.Preissner SC, Hoffmann MF, Preissner R, Dunkel M, Gewiess A, S Preissner polymorphic cytochrome P450 enzymes (CYPs) and their role in personalized therapy PLOS ONE www.plosone.org December 2013 Volume 8 Issue 12 e82562Preissner SC, Hoffmann MF, Preissner R, Dunkel M, Gewiess A, S Preissner polymorphic cytochrome P450 enzymes (CYPs) and their role in personalized therapy PLOS ONE www.plosone.org December 2013 Volume 8 Issue 12 e82562Gaikovitch EA, Cascorbi , Mrozikiewicz PM, Brockmоller J, Frоtschl R, Kоpke K, Gerloff T, Chernov JN, Roots I. Polymorphisms of drug-metabolizing enzymes CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP1A1, NAT2 and of P-glycoprotein in a Russian population. Eur J Clin Pharmacol. 2003 Aug;59(4):303-12.Gaikovitch EA, Cascorbi , Mrozikiewicz PM, Brockmоller J, Frоtschl R, Kоpke K, Gerloff T, Chernov JN, Roots I. Polymorphisms of drug-metabolizing enzymes CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP1A1, NAT2 and of P-glycoprotein in a Russian population. Eur J Clin Pharmacol. 2003 Aug;59(4):303-12.В.Г. Передерий, С.М. Ткач, С.В. Клименко Клиническое значение генетического полиморфизма CYP2C19 на примере метаболизма ИПП/ Здоровье Украины 2014, с 14-16 , www.healthua.comВ.Г. Передерий, С.М. Ткач, С.В. Клименко Клиническое значение генетического полиморфизма CYP2C19 на примере метаболизма ИПП/ Здоровье Украины 2014, с 14-16 , www.healthua.comА.Р. Халикова, А.А. Архипова, И.И. Ахметов, Р.А. Абдулхаков, С.Р. Абдулхаков Изучение полиморфизма гена цитохрома Р-450 CYP2C19 в популяции татар, проживающих на территории Республики Татарстан. Практическая медицина. - 2012. - № 3. - С. 53-55А.Р. Халикова, А.А. Архипова, И.И. Ахметов, Р.А. Абдулхаков, С.Р. Абдулхаков Изучение полиморфизма гена цитохрома Р-450 CYP2C19 в популяции татар, проживающих на территории Республики Татарстан. Практическая медицина. - 2012. - № 3. - С. 53-55Sim SC, Risinger C, Dahl ML, Aklillu E, Christensen M, Bertilsson L, and Ingelman-Sundberg M. A common novel CYP2C19 gene variant causes ultrarapid drug metabolism relevant for the drug response to proton pump inhibitors and antidepressants. // Clin Pharmacol Ther (2006) 79:103- 113.Sim SC, Risinger C, Dahl ML, Aklillu E, Christensen M, Bertilsson L, and Ingelman-Sundberg M. A common novel CYP2C19 gene variant causes ultrarapid drug metabolism relevant for the drug response to proton pump inhibitors and antidepressants. // Clin Pharmacol Ther (2006) 79:103- 113.Маев И.В., Момыналиев К.Т., Оганесян Т.С., Говорун В.М., Кучерявый Ю.А., Селезнева О.В. Полиморфизм гена цитохрома Р-450 в свете эффективности эрадикации Helicobacter pylori Клиническая медицина №2 2009. С 35-39.Маев И.В., Момыналиев К.Т., Оганесян Т.С., Говорун В.М., Кучерявый Ю.А., Селезнева О.В. Полиморфизм гена цитохрома Р-450 в свете эффективности эрадикации Helicobacter pylori Клиническая медицина №2 2009. С 35-39.Антоненко П.Б., Кресюн В.И. Эффективность лечения туберкулеза легких взависимости от генотипа CYP2C9 Дальневосточный медицинский журнал, 2014.-N 2.-С.31-34.Антоненко П.Б., Кресюн В.И. Эффективность лечения туберкулеза легких взависимости от генотипа CYP2C9 Дальневосточный медицинский журнал, 2014.-N 2.-С.31-34.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.