119192, г. Москва, Мичуринский пр-т, д. 15а
15А, Michurinsky Ave., Moscow, 119192
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1; 117997, г. Москва, ул. Профсоюзная, д. 86
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 115162; 86, Profsoyuznaya st., Moscow, 117997
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 115162
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1; 115522, г. Москва, ул. Москворечье, д.1; 119991, г. Москва, ул. Трубецкая, д. 8, стр. 2
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 115162;1, Moskvorechye st., Moscow, 115522; 8-2, Trubetskaya st., Moscow, 119991
115446, г. Москва, Коломенский пр-д, д. 4
4, Kolomensky lane., Moscow, 115446
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, д. 1, к. 1
p.1, Novogireevskaya str., Moscow, 111123
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 11516
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 115162
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 11516
115162, г. Москва, 4-й Рощинский пр., д. 20, стр. 1
20, s.1, 4-th Roshchinsky lane, Moscow, 115162
115446, г. Москва, Коломенский пр-д, д. 4
4, Kolomensky lane., Moscow, 115446
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, д. 1, к. 1
p.1, Novogireevskaya str., Moscow, 111123
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, д. 1, к. 1; 127006, г. Москва, ул. Долгоруковская, д. 4
p.1, Novogireevskaya str., Moscow, 111123; 4, Dolgorukovskaya st., Moscow, 127006
123423, г. Москва, ул. Саляма Адиля, д. 2
2, Salyama Adilya st., 2 Moscow, 12342
115446, г. Москва, Коломенский пр-д, д. 4
4, Kolomensky lane., Moscow, 115446
Актуальность. Синдром Линча относится к группе наследственных опухолевых синдромов и ассоциирован с повышенным риском развития колоректального рака и рака эндометрия, реже – опухолей других локализаций. Генетическое тестирование на выявление патогенных вариантов, связанных с синдромом Линча, предоставляет возможность для генетического консультирования не только самого пациента, но и членов семьи. Преимуществом генетической диагностики наследственных опухолевых синдромов для всех членов семьи являются профилактические мероприятия с целью ранней диагностики и предотвращения прогрессирования заболевания. Такое преимущество особенно важно для пациентов с отягощенным семейным анамнезом по онкологическим заболеваниям. Современные технологии секвенирования позволяют анализировать не только известные, но и выявлять новые ранее не описанные варианты, связанные с заболеванием.
Цель исследования. Представить клиническое описание и результаты молекулярно-генетической диагностики ранее не описанного вероятно патогенного варианта нуклеотидной последовательности в гене MLH1, обусловливающего синдром Линча.
Методы. Пробанду проведено полногеномное секвенирование с валидацией методом Сэнгера, родственникам пробанда – секвенирование по Сэнгеру.
Результаты. В представленном клиническом случае выявлен вероятно патогенный вариант в гене MLH1: chr3:37017551delT (hg38), в гетерозиготном состоянии, приводящий к аминокислотной замене p.Val279GlyfsTer18. Валидация выявленного вероятно патогенного варианта проведена секвенированием по Сэнгеру. Проведен анализ сегрегации.
Выводы. Использование высокопроизводительного секвенирования, в частности полногеномного, позволяет проанализировать всю последовательность кандидатных генов и выявлять редкие, в том числе ранее не описанные в научной литературе варианты, потенциально ассоциированные с развитием заболевания. Своевременное выявление каузативного варианта влияет на план лечения и наблюдения пациента, а также позволяет обследовать его родственников I-II степени родства с формированием рекомендаций по профилактике и скринингу возможных злокачественных новообразований.
Background. Lynch syndrome is a hereditary cancer syndrome associated with an increased risk of colorectal and endometrial cancer, as well as other, less common tumors. Identification of pathogenic variants, associated with Lynch syndrome, via genetic testing provides an opportunity of genetic counseling not just for the patient but also for their relatives. Genetic diagnostics for hereditary cancer syndromes in all family members has the advantage of enabling preventive measures for early diagnosis and further disease progression. This is particularly important for patients with a family cancer history. Current sequencing technologies allow analysis of not only known variants, but also previously undescribed ones.
Aim: to present a clinical case of Lynch syndrome caused by a previously undescribed likely pathogenic variant of the MLH1 gene.
Methods. The results of molecular diagnostics for the genetic cause of Lynch syndrome are presented. The proband underwent wholegenome sequencing, followed by Sanger sequencing. The proband’s relatives only underwent Sanger sequencing.
Results. The clinical case described shows a likely pathogenic variant in the MLH1 gene: chr3:37017551delT (hg38), p.Val279GlyfsTer18. Sanger sequencing was used for validation. Segregation analysis was carried out.
Conclusion. Next-generation sequencing, particularly whole-genome sequencing, allows for the analysis of all candidate genes and the identification of rare variants, including those that have not been described in the literature, that are potentially associated with disease. Timely identification of causative variants informs treatment and observation of patients. It also enables the examination of first- and second-degree relatives and provides recommendations for cancer prevention and screening.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.