<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">medgen</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Медицинская генетика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Medical Genetics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2073-7998</issn><publisher><publisher-name>Publishing House «Genius Media» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.25557/2073-7998.2025.06.59-61</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">medgen-3031</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКОЕ СООБЩЕНИЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>BRIEF REPORT</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Эпигенетический индекс стволовых клеток как прогностический маркер при раке молочной железы</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Epigenetic stem cell index as a prognostic marker in breast cancer</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Калинкин</surname><given-names>А. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kalinkin</surname><given-names>A. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>115522, Москва, ул. Москворечье, д.1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, Moskvorechye st., Moscow, 115522</p></bio><email xlink:type="simple">alexeika2@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сигин</surname><given-names>В. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sigin</surname><given-names>V. O.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>115522, Москва, ул. Москворечье, д.1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, Moskvorechye st., Moscow, 115522</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Николаева</surname><given-names>А. Ф.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nikolaeva</surname><given-names>A. F.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>115522, Москва, ул. Москворечье, д.1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, Moskvorechye st., Moscow, 115522</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ибрагимова</surname><given-names>М. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ibragimova</surname><given-names>M. K.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634009, Томск, пер. Кооперативный, д. 5</p></bio><bio xml:lang="en"><p>5, Kooperativny st., Tomsk, 634009</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Цыганов</surname><given-names>М. М.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Tsyganov</surname><given-names>M. M.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634009, Томск, пер. Кооперативный, д. 5</p></bio><bio xml:lang="en"><p>5, Kooperativny st., Tomsk, 634009</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Демко</surname><given-names>А. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Demko</surname><given-names>A. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>390026, Рязань, ул. Высоковольтная, д. 9</p></bio><bio xml:lang="en"><p>9, Vysokovol’tnaya st., Ryazan, 390026</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шомова</surname><given-names>М. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shomova</surname><given-names>M. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>390046, Рязань, ул. Спортивная, стр. 11</p></bio><bio xml:lang="en"><p>11, Sportivnaya st., Ryazan, 390046</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Силантьева</surname><given-names>Л. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Silantyeva</surname><given-names>L. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>390046, Рязань, ул. Спортивная, стр. 11</p></bio><bio xml:lang="en"><p>11, Sportivnaya st., Ryazan, 390046</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Виноградов</surname><given-names>И. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vinogradov</surname><given-names>I. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>390026, Рязань, ул. Высоковольтная, д. 9; 390046, Рязань, ул. Спортивная, стр. 11</p></bio><bio xml:lang="en"><p>9, Vysokovol’tnaya st., Ryazan, 390026; 11, Sportivnaya st., Ryazan, 390046</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-5"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Литвяков</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Litvyakov</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634009, Томск, пер. Кооперативный, д. 5</p></bio><bio xml:lang="en"><p>5, Kooperativny st., Tomsk, 634009</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Стрельников</surname><given-names>В. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Strelnikov</surname><given-names>V. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>115522, Москва, ул. Москворечье, д.1</p></bio><bio xml:lang="en"><p>1, Moskvorechye st., Moscow, 115522</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБНУ Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Research Centre for Medical Genetics</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт онкологии</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Cancer Research Institute Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО Рязанский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Ryazan State Medical University</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-4"><aff xml:lang="ru"><institution>ГБУ РО Областной клинический онкологический диспансер</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Regional Clinical Oncology Dispensary</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-5"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБОУ ВО Рязанский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова Министерства здравоохранения Российской Федерации; ГБУ РО Областной клинический онкологический диспансер</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Ryazan State Medical University; Regional Clinical Oncology Dispensary</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2025</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>21</day><month>08</month><year>2025</year></pub-date><volume>24</volume><issue>6</issue><fpage>59</fpage><lpage>61</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Калинкин А.И., Сигин В.О., Николаева А.Ф., Ибрагимова М.К., Цыганов М.М., Демко А.Н., Шомова М.В., Силантьева Л.Е., Виноградов И.И., Литвяков Н.В., Стрельников В.В., 2025</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Калинкин А.И., Сигин В.О., Николаева А.Ф., Ибрагимова М.К., Цыганов М.М., Демко А.Н., Шомова М.В., Силантьева Л.Е., Виноградов И.И., Литвяков Н.В., Стрельников В.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Kalinkin A.I., Sigin V.O., Nikolaeva A.F., Ibragimova M.K., Tsyganov M.M., Demko A.N., Shomova M.V., Silantyeva L.E., Vinogradov I.I., Litvyakov N.V., Strelnikov V.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3031">https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3031</self-uri><abstract><p>Опухоль молочной железы содержит различные виды клеток, в том числе раковые стволовые клетки (РСК), некоторая доля которых выживает после химиотерапии и приводит к рецидиву или метастазированию. Исходя из этого, целью исследования является оценить прогностический потенциал эпигенетического индекса стволовых клеток (ЭИСК). Для статистического анализа и деконволюции использовались 19 образцов рака молочной железы люминального В подтипа, полученные до проведения неоадъювантной химиотерапии (НАХТ). Сравнение образцов опухолей с последующим метастазированием и без показало статистически значимое (p &lt; 0,05) преобладание ЭИСК в образцах без метастазирования, а анализ кривых выживаемости – значимое увеличение (p&lt;0,05) безметастатической выживаемости у пациентов с высоким индексом. Полученные результаты позволяют использовать ЭИСК как прогностический маркер безметастатической выживаемости.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Breast tumor contains various cell types, including cancer stem cells, a small proportion of which survive chemotherapy and lead to recurrence or metastasis. With this in mind, the aim of the study is to evaluate the prognostic potential of the stem cell epigenetic index. 19 luminal B breast cancer samples were used for statistical analysis and deconvolution. Comparison of samples with and without metastasis showed a statistically significant (p &lt; 0.05) predominance of the index in samples without metastasis, and survival curve analysis showed a significant increase (p &lt; 0.05) in metastatic-free survival associated with high index. The results obtained allow using the epigenetic index of stem cells as a prognostic marker for metastasis-free survival.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>рак молочной железы</kwd><kwd>эпигенетика</kwd><kwd>выживаемость</kwd><kwd>прогностический маркер</kwd><kwd>стволовые клетки</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>breast cancer</kwd><kwd>epigenetics</kwd><kwd>survival</kwd><kwd>prognostic marker</kwd><kwd>stem cells</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Работа выполнена в рамках государственного задания Минобрнауки России для ФГБНУ «МГНЦ» на 2025 год. Высокопроизводительное секвенирование ДНК выполнено на оборудовании Центра коллективного пользования (ЦКП) «Геном» ФГБНУ МГНЦ.</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The work was carried out under the state assignment of the Ministry of Science and Higher Education of Russia for the Research Centre for Medical Genetics</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Lüönd F., Tiede S., Christofori G. Breast cancer as an example of tumour heterogeneity and tumour cell plasticity during malignant progression. British journal of cancer. 2021;125(2):164-175.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lüönd F., Tiede S., Christofori G. Breast cancer as an example of tumour heterogeneity and tumour cell plasticity during malignant progression. British journal of cancer. 2021;125(2):164-175.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Toh T. B., Lim J. J., Chow E. K. H. Epigenetics in cancer stem cells. Molecular cancer. 2017;16:1-20.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Toh T. B., Lim J. J., Chow E. K. H. Epigenetics in cancer stem cells. Molecular cancer. 2017;16:1-20.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sigin V.O., Kalinkin A.I., Kuznetsova E.B. et al. DNA methylation markers panel can improve prediction of response to neoadjuvant chemotherapy in luminal B breast cancer. Scientific Reports. 2020;10(1): 9239.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sigin V.O., Kalinkin A.I., Kuznetsova E.B. et al. DNA methylation markers panel can improve prediction of response to neoadjuvant chemotherapy in luminal B breast cancer. Scientific Reports. 2020;10(1): 9239.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
