medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2025.05.84-85medgen-2991Research ArticleКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯBRIEF REPORTСвязь аномалий метилирования ДНК с нарушением экспрессии белков в хорионе спонтанных абортусовAssociation of DNA methylation abnormalities with abnormal protein levels in the chorionic villi of spontaneous abortionsЗуевА. С.ZuevA. S.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

adenozinoph@yandex.ruШевцовД. Г.ShevtsovD. G.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

ВасильеваО. Ю.VasilyevaO. Yu.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

ДеменеваВ. В.DemenevaV. V.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

НикитинаТ. В.NikitinaT. V.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

СаженоваЕ. А.SazhenovaE. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

ТолмачеваЕ. Н.TolmachevaE. N.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

ВасильевС. А.VasilyevS. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Nab. Ushaiki, Tomsk, 634050, Russian Federation

Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетикиРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of SciencesRussian Federation2025300720252458485Copyright © Зуев А.С., Шевцов Д.Г., Васильева О.Ю., Деменева В.В., Никитина Т.В., Саженова Е.А., Толмачева Е.Н., Васильев С.А., 20252025Зуев А.С., Шевцов Д.Г., Васильева О.Ю., Деменева В.В., Никитина Т.В., Саженова Е.А., Толмачева Е.Н., Васильев С.А.Zuev A.S., Shevtsov D.G., Vasilyeva O.Y., Demeneva V.V., Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Tolmacheva E.N., Vasilyev S.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2991

Сходство механизмов патогенеза невынашивания беременности, преэклампсии, задержки роста плода и преждевременных родов в части аномальной плацентации предполагает существование общих паттернов метилирования для различных патологий. Поэтому целью работы стал сравнительный анализ аномалий метилирования ДНК и выявление их связи с экспрессией белков в ворсинах хориона спонтанных абортусов. Профили метилирования ДНК ворсин хориона при невынашивании беременности и указанных патологиях были получены методом бисульфитного секвенирования ограниченного набора локусов и из наборов данных Genome Expression Omnibus соответственно. Экспрессию генов определяли иммуногистохимией. Единственным общим гиперметилированным геном для рассматриваемых патологий оказался CLEC16A. Для спонтанных абортусов (СА) было выявлено 237 дифференциально-метилированных генов (ДМГ). Гены GLI3, EGFR, CMIP и PBRM1 дифференциально экспрессировались в ворсинах хориона при СА. Таким образом, значительное количество специфичных для СА ДМГ было связано с изменениями их экспрессии. Функции выявленных генов предполагают их роль в формировании летального фенотипа.

The similarity of pathogenesis mechanisms for pregnancy loss, preeclampsia, fetal growth restriction, and preterm birth due to abnormal placentation suggests the existence of common methylation patterns for various pathologies. Therefore, the aim of this study was to conduct a comparative analysis of DNA methylation abnormalities and their association with protein expression in chorionic villi from spontaneous abortions. The DNA methylation profiles of chorionic villi in cases of pregnancy loss and the aforementioned pathologies were obtained using reduced representation bisulfite sequencing and data sets from the Genome Expression Omnibus, respectively. Gene expression was determined by immunohistochemistry. The only commonly hypermethylated gene among the studied pathologies was CLEC16A. For spontaneous abortions (SA), 237 differentially methylated genes (DMGs) were identified. The GLI3, EGFR, CMIP, and PBRM1 genes showed differential expression in the chorionic villi of SA samples. Thus, a significant number of SA-specific DMGs were associated with changes in their expression. The functions of these identified genes suggest their role in the formation of lethal phenotypes.

спонтанный абортдифференциально метилированные геныакушерские синдромыворсины хорионаspontaneous abortiondifferentially methylated genesobstetric syndromeschorionic villiРабота выполнена при поддержке гранта РНФ №23-15-00341.This work was supported by grant No. 23-15-00341 from the Russian Science Foundation (RSF).ReferencesNorton C., Clarke D., Holmstrom J., et al. Altered Epigenetic Profiles in the Placenta of Preeclamptic and Intrauterine Growth Restriction Patients. Cells. 2023;12(8):1130.Norton C., Clarke D., Holmstrom J., et al. Altered Epigenetic Profiles in the Placenta of Preeclamptic and Intrauterine Growth Restriction Patients. Cells. 2023;12(8):1130.Vlahos A., Mansell T., Saffery R., Novakovic B. Human placental methylome in the interplay of adverse placental health, environmental exposure, and pregnancy outcome. PLoS Genet. 2019; 15(8): e1008236Vlahos A., Mansell T., Saffery R., Novakovic B. Human placental methylome in the interplay of adverse placental health, environmental exposure, and pregnancy outcome. PLoS Genet. 2019; 15(8): e1008236Wee P., Wang Z. Epidermal Growth Factor Receptor Cell Proliferation Signaling Pathways. Cancers (Basel). 2017;9(5):52.Wee P., Wang Z. Epidermal Growth Factor Receptor Cell Proliferation Signaling Pathways. Cancers (Basel). 2017;9(5):52.Yu X., Li L., Ning A., et al. Primary cilia abnormalities participate in the occurrence of spontaneous abortion through TGF-β/SMAD2/3 signaling pathway. J Cell Physiol. 2024;239(8):e31292.Yu X., Li L., Ning A., et al. Primary cilia abnormalities participate in the occurrence of spontaneous abortion through TGF-β/SMAD2/3 signaling pathway. J Cell Physiol. 2024;239(8):e31292.Ritter A., Roth S., Kreis N.N., et al. Primary Cilia in Trophoblastic Cells: Potential Involvement in Preeclampsia. Hypertension. 2020;76(5):1491-1505.Ritter A., Roth S., Kreis N.N., et al. Primary Cilia in Trophoblastic Cells: Potential Involvement in Preeclampsia. Hypertension. 2020;76(5):1491-1505.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.