350063, г. Краснодар, ул. имени Митрофана Седина, д. 4
4, Mitrofana Sedina st., Krasnodar, 350063
350063, г. Краснодар, ул. имени Митрофана Седина, д. 4
4, Mitrofana Sedina st., Krasnodar, 350063
350063, г. Краснодар, ул. имени Митрофана Седина, д. 4
4, Mitrofana Sedina st., Krasnodar, 350063
344037, г. Ростов-на-Дону, 14-я линия, 63
63, 14th line, Rostov-on-Don, 344037
344037, г. Ростов-на-Дону, 14-я линия, 63
63, 14th line, Rostov-on-Don, 344037
344037, г. Ростов-на-Дону, 14-я линия, 63
63, 14th line, Rostov-on-Don, 344037
Введение. Накопленные данные показывают, что микроРНК играют решающую роль практически во всех биологических и патофизиологических процессах, таких как дифференцировка клеток, регуляция клеточного цикла, липидный обмен, воспаление, неврологические, сердечно-сосудистые и метаболические расстройства и рак, включая меланому.
Цель: поиск ассоциации между полиморфными вариантами MIR146A (rs2910164), MIR758 (rs1885068), MIR33a (rs9620000) и риском развития меланомы.
Методы. В качестве материала для исследования использовали парафиновые блоки (FFPE) 82 лиц с меланомой и периферическую кровь 35 доноров контрольной группы. ДНК выделяли из срезов FFPE с помощью коммерческого набора QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (QIAGENE, Германия). Праймеры для ПЦР подбирали с помощью программы WASP. Геномную ДНК выделяли набором QIAamp DNA Blood mini kit (Qiagen, Germany). Генотипирование проводили методом аллель-специфичной ПЦР смесью qPCRmix –HS («Евроген» России) на приборе Real-time CFX96 Touch (США). Анализ равновесия Харди-Вайнберга и различия в распределении вариантов аллелей между группами пациентов и контроля оценивали с помощью критерия χ2. Для оценки риска развития меланомы использовали коэффициенты отношения шансов (ОШ).
Результаты. Установлено, что аллель A гена MIR146A (rs2910164) (ОШ = 2,24, 95% ДИ = 1,24–4,03; p=0,02) и генотип ТТ гена MIR33a (rs9620000) (ОШ = 2,98, 95% ДИ = 1,17–7,60; p=0,03) ассоциированы с повышенным риском развития меланомы. Наличие полиморфного аллеля гена MIR758 (rs1885068) не ассоциировано развитием меланомы.
Заключение. Таким образом, результаты исследования подчёркивают важность поиска диагностических биомаркеров в некодирующей области генома.
Introduction. Accumulated data show that microRNA plays a crucial role in almost all biological and pathophysiological processes, such as cell cycle regulation, cell differentiation, lipid metabolism, neurological, cardiovascular and metabolic diseases and cancer, including melanoma.
Aim: to search for associations between polymorphic variants MIR146A (rs2910164), MIR758 (rs1885068), MIR33a (rs9620000) and the risk of melanoma.
Methods. Paraffin blocks of 82 people with melanoma and peripheral blood of 35 donors of the control group were used as the material for the study. DNA was used from paraffin block sections (FFPE) using a commercial QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (QIAGENE, Germany). Primers for PCR were selected using the WASP program. Genomic DNA is popular with the QIAamp DNA Blood mini kit (Qiagen, Germany). Genotyping of animals using the allele-specific PCR mixture qPCRmix –HS (Eurogen, Russia) on the Real-time CFX96 Touch (USA). Analyze the Hardy-Weinberg equilibrium and differences in the distributed alleys of variants between experimental patients and control measurements using the χ2 criterion. To assess the risk of developing melanoma, we used odds ratios (OR).
Results. The study found that the allele A of the MIR146A gene (rs2910164) (OR = 2.24, 95% CI = 1.24–4.03; p = 0.02) and the TT genotype of the MIR33a gene (rs9620000) (OR = 2.98, 95% CI = 1.17–7.60); p = 0.03) are associated with an increased risk of melanoma. The presence of a polymorphic allele of the MIR758 gene (rs1885068) is not associated with the development of melanoma.
Conclusion. Thus, the results of the study emphasize the depth of the search for diagnostic biomarkers in the non-coding region of the genome.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.