medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2024.11.63-66medgen-2575Research ArticleКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯBRIEF REPORTКлинические проявления и инактивация Х-хромосомы в случае дупликации Xq22.3q25Clinical manifestations and X-chromosome inactivation in case of duplication of the Xq22.3q25 regionТолмачеваЕ. Н.TolmachevaE. N.

Толмачева Екатерина Николаевна

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

 Ekaterina N. Tolmacheva

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

КашевароваА. А.KashevarovaA. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

СухановаН. Н.SukhanovaN. N.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

АгафоноваА. А.AgafonovaA. А.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

МинайчеваЛ. И.MinaychevaL. I.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

ФоноваЕ. А.FonovaE. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

ВасильеваО. Ю.VasilyevaO. Yu.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

ФедотовД. А.FedotovD. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

ЛебедевИ. Н.LebedevI. N.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

ФГБНУ Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетикиРоссияTomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences, Research Institute of Medical GeneticsRussian Federation20240501202523116366Copyright © Толмачева Е.Н., Кашеварова А.А., Суханова Н.Н., Агафонова А.А., Минайчева Л.И., Фонова Е.А., Васильева О.Ю., Федотов Д.А., Лебедев И.Н., 20252025Толмачева Е.Н., Кашеварова А.А., Суханова Н.Н., Агафонова А.А., Минайчева Л.И., Фонова Е.А., Васильева О.Ю., Федотов Д.А., Лебедев И.Н.Tolmacheva E.N., Kashevarova A.A., Sukhanova N.N., Agafonova A.А., Minaycheva L.I., Fonova E.A., Vasilyeva O.Y., Fedotov D.A., Lebedev I.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2575

У большинства женщин патогенные варианты на Х-хромосоме не проявляются либо проявляются в ослабленной форме, поскольку они являются гетерозиготами по патогенному варианту и одна из Х-хромосом у женщин всегда инактивирована. Но 15–20% генов на Х-хромосоме человека избегают инактивации и экспрессируются с обеих хромосом. У пациентки в возрасте 11 лет с энцефалопатией сочетанного генеза и задержкой речевого развития стандартным цитогенетическим анализом была выявлена дупликация на длинном плече Х-хромосомы. С помощью хромосомного микроматричного анализа мы уточнили локализацию перестройки: arr[GRCh38] Xq22.3q25(104563898_122794771)х3. Дупликация имела размер 18 млн п.н. У пациентки наблюдалась экстремально асимметричная инактивация Х-хромосомы (95%). В районе дупликации локализовано 9 генов, избегающих инактивации. Избыточная доза гена ALG13, патогенные варианты в котором ассоциированы с энцефалопатией развития и эпилептической энцефалопатией 36, может быть причиной клинических симптомов у пациентки.

In most women, pathogenic variants on the X chromosome are not expressed or are expressed in a weakened form, since they are heterozygotes for the pathogenic variant and one of the X chromosomes in women is always inactivated. However, 15–20% of genes on the human X chromosome escape from inactivation and are expressed from both chromosomes. In an 11-year-old patient with encephalopathy of combined genesis and delayed speech development, a duplication on the long arm of the X chromosome was detected by standard cytogenetic analysis. Using chromosomal microarray analysis, we clarified the localization of the rearrangement: arr[GRCh38] Xq22.3q25(104563898_122794771)x3. The duplication have size of 18 Mb. The patient had extremely asymmetric inactivation of the X chromosome (95%). Nine genes that escape from inactivation are localized in the duplication region. An excessive dose of the ALG13 gene, pathogenic variants of which are associated with developmental encephalopathy and epileptic encephalopathy 36, may be the cause of the development of clinical symptoms in the patient.

дупликация Xq22.3q25инактивация Х-хромосомыгеныизбегающие инактивациихромосомный микроматричный анализXq22.3q25 duplicationX-chromosome inactivationgenes escape from inactivationchromosomal microarray analysisРабота выполнена при финансовой поддержке гранта РНФ № 21-65-00017.ReferencesMigeon B. R. X-linked diseases: susceptible females. Genet Med. 2020; 22:1156-1174. DOI: 10.1186/s13072-021-00386-8Migeon B. R. X-linked diseases: susceptible females. Genet Med. 2020; 22:1156-1174. DOI: 10.1186/s13072-021-00386-8Bradley P.B., Fornes O., Wasserman W. W., et al. Cross-species examination of X-chromosome inactivation highlights domains of escape from silencing. Epigenetics Chromatin. 2021 17;14;12. DOI: 10.1186/s13072-021-00386-8Bradley P.B., Fornes O., Wasserman W. W., et al. Cross-species examination of X-chromosome inactivation highlights domains of escape from silencing. Epigenetics Chromatin. 2021 17;14;12. DOI: 10.1186/s13072-021-00386-8Mutter G. L., Boynton K. A. PCR bias in amplification of androgen receptor alleles, a trinucleotide repeat marker used in clonality studies. Nucl. Acids Res. 1995. 23 : 1411–1418.Mutter G. L., Boynton K. A. PCR bias in amplification of androgen receptor alleles, a trinucleotide repeat marker used in clonality studies. Nucl. Acids Res. 1995. 23 : 1411–1418.Zito A., Roberts A. L., Visconti A., et al., Escape from X-inactivation in twins exhibits intra and inter-individual variability across tissues and is heritable. PLoS Genet. 2023: 19:e1010556. DOI: 10.1371/journal.pgen.1010556Zito A., Roberts A. L., Visconti A., et al., Escape from X-inactivation in twins exhibits intra and inter-individual variability across tissues and is heritable. PLoS Genet. 2023: 19:e1010556. DOI: 10.1371/journal.pgen.1010556https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/gene/2.11.24https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/gene/2.11.24Michaud J. L., Lachance M., Hamdan F. F., et al. The genetic landscape of infantile spasms. Hum. Molec. Genet. 2014. 23; 4846-4858. DOI: 10.1093/hmg/ddu199Michaud J. L., Lachance M., Hamdan F. F., et al. The genetic landscape of infantile spasms. Hum. Molec. Genet. 2014. 23; 4846-4858. DOI: 10.1093/hmg/ddu199

The authors declare that there are no conflicts of interest present.