<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">medgen</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Медицинская генетика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Medical Genetics</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2073-7998</issn><publisher><publisher-name>Publishing House «Genius Media» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.25557/2073-7998.2023.01.43-46</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">medgen-2242</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКОЕ СООБЩЕНИЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>BRIEF REPORT</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Анализ уровня метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Methylation level analysis of putative regulatory region of MIR100 gene in carotid atherosclerosis by targeted bisulfite sequencing</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Королёва</surname><given-names>Ю. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Koroleva</surname><given-names>I. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634050</p><p>ул. Набережная р. Ушайки, д. 10</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634050</p><p>10, Nab. r. Ushaiki</p><p>Tomsk</p></bio><email xlink:type="simple">yuliya.koroleva@medgenetics.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Зарубин</surname><given-names>А. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zarubin</surname><given-names>A. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634050</p><p>ул. Набережная р. Ушайки, д. 10</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634050</p><p>10, Nab. r. Ushaiki</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бабушкина</surname><given-names>Н. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Babushkina</surname><given-names>N. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634050</p><p>ул. Набережная р. Ушайки, д. 10</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634050</p><p>10, Nab. r. Ushaiki</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гомбоева</surname><given-names>Д. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gomboeva</surname><given-names>D. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634050</p><p>ул. Набережная р. Ушайки, д. 10</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634050</p><p>10, Nab. r. Ushaiki</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Муслимова</surname><given-names>Э. Ф.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Muslimova</surname><given-names>E. F.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634012</p><p>ул. Киевская, д. 111 а</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634012</p><p>111 a, Kyevskaya str.</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кузнецов</surname><given-names>М. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kuznetsov</surname><given-names>M. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634012</p><p>ул. Киевская, д. 111 а</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634012</p><p>111 a, Kyevskaya str.</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Козлов</surname><given-names>Б. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kozlov</surname><given-names>B. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634012</p><p>ул. Киевская, д. 111 а</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634012</p><p>111 a, Kyevskaya str.</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Назаренко</surname><given-names>М. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nazarenko</surname><given-names>M. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>634050</p><p>ул. Набережная р. Ушайки, д. 10</p><p>Томск</p></bio><bio xml:lang="en"><p>634050</p><p>10, Nab. r. Ushaiki</p><p>Tomsk</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Research Institute of Medical Genetics, Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>Научно-исследовательский институт кардиологии,&#13;
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Cardiology Research Institute, Tomsk National Research Medical Centre, Russian Academy of Sciences</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>10</day><month>04</month><year>2023</year></pub-date><volume>22</volume><issue>1</issue><fpage>43</fpage><lpage>46</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Бабушкина Н.П., Гомбоева Д.Е., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Бабушкина Н.П., Гомбоева Д.Е., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Koroleva I.A., Zarubin A.A., Babushkina N.P., Gomboeva D.E., Muslimova E.F., Kuznetsov M.S., Kozlov B.N., Nazarenko M.S.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2242">https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2242</self-uri><abstract><p>   В нестабильных атеросклеротических бляшках сонных артерий усиливается экспрессия микроРНК miR-100, что может быть связано с вариабельностью метилирования CpG-сайтов гена MIR100 и его регуляторных регионов.</p><p>   Целью работы был анализ связи уровня метилирования ДНК предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 (E-box) с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования.</p><p>   В качестве материала использовались ткани сосудов и лейкоциты крови пациентов с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (n = 19), а также лейкоциты периферической крови относительно здоровых индивидов (n = 18). В результате выявлена тканеспецифичность паттерна метилирования региона chr11:122,024,891-122,025,506 (сборка генома GRCh37/hg19), включающего E-box — уровень метилирования в непоражённых сонных артериях снижен по сравнению как с венами (p &lt; 0,001), так и с лейкоцитами периферической крови (p &lt; 0,007). При этом в атеросклеротических бляшках наблюдается значимое гипометилирование относительно непоражённых артерий, однако уровень метилирования ДНК в лейкоцитах крови пациентов с атеросклерозом не отличается от такового в лейкоцитах крови контрольной группы. Полученные результаты позволяют говорить о тканеспецифичности метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 (E-box) и о возможной его связи с атеросклеротическим поражением артерий, однако метилирование исследуемого региона нельзя применять в качестве диагностического биомаркера атеросклероза.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>   Expression of miR-100 is increased in unstable carotid atherosclerotic plaques. It can be associated with CpG sites methylation variability in the MIR100 gene region and its adjacent regulatory regions.</p><p>   The aim of our work was to analyze the association of DNA methylation level in the putative regulatory region of MIR100 gene with advanced carotid atherosclerosis using targeted bisulfite sequencing.</p><p>   We analyzed DNA samples of paired vessel tissues and blood leukocytes of patients with advanced atherosclerosis of the carotid arteries (n = 19), as well as blood leukocytes of healthy individuals (n = 18). As a result, we revealed tissue-specific methylation pattern of the chr11:122,024,891-122,025,506 region (GRCh37/hg19 genome assembly) including E-box (see Chen D. et al, 2014 for more information). The methylation level in unaffected carotid arteries was decreased compared to both veins (p &lt; 0.001) and peripheral blood leukocytes (p &lt; 0.007). Significant hypomethylation was observed in atherosclerotic carotid plaques relative to unaffected carotid arteries, but the level of DNA methylation in blood leukocytes of patients with atherosclerosis did not differ from that in blood leukocytes of the control group. Our findings suggest tissue-specific methylation of the putative regulatory region of MIR100 gene (E-box) and its possible association to atherosclerosis. Nevertheless, the methylation of the chr11:122,024,891-122,025,506 region cannot be used as a diagnostic biomarker of atherosclerosis.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>MIR100</kwd><kwd>атеросклероз</kwd><kwd>метилирование ДНК</kwd><kwd>микроРНК</kwd><kwd>сосуды</kwd><kwd>тканеспецифичность</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>MIR100</kwd><kwd>atherosclerosis</kwd><kwd>DNA methylation</kwd><kwd>microRNA</kwd><kwd>blood vessel</kwd><kwd>tissue specificity</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Работа выполнена в рамках Государственного задания Министерства науки и высшего образования №122020300041-7</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The work was carried out according to the State Order of the Ministry of Science and Higher Education No. 122020300041-7</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cipollone F., Felicioni L., Sarzani R. et al. A unique microRNA signature associated with plaque instability in humans. Stroke.2011; 42 (9): 2556-2563.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cipollone F., Felicioni L., Sarzani R. et al. A unique microRNA signature associated with plaque instability in humans. Stroke.2011; 42 (9): 2556-2563.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Maitrias P., Metzinger-Le Meuth V., Massy Z. A. et al. MicroRNA deregulation in symptomatic carotid plaque. Journal of vascular surgery.2015; 62 (5); 1245-1250.e1.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Maitrias P., Metzinger-Le Meuth V., Massy Z. A. et al. MicroRNA deregulation in symptomatic carotid plaque. Journal of vascular surgery.2015; 62 (5); 1245-1250.e1.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Morales S., Monzo M., Navarro A. Epigenetic regulation mechanisms of microRNA expression. Biomolecular concepts. 2017; 8 (5-6); 203-212.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Morales S., Monzo M., Navarro A. Epigenetic regulation mechanisms of microRNA expression. Biomolecular concepts. 2017; 8 (5-6); 203-212.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Chen D., Sun Y., Yuan Y. et al. miR-100 induces epithelial-mesen-chymal transition but suppresses tumorigenesis, migration and invasion. PLoS genetics. 2014; 10 (2); e1004177.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chen D., Sun Y., Yuan Y. et al. miR-100 induces epithelial-mesen-chymal transition but suppresses tumorigenesis, migration and invasion. PLoS genetics. 2014; 10 (2); e1004177.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
