medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2022.11.44-47medgen-2198Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTКомплексные геномные перестройки в этиологии «хромосомного фенотипа»Complex genomic rearrangements in etiology of the «chromosomal phenotype»МиньженковаМ. Е.MinzhenkovaM. E.maramin@mail.ruМарковаЖ. Г.MarkovaZ. G.noemail@neicon.ruЮрченкоД. А.YurchenkoD. A.noemail@neicon.ruТарлычеваА. А.TarlychevaA. A.noemail@neicon.ruМарковаТ. В.MarkovaT. V.noemail@neicon.ruСеменоваН. А.SemenovaN. A.noemail@neicon.ruМуртазинаА. Ф.MurtazinaA. F.noemail@neicon.ruКадышевВ. В.KadyshevV. V.noemail@neicon.ruГридинаМ. М.GridinaM. M.noemail@neicon.ruВеснаЭ. .ViesnáE. .noemail@neicon.ruФишманВ. С.FishmanV. S.noemail@neicon.ruШиловаН. В.ShilovaN. V.noemail@neicon.ruФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»РоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»; ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»РоссияFederal Research Center Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of Russian Academy of Sciences; Novosibirsk State UniversityRussian Federation20221301202321114447Copyright © Миньженкова М.Е., Маркова Ж.Г., Юрченко Д.А., Тарлычева А.А., Маркова Т.В., Семенова Н.А., Муртазина А.Ф., Кадышев В.В., Гридина М.М., Весна Э..., Фишман В.С., Шилова Н.В., 20232023Миньженкова М.Е., Маркова Ж.Г., Юрченко Д.А., Тарлычева А.А., Маркова Т.В., Семенова Н.А., Муртазина А.Ф., Кадышев В.В., Гридина М.М., Весна Э..., Фишман В.С., Шилова Н.В.Minzhenkova M.E., Markova Z.G., Yurchenko D.A., Tarlycheva A.A., Markova T.V., Semenova N.A., Murtazina A.F., Kadyshev V.V., Gridina M.M., Viesná E..., Fishman V.S., Shilova N.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2198

Представлены результаты молекулярно-генетического исследования четырех пациентов с комплексными геномными перестройками и «хромосомным фенотипом», который может включать нарушение интеллектуального развития и множественные врожденные пороки и аномалии развития. C целью выявления геномного дисбаланса и оценки влияния геномных перестроек на проявление фенотипических аномалий проведены FISH-исследование, ХМА и Hi-C у пациентов с «по-видимому» сбалансированными хромосомными перестройками. Идентификация геномного дисбаланса, его структуры и механизмов формирования в этих случаях позволяет охарактеризовать комплексные геномные перестройки в целом и оценить индивидуальные генетические риски в семье.

We present the results of a molecular-genetic study of 4 patients with complex genomic rearrangements and «chromosomal phenotype», which may include phenotype anomalies, intellectual disabilities, and multiple congenital abnormalities. FISH analysis, CMA and Hi-C were carried out in patients with “apparently” balanced chromosomal rearrangements associated with an abnormal phenotype to identify and estimate the genomic imbalance. The identification of the structure, mechanisms of formation and genomic imbalance in these cases allows us to characterize complex genomic rearrangements and assess individual genetic risks in the family.

комплексные геномные перестройкиХМАCNVFISHТАДHi-Ccomplex genomic rearrangementsCMAFISHCNVTADHi-CReferencesSchluth-Bolard C., Delobel B., Sanlaville D., et al. Cryptic genomic imbalances in de novo and inherited apparently balanced chromosomal rearrangements: array CGH study of 47 unrelated cases. Eur J Med Genet. 2009;52(5):291-296.Schluth-Bolard C., Delobel B., Sanlaville D., et al. Cryptic genomic imbalances in de novo and inherited apparently balanced chromosomal rearrangements: array CGH study of 47 unrelated cases. Eur J Med Genet. 2009;52(5):291-296.Zhang F., Carvalho C.M., Lupski J.R.Complex human chromosomal and genomic rearrangements. Trends Genet. 2009;25(7):298-307. doi:10.1016/j.tig.2009.05.005Zhang F., Carvalho C.M., Lupski J.R.Complex human chromosomal and genomic rearrangements. Trends Genet. 2009;25(7):298-307. doi:10.1016/j.tig.2009.05.005Gridina M., Mozheiko E., Valeev E., Nazarenko L.P., Lopatkina M.E., Markova Z.G., Yablonskaya M.I., Voinova V.Y., Shilova N.V., Lebedev I.N., Fishman V. A cookbook for DNase Hi-C. Epigenetics Chromatin. 2021 Mar 20;14(1):15. doi: 10.1186/s13072-021-00389-5.Gridina M., Mozheiko E., Valeev E., Nazarenko L.P., Lopatkina M.E., Markova Z.G., Yablonskaya M.I., Voinova V.Y., Shilova N.V., Lebedev I.N., Fishman V. A cookbook for DNase Hi-C. Epigenetics Chromatin. 2021 Mar 20;14(1):15. doi: 10.1186/s13072-021-00389-5.Feenstra I., Hanemaaijer N., Sikkema-Raddatz B., et al. Balanced into array: Genome-wide array analysis in 54 patients with an apparently balanced de novo chromosome rearrangement and a metaanalysis. Eur J Hum Genet. 2011;(19):1152-1160.Feenstra I., Hanemaaijer N., Sikkema-Raddatz B., et al. Balanced into array: Genome-wide array analysis in 54 patients with an apparently balanced de novo chromosome rearrangement and a metaanalysis. Eur J Hum Genet. 2011;(19):1152-1160.Higgins A.W. et al. Characterization of apparently balanced chromosomal rearrangements from the Developmental Genome Anatomy Project. Am J Hum Genet. 2008;82:712-722.Higgins A.W. et al. Characterization of apparently balanced chromosomal rearrangements from the Developmental Genome Anatomy Project. Am J Hum Genet. 2008;82:712-722.Lupia´n˜ez D.G., Kraft K., Heinrich V. et al. Disruptions of topological chromatin domains cause pathogenic rewiring of gene-enhancer interactions. Cell. 2015;161:1012-1025.Lupia´n˜ez D.G., Kraft K., Heinrich V. et al. Disruptions of topological chromatin domains cause pathogenic rewiring of gene-enhancer interactions. Cell. 2015;161:1012-1025.Aristidou K. et al., Position effect, cryptic complexity, and direct gene disruption as disease mechanisms in de novo apparently balanced translocation cases. PLoS ONE. 2018;13:10. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0205298Aristidou K. et al., Position effect, cryptic complexity, and direct gene disruption as disease mechanisms in de novo apparently balanced translocation cases. PLoS ONE. 2018;13:10. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0205298

The authors declare that there are no conflicts of interest present.