medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2022.11.19-22medgen-2192Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTОценка эффективности полногеномного неинвазивного пренатального тестирования для выявления редких хромосомных аномалий на основе опыта ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О. Отта»Evaluation of the whole-genome non-invasive prenatal testing effectiveness for detection of rare chromosomal abnormalities based on the Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology named after D.O.Ott experienceВашуковаЕ. С.VashukovaE. S.noemail@neicon.ruТарасенкоО. А.TarasenkoO. A.noemail@neicon.ruКозюлинаП. Ю.KozyulinaP. Yu.noemail@neicon.ruМоршневаА. В.MorshnevaA. V.noemail@neicon.ruМальцеваА. Р.MaltsevaA. R.noemail@neicon.ruГлотовА. С.GlotovA. S.anglotov@mail.ruФГБНУ «Институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта»; ООО «НИПТ»РоссияResearch Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology n.a. D.O. Ott; LLC «NIPT»Russian FederationООО «НИПТ»РоссияLLC «NIPT»Russian FederationФГБНУ «Институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта»РоссияResearch Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology n.a. D.O. OttRussian Federation20221301202321111922Copyright © Вашукова Е.С., Тарасенко О.А., Козюлина П.Ю., Моршнева А.В., Мальцева А.Р., Глотов А.С., 20232023Вашукова Е.С., Тарасенко О.А., Козюлина П.Ю., Моршнева А.В., Мальцева А.Р., Глотов А.С.Vashukova E.S., Tarasenko O.A., Kozyulina P.Y., Morshneva A.V., Maltseva A.R., Glotov A.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2192

Введение. Неинвазивное пренатальное тестирование (НИПТ) с использованием технологии полногеномного секвенирования ДНК, циркулирующей в крови беременной, является одним из самых эффективных методов для определения риска хромосомных аномалий у плода без инвазивных вмешательств. Данный тест помимо частых хромосомных аномалий позволяет выявлять редкие нарушения. Однако целесообразность использования полногеномного НИПТ для детекции редких хромосомных аномалий остается предметом дискуссий. Цель: оценить эффективность использования полногеномного НИПТ для выявления редких хромосомных аномалий у плода на основе опыта ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О. Отта». Методы. В период с декабря 2019 по май 2022 года с использованием технологии полногеномного секвенирования проанализированы образцы ДНК, выделенные из плазмы крови 4600 женщин с одноплодной беременностью. Результаты. В 182 (4,0%) случаях обнаружен высокий риск хромосомных аномалий у плода, из них 35 (19,2%) случаев составили редкие аномалии. Чаще встречались трисомии по хромосоме 16 (десять случаев), по хромосоме 19 (три случая), реже - трисомии по хромосомам 8, 9, 20, 10, 22 (по два случая), по хромосомам 2, 3, 4, 5, 11, 12, 14, 15 (по одному случаю), моносомии по хромосомам 21, 18 и 13 (по одному случаю), в одном случае - риск множественной анеуплоидии. Результаты подтверждающей инвазивной диагностики получены у 11 женщин, остальные пациенты отказались от инвазивных процедур. Выявленные аномалии подтверждены в 6 случаях (54,5%).

Background. Non-invasive prenatal testing (NIPT) using whole-genome sequencing of DNA circulating in the pregnant woman blood is one of the most effective method for determining the risk of fetal chromosomal abnormalities without invasive interventions. This test, in addition to frequent abnormalities, allows to identify rare pathologies. However, the feasibility of whole-genome NIPT for detection of rare chromosomal abnormalities remains a subject of debate. Aim: to evaluate the effectiveness of whole-genome NIPT for the detection of rare fetus chromosomal abnormalities based on the D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology experience. Methods. In the period from December 2019 to May 2022, DNA samples isolated from the blood plasma of 4,600 women with singleton pregnancies were analyzed using whole genome sequencing technology. Results. In 182 (4.0%) cases, a high risk of fetal chromosomal abnormalities was found, of which 35 (19.2%) cases were rare pathologies. More common were trisomy on chromosome 16 (ten cases), on chromosome 19 (in three cases), less often - trisomy on chromosomes 8, 9, 20, 10, 22 (in two cases), on chromosomes 2, 3, 4, 5, 11, 12, 14, 15 (one case each), monosomy on chromosomes 21, 18 and 13 (one case each), one case of multiple aneuploidy. The invasive diagnostic results were obtained for 11 women, other patients refused invasive procedures. The identified rare anomalies were confirmed in 6 cases (54.5%).

хромосомные аномалиинеинвазивное пренатальное тестированиетехнология полногеномного секвенированияchromosomal abnormalitiesnon-invasive prenatal testingwhole genome sequencing technologyReferencesКалашникова Е.А., Глотов А.С., Андреева Е.Н., Барков И.Ю., Бобровник Г.Ю., Дубровина Е.В., Жученко Л.А. Современное значение неинвазивного пренатального исследования внеклеточной ДНК плода в крови матери и перспективы его применения в системе массового скрининга беременных в Российской Федерации. Журнал акушерства и женских болезней. 2021;70(1):19-50. doi: https://doi.org/10.17816/JOWD56573Калашникова Е.А., Глотов А.С., Андреева Е.Н., Барков И.Ю., Бобровник Г.Ю., Дубровина Е.В., Жученко Л.А. Современное значение неинвазивного пренатального исследования внеклеточной ДНК плода в крови матери и перспективы его применения в системе массового скрининга беременных в Российской Федерации. Журнал акушерства и женских болезней. 2021;70(1):19-50. doi: https://doi.org/10.17816/JOWD56573Козюлина П.Ю., Вашукова Е.С., Глотов А.С., Баранов В.С., Гладких Н.А. Способ неинвазивного пренатального скрининга анеуплоидий плода. Номер патента: RU 02712175 C1. Дата публикации: 24.01.2020.Козюлина П.Ю., Вашукова Е.С., Глотов А.С., Баранов В.С., Гладких Н.А. Способ неинвазивного пренатального скрининга анеуплоидий плода. Номер патента: RU 02712175 C1. Дата публикации: 24.01.2020.Mardy A.H., Norton M.E. Diagnostic testing after positive results on cell free DNA screening: CVS or Amnio? Prenat Diagn. 2021;41(10):1249-1254. doi: 10.1002/pd.6021.Mardy A.H., Norton M.E. Diagnostic testing after positive results on cell free DNA screening: CVS or Amnio? Prenat Diagn. 2021;41(10):1249-1254. doi: 10.1002/pd.6021.Grati F.R., Bajaj K., Malvestiti F., Agrati C., Grimi B., Malvestiti B., Pompilii E., Maggi F., Gross S., Simoni G., Ferreira J. C. The type of feto-placental aneuploidy detected by cfDNA testing may influence the choice of confirmatory diagnostic procedure. Prenat Diagn. 2015;35(10):994-998. doi: 10.1002/pd.4659.Grati F.R., Bajaj K., Malvestiti F., Agrati C., Grimi B., Malvestiti B., Pompilii E., Maggi F., Gross S., Simoni G., Ferreira J. C. The type of feto-placental aneuploidy detected by cfDNA testing may influence the choice of confirmatory diagnostic procedure. Prenat Diagn. 2015;35(10):994-998. doi: 10.1002/pd.4659.Grati F.R., Ferreira J., Benn P., Izzi C., Verdi F., Vercellotti E., Dalpiaz C., D’Ajello P., Filippi E., Volpe N., Malvestiti F., Maggi F., Simoni G., Frusca T., Cirelli G., Bracalente G., Re A. L., Surico D., Ghi T., Prefumo F. Outcomes in pregnancies with a confined placental mosaicism and implications for prenatal screening using cell-free DNA. Genet Med. 2020;22(2):309-316. doi: 10.1038/s41436-019-0630-y.Grati F.R., Ferreira J., Benn P., Izzi C., Verdi F., Vercellotti E., Dalpiaz C., D’Ajello P., Filippi E., Volpe N., Malvestiti F., Maggi F., Simoni G., Frusca T., Cirelli G., Bracalente G., Re A. L., Surico D., Ghi T., Prefumo F. Outcomes in pregnancies with a confined placental mosaicism and implications for prenatal screening using cell-free DNA. Genet Med. 2020;22(2):309-316. doi: 10.1038/s41436-019-0630-y.Carvalheira G., Oliveira M. M., Takeno S., Lima F. T., Meloni V. A., Melaragno M.I. 19q13.33→qter trisomy in a girl with intellectual impairment and seizures. Meta Gene. 2014 Oct 27;2:799-806. doi: 10.1016/j.mgene.2014.09.004.Carvalheira G., Oliveira M. M., Takeno S., Lima F. T., Meloni V. A., Melaragno M.I. 19q13.33→qter trisomy in a girl with intellectual impairment and seizures. Meta Gene. 2014 Oct 27;2:799-806. doi: 10.1016/j.mgene.2014.09.004.Jung S.I., Cho H.S., Lee C.H., Kim K.D., Ha J.O., Kim M.K., Lee K.H., Hyun M.S. Two cases of trisomy 19 as a sole chromosomal abnormality in myeloid disorders. Korean J Lab Med. 2008 Jun;28(3):174-8. doi: 10.3343/kjlm.2008.28.3.174.Jung S.I., Cho H.S., Lee C.H., Kim K.D., Ha J.O., Kim M.K., Lee K.H., Hyun M.S. Two cases of trisomy 19 as a sole chromosomal abnormality in myeloid disorders. Korean J Lab Med. 2008 Jun;28(3):174-8. doi: 10.3343/kjlm.2008.28.3.174.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.