medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2022.10.43-45medgen-2163Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTРезультаты поиска редких мутаций при анализе всей последовательности гена PAHResults of the search for rare mutations in the analysis of the entire sequence of the PAH geneРяднинскаяН. В.RyadninskayaN. V.outremal@yandex.ruКузнецоваИ. А.KuznetsovaI. A.noemail@neicon.ruРыжковаО. П.RyzhkovaO. P.noemail@neicon.ruПоляковА. В.PolyakovA. V.noemail@neicon.ruФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»РоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian Federation20220812202221104345Copyright © Ряднинская Н.В., Кузнецова И.А., Рыжкова О.П., Поляков А.В., 20222022Ряднинская Н.В., Кузнецова И.А., Рыжкова О.П., Поляков А.В.Ryadninskaya N.V., Kuznetsova I.A., Ryzhkova O.P., Polyakov A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2163

Фенилкетонурия (ФКУ) - распространённое аутосомно-рецессивное наследственное нарушение работы фенилаланингидроксилазы, обусловленное патогеннными мутациями в гене PAH. После проведения рутинных методов генетического анализа остаётся примерно 2% пациентов с ФКУ, у которых не подтверждён диагноз. В данном исследовании был проведён поиск нуклеотидных замен в некодирующих и регуляторных областях гена PAH методом массового параллельного секвенирования. Был обнаружен вариант c.706+521G>C глубоко в интроне 6, который по программам предсказания влияет на сплайсинг гена PAH. Таким образом, данное исследование дополняет текущие данные о генотипах при ФКУ и показывает, что варианты, расположенные глубоко в интронах, могут являться причиной заболевания.

Phenylketonuria (PKU) is a common, autosomal recessive hereditary disorder of phenylalanine hydroxylase caused by pathogenic PAH gene variants. After routine genetic analysis methods were applied, approximately 2% of PKU patients were not diagnosed. In this study, the search of nucleotide replacements were performed in noncoding and regulatory regions of PAH gen via NGS.The variant c.706+521G>C was found deep in intron 6, which in silico predicted the effect on splicing of the PAH gene. Thereby this study supplements current knowledge of PAH genotypes and show that deep intronic analysis of PAH can genetically diagnose PKU.

фенилкетонурияPAHинтронный вариантмассовое параллельное секвенированиеphenylketonuriaPAHintronic variantNGSReferencesLi N., Jia H., Liu Z., Tao J., Chen S., Li X., Deng Y., Jin X., Song J., Zhang L., Liang Y., Wang W., Zhu J. Molecular characterisation of phenylketonuria in a Chinese mainland population using next-generation sequencing. Sci Rep. 2015 Oct 27;5:15769.Li N., Jia H., Liu Z., Tao J., Chen S., Li X., Deng Y., Jin X., Song J., Zhang L., Liang Y., Wang W., Zhu J. Molecular characterisation of phenylketonuria in a Chinese mainland population using next-generation sequencing. Sci Rep. 2015 Oct 27;5:15769.Yan Y.S., Yao F.X., Hao S.J., Zhang C., Chen X., Feng X., Yang T., Huang S.Z. [Analysis of large deletion of phenylalanine hydroxylase gene in Chinese patients with phenylketonuria]. Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 2016 Apr 12;96(14):1097-102. ChineseYan Y.S., Yao F.X., Hao S.J., Zhang C., Chen X., Feng X., Yang T., Huang S.Z. [Analysis of large deletion of phenylalanine hydroxylase gene in Chinese patients with phenylketonuria]. Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 2016 Apr 12;96(14):1097-102. ChineseJin X., Yan Y., Zhang C., Tai Y., An L., Yu X., Zhang L., Hao S., Cao X., Yin C., Ma X. Identification of novel deep intronic PAH gene variants in patients diagnosed with phenylketonuria. Hum Mutat. 2022 Jan;43(1):56-66.Jin X., Yan Y., Zhang C., Tai Y., An L., Yu X., Zhang L., Hao S., Cao X., Yin C., Ma X. Identification of novel deep intronic PAH gene variants in patients diagnosed with phenylketonuria. Hum Mutat. 2022 Jan;43(1):56-66.Gao J., Li X., Guo Y., Yu H., Song L., Fang Y., Yuan E., Shi Q., Zhao D., Yuan E., Zhang L. Identification of phenylketonuria patient genotypes using single-gene full-length sequencing. Hum Genomics. 2022 Jul 22;16(1):23. doi: 10.1186/s40246-022-00397-w.Gao J., Li X., Guo Y., Yu H., Song L., Fang Y., Yuan E., Shi Q., Zhao D., Yuan E., Zhang L. Identification of phenylketonuria patient genotypes using single-gene full-length sequencing. Hum Genomics. 2022 Jul 22;16(1):23. doi: 10.1186/s40246-022-00397-w.Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., и др. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2). Медицинская генетика. 2019;18(2):3-23. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2019.02.3-23Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., и др. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2). Медицинская генетика. 2019;18(2):3-23. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2019.02.3-23

The authors declare that there are no conflicts of interest present.