medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLCmedgen-191Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHМолекулярная патология хромосомного района 10q23.3-26.3 при глиобластомеMolecular pathology of the 10q23.3-26.3 chromosome region in glioblastomaАлексееваЕ. А.AlekseevaE. A.ekater.alekseeva@gmail.comТанасА. С.ThanasA. S.noemail@neicon.ruПрозоренкоЕ. В.ProzorenkoE. V.noemail@neicon.ruЗайцевА. М.ZaytsevA. M.noemail@neicon.ruКуржуповМ. И.KurzhupovM. I.noemail@neicon.ruКирсановаО. Н.KirsanovaO. N.noemail@neicon.ruРуденкоВ. В.RudenkoV. V.noemail@neicon.ruЗалетаевД. В.ZaletaevD. V.noemail@neicon.ruСтрельниковВ. В.StrelnikovV. V.noemail@neicon.ruФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. СеченоваРоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр»; «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. ПироговаРоссияResearch Centre for Medical Genetics; Pirogov Russian National Research Medical UniversityRussian FederationПервый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова; Российский онкологический научный центр им. Н.Н. БлохинаРоссияI.M. Sechenov First Moscow State Medical University; N.N. Blockin Russian Research Center for OncologyRussian FederationМосковский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. ГерцеРоссияP.A. Hertsen Research Centre for OncolologyRussian FederationФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр»РоссияResearch Centre for Medical GeneticsRussian FederationФедеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова; «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. ПироговаРоссияResearch Centre for Medical Genetics; Pirogov Russian National Research Medical University; I.M. Sechenov First Moscow State Medical UniversityRussian Federation20162601201715121422Copyright © Алексеева Е.А., Танас А.С., Прозоренко Е.В., Зайцев А.М., Куржупов М.И., Кирсанова О.Н., Руденко В.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В., 20172017Алексеева Е.А., Танас А.С., Прозоренко Е.В., Зайцев А.М., Куржупов М.И., Кирсанова О.Н., Руденко В.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В.Alekseeva E.A., Thanas A.S., Prozorenko E.V., Zaytsev A.M., Kurzhupov M.I., Kirsanova O.N., Rudenko V.V., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/191

Потеря гетерозиготности маркеров длинного плеча 10-й хромосомы (10q) - наиболее частое генетическое изменение при глиобластоме, выявляемое с частотой до 80% случаев. Методом микросателлитного анализа определена частота потери гетерозиготности в районе 10q23.3-26.3, содержащем гены-кандидаты PTEN, FGFR2, MKI67 и MGMT , в выборке 124 образцов глиобластомы. Частота потери гетерозиготности составила 62,1%. Для установления количественного изменения числа копий региона 10q23.3-26.3 в образцах с выявленной потерей гетерозиготности применяли количественный микросателлитный анализ в реальном времени. Методом количественного микросателлитного анализа было исследовано 64 образца глиобластомы с выявленной потерей гетерозиготности в районе 10q23.3-26.3. Определено, что в 37,5% случаев потеря гетерозиготности этого района при глиобластоме является отражением делеции, а в 25% случаев - отражением однородительской дисомии. В 37,5% опухолей участки делеции и однородительской дисомии чередуются на протяжении исследованного локуса, причём в его проксимальной части (гены PTEN, FGFR2 ) выше частота делеций, а в дистальной (ген MGMT ) - делеция и однородительская дисомия равновероятны.

Loss of heterozygosity on chromosome 10q is the most frequent genetic alteration in glioblastoma and occurs in up to 80% of cases. Using microsatellite analysis we have determined the frequency of loss of heterozygosity in the 10q23.3-26.3 chromosome region, containing candidate genes PTEN , FGFR2, MKI67 and MGMT , in 124 samples of glioblastoma. Frequency of loss of heterozygosity at the region under investigation equals 62.1%. We have used quantitative microsatellite analysis to establish a quantitative change of copy number of the 10q23.3-26.3 in 64 samples of glioblastoma with identified loss of heterozygosity in 10q23.3-26.3 area. In 37,5% of the samples only one copy of 10q23.3-26.3 chromosome region was found (deletion), in 25,0% two copies were detected (acquired uniparental disomy,). In 37,5% (24/64) of the samples areas of alternation of deletion and acquired uniparental disomy throughout the tested region were identified. Higher frequencies of deletions were characteristic for the proximal part of 10q23.3-26.3 region (PTEN and FGFR2 genes), while acquired uniparental disomy and deletion were equally in the distal part (MGMT gene).

глиобластомапотеря гетерозиготностиделецияоднородительская дисомияglioblastomaloss of heterozygositydeletionacquired uniparental disomyReferencesDunn GP, Rinne ML, Wykosky J et al. Emerging insights into the molecular and cellular basis of glioblastoma. Genes Dev. 2012;26(8):756-784.Dunn GP, Rinne ML, Wykosky J et al. Emerging insights into the molecular and cellular basis of glioblastoma. Genes Dev. 2012;26(8):756-784.Hutter A. Overview of Primary Brain Tumors: Pathologic Classification, Epidemiology, Molecular Biology, and Prognostic Markers. Hematol Oncol Clin North Am. 2012 Aug;26(4):715-732.Hutter A. Overview of Primary Brain Tumors: Pathologic Classification, Epidemiology, Molecular Biology, and Prognostic Markers. Hematol Oncol Clin North Am. 2012 Aug;26(4):715-732.Jesionek-Kupnicka D, Szybka M, Potemski P et al. Association of loss of heterozygosity with shorter survival in primary glioblastoma patients. Pol J Pathol. 2013 Dec;64(4):168-275.Jesionek-Kupnicka D, Szybka M, Potemski P et al. Association of loss of heterozygosity with shorter survival in primary glioblastoma patients. Pol J Pathol. 2013 Dec;64(4):168-275.Mizoguchi M, Kuga D, Guan Y et al. Loss of heterozygosity analysis in malignant gliomas. Brain Tumor Pathol. 2011 Jul; 28(3):191-196.Mizoguchi M, Kuga D, Guan Y et al. Loss of heterozygosity analysis in malignant gliomas. Brain Tumor Pathol. 2011 Jul; 28(3):191-196.Ohgaki H, Kleihues P. Genetic Pathways to Primary and Secondary Glioblastoma. Am J Pathol. 2007 May;170(5):1445-1453.Ohgaki H, Kleihues P. Genetic Pathways to Primary and Secondary Glioblastoma. Am J Pathol. 2007 May;170(5):1445-1453.Balesaria S, Brock C, Bower M et al. Loss of chromosome 10 is an independent prognostic factor in high-grade gliomas. Br J Cancer. 1999 Dec;81(8):1371-1377.Balesaria S, Brock C, Bower M et al. Loss of chromosome 10 is an independent prognostic factor in high-grade gliomas. Br J Cancer. 1999 Dec;81(8):1371-1377.Tada K, Shiraishi S, Kamiryo T. Analysis of loss of heterozygosity on chromosome 10 in patients with malignant astrocytic tumors: Correlation with patients age and survival. J. Neuroserg. 2001 Oct;95(4):651-659.Tada K, Shiraishi S, Kamiryo T. Analysis of loss of heterozygosity on chromosome 10 in patients with malignant astrocytic tumors: Correlation with patients age and survival. J. Neuroserg. 2001 Oct;95(4):651-659.Crespo I, Tao H, Nieto AB et al. Amplified and Homozygously Deleted Genes in Glioblastoma: Impact on Gene Expression Levels. PLoS One. 2012 Sep;7(9):e46088.Crespo I, Tao H, Nieto AB et al. Amplified and Homozygously Deleted Genes in Glioblastoma: Impact on Gene Expression Levels. PLoS One. 2012 Sep;7(9):e46088.Heroux MS, Chesnik MA, Halligan BD et al. Comprehensive characterization of glioblastoma tumor tissues for biomarker identification using mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics. Physiol Genomics. 2014 Jul 1;46(13):467-481.Heroux MS, Chesnik MA, Halligan BD et al. Comprehensive characterization of glioblastoma tumor tissues for biomarker identification using mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics. Physiol Genomics. 2014 Jul 1;46(13):467-481.Gupta K, Salunke P. Molecular markers of glioma: an update on recent progress and perspectives. J Cancer Res Clin Oncol. 2012 Dec;138(12):1971-1981.Gupta K, Salunke P. Molecular markers of glioma: an update on recent progress and perspectives. J Cancer Res Clin Oncol. 2012 Dec;138(12):1971-1981.Yang Y., Shao N, Luo G et al. Mutations of PTEN Gene in Gliomas Correlate to Tumor Differentiation and Short-term Survival Rate. Anticancer Res. 2010 Mar;30(3):P. 981-985.Yang Y., Shao N, Luo G et al. Mutations of PTEN Gene in Gliomas Correlate to Tumor Differentiation and Short-term Survival Rate. Anticancer Res. 2010 Mar;30(3):P. 981-985.Katoh M, Nakagama H. FGF Receptors: Cancer Biology and Therapeutics // Med Res Rev. 2014 Mar;34(2):280-300.Katoh M, Nakagama H. FGF Receptors: Cancer Biology and Therapeutics // Med Res Rev. 2014 Mar;34(2):280-300.Nakahara Y, Shiraishi T, Okamoto H et al. Detrended fluctuation analysis of genome-wide copy number profiles of glioblastomas using array-based comparative genomic hybridization. Neuro-Oncology. 2004 Oct;6(4):281-289.Nakahara Y, Shiraishi T, Okamoto H et al. Detrended fluctuation analysis of genome-wide copy number profiles of glioblastomas using array-based comparative genomic hybridization. Neuro-Oncology. 2004 Oct;6(4):281-289.Ader I, Delmas C, Skuli N et al. Preclinical evidence that SSR128129E - A novel small-molecule multi-fibroblast growth factor receptor blocker - Radiosensitises human glioblastoma. Eur J Cancer. 2014 Sep;50(13):2351-2359.Ader I, Delmas C, Skuli N et al. Preclinical evidence that SSR128129E - A novel small-molecule multi-fibroblast growth factor receptor blocker - Radiosensitises human glioblastoma. Eur J Cancer. 2014 Sep;50(13):2351-2359.Arshad H, Ahmad Z, Hasan SH. Gliomas: correlation of histologic grade, Ki67 and p53 expression with patient survival. Asian Pac J Cancer Prev. 2010;11(6):1637-1640.Arshad H, Ahmad Z, Hasan SH. Gliomas: correlation of histologic grade, Ki67 and p53 expression with patient survival. Asian Pac J Cancer Prev. 2010;11(6):1637-1640.Hegi ME, Liu L, Herman JG et al. Correlation of O6-Methylguanine Methyltransferase (MGMT) Promoter Methylation With Clinical Outcomes in Glioblastoma and Clinical Strategies to Modulate MGMT Activity. J Clin Oncol. 2008 Sep 1;26(25):4189-4199.Hegi ME, Liu L, Herman JG et al. Correlation of O6-Methylguanine Methyltransferase (MGMT) Promoter Methylation With Clinical Outcomes in Glioblastoma and Clinical Strategies to Modulate MGMT Activity. J Clin Oncol. 2008 Sep 1;26(25):4189-4199.Стрельников ВВ, Малышева АС, Шубина МВ и др. Делеции области расположения гена MGMT на хромосоме 10q26.3. Молекулярная медицина. 2011;(2):28-31.Стрельников ВВ, Малышева АС, Шубина МВ и др. Делеции области расположения гена MGMT на хромосоме 10q26.3. Молекулярная медицина. 2011;(2):28-31.Ginzinger DG, Godfrey TE, Nigro J et al. Measurement of DNA Copy Number at Microsatellite Loci Using Quantitative PCR Analysis. Cancer Res. 2000 Oct;60(19):5405-5409.Ginzinger DG, Godfrey TE, Nigro J et al. Measurement of DNA Copy Number at Microsatellite Loci Using Quantitative PCR Analysis. Cancer Res. 2000 Oct;60(19):5405-5409.Nigro JM, Takahashi MA, Ginzinger DG et al. Detection of 1p and 19q Loss in Oligodendroglioma by Quantitative Microsatellite Analysis, a Real-Time Quantitative Polymerase Chain Reaction Assay. Am J Pathol. 2001 Apr;158(4):1253-1262.Nigro JM, Takahashi MA, Ginzinger DG et al. Detection of 1p and 19q Loss in Oligodendroglioma by Quantitative Microsatellite Analysis, a Real-Time Quantitative Polymerase Chain Reaction Assay. Am J Pathol. 2001 Apr;158(4):1253-1262.Алексеева Е.А., Танас А.С., Прозоренко Е.В. и др. Анализ аллельного дисбаланса при глиобластоме: новые хромосомные участки потери гетерозиготности и новые гены-кандидаты. Медицинская генетика. 2014;(11):41-46.Алексеева Е.А., Танас А.С., Прозоренко Е.В. и др. Анализ аллельного дисбаланса при глиобластоме: новые хромосомные участки потери гетерозиготности и новые гены-кандидаты. Медицинская генетика. 2014;(11):41-46.Knudson AG. Mutation and cancer: statistical study of retinoblastoma. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1971 Apr.;68(4): 820-823.Knudson AG. Mutation and cancer: statistical study of retinoblastoma. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1971 Apr.;68(4): 820-823.Yin D, Ogawa S, Kawamata N et al. High Resolution Genomic Copy Number Profiling of Glioblastoma Multiforme by Single Nucleotide Polymorphism DNA Microarray.Mol. Cancer Res. 2009 May; 7(5): 665-677.Yin D, Ogawa S, Kawamata N et al. High Resolution Genomic Copy Number Profiling of Glioblastoma Multiforme by Single Nucleotide Polymorphism DNA Microarray.Mol. Cancer Res. 2009 May; 7(5): 665-677.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.