Пространственная организация хроматина важна для нормального функционирования клетки. На архитектуру ядра влияют размеры отдельных фрагментов генома, которые коррелируют с числом копий этих фрагментов. Перемещение локусов 1q12 от поверхности ядра в центральные области является ключевой стадией адаптивного ответа клетки на стресс. Мы предположили, что размер локусов 1q12, который коррелирует с содержанием повтора f-SatIII, может влиять на перемещение этих участков хроматина в ядре. Методом FISH на выделенных лимфоцитах показали, что в контроле локусы 1q12 расположены вблизи поверхности ядра, в ядрах лимфоцитов больных шизофренией (БШ) и облученных контрольных клеток локусы 1q12 расположены в центральных районах ядра. Длительное культивирование облученных лимфоцитов сопровождалось гибелью клеток, и снижением содержания f-SatIII в ДНК. Очевидно, что погибали клетки с большим размером 1q12 (много f-SatIII), обогащая популяцию клетками с низким содержанием f-SatIII. В клетках БШ и в облученных клетках мы обнаружили повышение уровня РНК SATIII. Размеры гетерохроматина 1q12 в клетках человека могут влиять на процессы пролиферации и ответа клетки на стресс. Количественный полиморфизм тандемных повторов генома - один из эпигенетических механизмов регуляции ответа клеток на окислительный стресс.
The spatial organization of chromatin is important for the normal functioning of the cell. Genome repeat cluster sizes can affect the chromatin spatial configuration and function. The 1q12 heterochromatin loci movement from the periphery to the center of the nucleus is the cells’ universal response to various types of stress. We hypothesized that a large 1q12 domain could affect chromatin movement, thereby inhibiting adaptive response (AR). Using the FISH method, we shown that in the control, 1q12 loci are located near the surface of the nucleus; in the lymphocyte nuclei of schizophrenic patients and irradiated control cells, 1q12 loci are located in the central regions of the nucleus. During prolonged cultivation, the irradiated cells with a large Large f-SatIII amount die and the population is enriched with the cells with low f-SatIII content. In intact SZ patients’ lymphocytes and in irradiated cells we found an increase in SATIII RNA levels. The size of heterochromatin 1q12 loci in human cells can affect to the proliferation and cells’ adaptive response to stress. Quantitative polymorphism of tandem genome repeats is one of the epigenetic mechanisms of genome expression’s regulation.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.