medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.1234/XXXX-XXXX-2016-4-50-52medgen-119Research ArticleМЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ МЕДИЦИНСКОЙ ГЕНЕТИКИ», 29-30 СЕНТЯБРЯ 2016 Г., Г.ТОМСКАссоциация полиморфного варианта сайта связывания микроРНК rs10491534 гена TSC1 с тяжестью течения рака почкиAssociation of microRNA target site polymorphism rs10491534 of the TSC1 gene with severity renal cell carcinomaКлиментоваЕ. А.KlimentovaE. A.lissa987@yandex.ruГилязоваИ. Р.GilyazovaI. R.noemail@neicon.ruКунсбаеваГ. Б.KunsbaevaG. B.noemail@neicon.ruИзмайловА. А.IzmailovA. A.noemail@neicon.ruСултановИ. М.SultanovI. M.noemail@neicon.ruПавловВ. Н.PavlovV. N.noemail@neicon.ruХуснутдиноваЭ. К.KhusnutdinovaE. K.noemail@neicon.ruИнститут биохимии и генетики Уфимского научного центра РАНРоссияInstitute of Biochemistry and Genetics, Ufa Science Centre, RASRussian FederationБашкирский государственный университетРоссияBashkir State UniversityRussian FederationБашкирский государственный медицинский университетРоссияBashkir State Medical UniversityRussian FederationИнститут биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН; Башкирский государственный университетРоссияInstitute of Biochemistry and Genetics, Ufa Science Centre, RAS; Bashkir State UniversityRussian Federation2016071020161545052Copyright © Климентова Е.А., Гилязова И.Р., Кунсбаева Г.Б., Измайлов А.А., Султанов И.М., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К., 20162016Климентова Е.А., Гилязова И.Р., Кунсбаева Г.Б., Измайлов А.А., Султанов И.М., Павлов В.Н., Хуснутдинова Э.К.Klimentova E.A., Gilyazova I.R., Kunsbaeva G.B., Izmailov A.A., Sultanov I.M., Pavlov V.N., Khusnutdinova E.K.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/119

Актуальность. Почечно-клеточная карцинома (ПКК) - злокачественное новообразование почки, на долю которого приходится примерно 3% всех онкологических заболеваний. Недавние исследования показали важную роль микроРНК в возникновении и прогрессии онкологических заболеваний. Мы предположили, что генетический полиморфизм сайтов связывания микроРНК может быть ассоциирован с риском развития ПКК. Цель исследования. Поиск ассоциаций полиморфных вариантов сайтов связывания микроРНК rs6773576 гена CDCP1 , rs10982724 гена DEC1 , rs10491534 гена TSC1, являющихся участниками VHL-HIF1a пути, с риском развития ПКК и тяжестью их течения. Материалы и методы. В работе исследовано 255 образцов ДНК больных раком почки и 298 образцов ДНК здоровых индивидов. Генотипирование полиморфных локусов проводили методом ПЦР в режиме реального времени с использованием конкурирующих TaqMan-зондов. Результаты. Выявлено, что аллель rs10491534*C является маркером тяжелого течения рака почки (p = 0,044; OR = 1,72 (CI = 1,012-2,911)). Также обнаружено, что генотип rs10491534 *T/T (p = 0,044; OR = 0,55; (95%CI = 0,31-0,98)) является протективным маркером в отношении развития ПКК тяжелого течения. Показана наиболее значимая ассоциация локуса rs10491534 гена TSC1 с тяжестью течения заболевания в доминантной модели (p = 0,03 (* C/T+*C/C vs *T/T ), OR = 1,82 (95%CI = 1,05-3,15)). Выводы. Обнаруженные маркеры могут быть перспективными для прогноза течения рака почки.

Timeliness. Renal cell carcinoma (RCC) is a malignant neoplasm of the kidney which accounts for about 3% of all cancers. Recent studies have shown the important role of miRNAs in the occurrence and progression of cancer. We hypothesized that genetic polymorphisms of microRNA binding sites may be associated with RCC risk. Aim of investigation. Search for associations of polymorphic variants of miRNA binding sites rs6773576 CDCP1 gene, rs10982724 DEC1 gene, rs10491534 TSC1 gene with the risk of renal cell carcinoma, and the severity of the disease. Methods. We studied 255 DNA samples from 255 RCC patients and 298 controls. Genotyping of polymorphic loci was performed by real time PCR using TaqMan-competing probes. Results. We found allele rs10491534*C to be a marker of severe renal cell carcinoma (p = 0.044; OR = 1.72 (CI = 1.012-2.911)). Genotype rs10491534*T/T (p = 0.044; OR = 0.55; (95% CI = 0.31-0.98)) - protective marker against severe RCC. The most significant association of rs10491534 in TSC1 gene with the severity of the disease was found in the dominant model: the combination of genotypes *C/T+*C/C vs *T/T (p = 0,03; OR = 1.82 (95% CI = 1.05-3.15)). Conclusions. The revealed markers of RCC severity may be promising for the prognosis of the RCC.

VHL-HIF1a путьпочечно-клеточная карциномаполиморфизм в сайтах связывания микроРНКVHL-HIF1a pathwayrenal cell carcinomamicroRNA binding site polymorphismReferencesYu Z, Li Z, Jolicoeur N, Zhang L et al. Aberrant allele frequencies of the SNPs located in microRNA target sites are potentially associated with human cancers. Nucleic Acids Res. 2007; 35(13):4535-41.Yu Z, Li Z, Jolicoeur N, Zhang L et al. Aberrant allele frequencies of the SNPs located in microRNA target sites are potentially associated with human cancers. Nucleic Acids Res. 2007; 35(13):4535-41.Аушев ВН МикроРНК: малые молекулы с большим значением Клиническая онкогематология 2015; 8(1): 1-12Аушев ВН МикроРНК: малые молекулы с большим значением Клиническая онкогематология 2015; 8(1): 1-12Thien A, Prentzell MT, Holzwarth B et al. TSC1 activates TGF-b-Smad2/3 signaling in growth arrest and epithelial-to-mesenchymal transition. Dev Cell. 2015 Mar 9;32(5):617-30.Thien A, Prentzell MT, Holzwarth B et al. TSC1 activates TGF-b-Smad2/3 signaling in growth arrest and epithelial-to-mesenchymal transition. Dev Cell. 2015 Mar 9;32(5):617-30.Kwiatkowski DJ, Choueiri TK, Fay AP et al. Mutations in TSC1, TSC2, and MTOR Are Associated with Response to Rapalogs in Patients with Metastatic Renal Cell Carcinoma. Clin Cancer Res. 2016 Feb 1.Kwiatkowski DJ, Choueiri TK, Fay AP et al. Mutations in TSC1, TSC2, and MTOR Are Associated with Response to Rapalogs in Patients with Metastatic Renal Cell Carcinoma. Clin Cancer Res. 2016 Feb 1.Wei H, Ke HL, Lin J et al. MicroRNA target site polymorphisms in the VHL-HIF1a pathway predict renal cell carcinoma risk Mol Carcinog. 2014 Jan;53(1):1-7.Wei H, Ke HL, Lin J et al. MicroRNA target site polymorphisms in the VHL-HIF1a pathway predict renal cell carcinoma risk Mol Carcinog. 2014 Jan;53(1):1-7.Awakura Y, Nakamura E, Takahashi T et al. Microarray-based identification of CUB-domain containing protein 1 as a potential prognostic marker in conventional renal cell carcinoma. J Cancer Res Clin Oncol. 2008;134(12):1363-9.Awakura Y, Nakamura E, Takahashi T et al. Microarray-based identification of CUB-domain containing protein 1 as a potential prognostic marker in conventional renal cell carcinoma. J Cancer Res Clin Oncol. 2008;134(12):1363-9.Mamat S, Ikeda J, Enomoto T et al. Prognostic significance of CUB domain containing protein expression in endometrioid adenocarcinoma. Oncol Rep. 2010 May;23(5):1221-7.Mamat S, Ikeda J, Enomoto T et al. Prognostic significance of CUB domain containing protein expression in endometrioid adenocarcinoma. Oncol Rep. 2010 May;23(5):1221-7.Ma W, Shi X, Lu S, Wu L, Wang Y. Hypoxia-induced overexpression of DEC1 is regulated by HIF-1a in hepatocellular carcinoma. Oncol Rep. 2013;30(6):2957-62.Ma W, Shi X, Lu S, Wu L, Wang Y. Hypoxia-induced overexpression of DEC1 is regulated by HIF-1a in hepatocellular carcinoma. Oncol Rep. 2013;30(6):2957-62.Wykoff CC, Pugh CW, Maxwell PH, Harris AL, Ratcliffe PJ.Identification of novel hypoxia dependent and independent target genes of the von Hippel-Lindau (VHL) tumour suppressor by mRNA differential expression profiling. Oncogene. 2000;19(54):6297-305.Wykoff CC, Pugh CW, Maxwell PH, Harris AL, Ratcliffe PJ.Identification of novel hypoxia dependent and independent target genes of the von Hippel-Lindau (VHL) tumour suppressor by mRNA differential expression profiling. Oncogene. 2000;19(54):6297-305.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.