medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.1234/XXXX-XXXX-2016-4-17-20medgen-110Research ArticleМЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ МЕДИЦИНСКОЙ ГЕНЕТИКИ», 29-30 СЕНТЯБРЯ 2016 Г., Г.ТОМСКСравнительный анализ мутаций в гене ТР53 у больных ДВККЛ г.Новосибирска с данными, представленными в IARC TP53 mutation databaseComparative analysis of TP53 gene mutations in patients with DLBCL of Novosibirsk with data presented in IARC TP53 mutation databaseВоропаеваЕ. Н.VoropaevaE. N.vena.81@mail.ruПоспеловаТ. И.PospelovaT. I.noemail@neicon.ruВоеводаМ. И.VoivodaM. I.noemail@neicon.ruМаксимовВ. Н.MaksimovV. N.noemail@neicon.ruФГБНУ «Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины»РоссияScientific Research Institute of Internal and Preventive medicineRussian Federation«Новосибирский государственный медицинский университет»РоссияNovosibirsk State Medical UniversityRussian FederationФГБНУ «Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины»; «Новосибирский государственный медицинский университет»РоссияScientific Research Institute of Internal and Preventive medicine; Novosibirsk State Medical UniversityRussian Federation2016071020161541720Copyright © Воропаева Е.Н., Поспелова Т.И., Воевода М.И., Максимов В.Н., 20162016Воропаева Е.Н., Поспелова Т.И., Воевода М.И., Максимов В.Н.Voropaeva E.N., Pospelova T.I., Voivoda M.I., Maksimov V.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/110

Актуальность. В текущей версии IARC TP53 mutation database информация о частоте и спектре мутаций в гене ТР53 у больных диффузной В-крупноклеточной лимфомой (ДВККЛ) российской популяции не представлена. Цель исследования: сравнить частоту и спектр мутаций в гене ТР53 у больных ДВККЛ г.Новосибирска с данными, представленными в IARC TP53 mutation database. Материалы и методы. Методом прямого секвенирования по Сэнгеру выполнен анализ кодирующей последовательности гена ТР53 (с 5 по 10 экзоны) в опухолевой ткани 74 пациентов с впервые установленным диагнозом ДВККЛ. Результаты. В группе исследования у 24,3% пациентов были выявлены мутации в кодирующей последовательности 5-8 экзонов гена ТР53. Множественные мутации имели 4% пациентов. Выявлены случаи потери гетерозиготности в гене ТР53 в опухолевой ткани ДВККЛ. Спектр однонуклеотидных замен в ТР53 в группе исследования значимо не отличается от данных, представленных в IARC TP53 mutation database, вместе с тем, наблюдались отличия по локализации «горячих точек» мутаций. В анализируемой выборке больных ДВККЛ «горячими точками» мутаций являлись кодоны 275, 155, 272 и 212. Выводы. При сравнительном анализе результатов секвенирования в гена ТР53 опухолевой ткани больных г.Новосибирска с данными, представленными в IARC TP53 mutation database, выявлены различия в спектре мутаций. Частота мутаций в гене ТР53 опухолевой ткани в группе исследования согласуется с данными литературы.

Relevance. The information about the frequency and spectrum of TP53 gene mutations in Russian patients with diffuse large cell lymphoma (DLBCL) is not represented in the current version of the IARC TP53 mutation database. Purpose of the study was to compare the frequency and spectrum of TP53 gene mutations in Novosibirsk patients with DLBCL with the data presented in IARC TP53 mutation database. Material and methods. The TP53 gene sequence from 5 to 10 exons of 74 tumor tissue samples of patients with newly diagnosed DLBCL was analyzed by Sanger direct sequencing. Results. In 24.3% of patients were identified a mutation in the coding sequence of exons 5-8 TP53 gene. Multiple mutations had 4% of patients. The cases of loss of heterozygosity in the TP53 gene in DLBCL tumor tissue were revealed. The spectrum of single-nucleotide substitutions in the TP53 in the study group did not significantly differ from the data presented in IARC TP53 mutation database, but we observed differences in localization of the «hot spot» mutations. In the analyzed group of patients with DLBCL «hot spots» mutations were in codons 275, 155, 272 and 212. Conclusions. Comparative analysis of the results of sequencing gene TP53 in tumor tissue of patients with DLBCL in Novosibirsk with the data presented in IARC TP53 mutation database is revealed differences in the spectrum of mutations. The frequency of mutations in the gene TP53 in the study group are consistent with the literature dates.

ген ТР53IARC TP53 mutation databaseмутациидиффузная В-крупноклеточная лимфомаgene TP53IARC TP53 mutation databasemutationsDiffuse Large B-cell LymphomaReferencesYoung KH, Leroy K, Moller MB et al. Structural profiles of TP53 gene mutations predict clinical outcome in diffuse large B-cell lymphoma: an international collaborative study. Blood. 2008;112:3088-3098.Young KH, Leroy K, Moller MB et al. Structural profiles of TP53 gene mutations predict clinical outcome in diffuse large B-cell lymphoma: an international collaborative study. Blood. 2008;112:3088-3098.Xu-Monette ZY, Wu L, Visco C, Tai YC et al. Mutational profile and prognostic significance of TP53 in diffuse large B-cell lymphoma patients treated with R-CHOP: report from an International DLBCL Rituximab-CHOP Consortium Program Study. Blood. 2012;120(19):3986-96.Xu-Monette ZY, Wu L, Visco C, Tai YC et al. Mutational profile and prognostic significance of TP53 in diffuse large B-cell lymphoma patients treated with R-CHOP: report from an International DLBCL Rituximab-CHOP Consortium Program Study. Blood. 2012;120(19):3986-96.Edlund K, Larsson O, Ameur A et al. Data-driven unbiased curation of the TP53 tumor suppressor gene mutation database and validation by ultradeep sequencing of human tumors. Proc Natl Acad Sci USA. 2012;109(24):9551-6.Edlund K, Larsson O, Ameur A et al. Data-driven unbiased curation of the TP53 tumor suppressor gene mutation database and validation by ultradeep sequencing of human tumors. Proc Natl Acad Sci USA. 2012;109(24):9551-6.Frebourg T, Barbier N, Kassel J. et al. A functional screen for germ line p53 mutations based on transcriptional activation. Сancer research. 1992;52:6976-6978.Frebourg T, Barbier N, Kassel J. et al. A functional screen for germ line p53 mutations based on transcriptional activation. Сancer research. 1992;52:6976-6978.Zhang Y, Hu Y, Fang JY et al. Gain-of-function miRNA signature by mutant p53 associates with poor cancer outcome. Oncotarget. 2016. doi: 10.18632/oncotarget.7090. [Epub ahead of print]Zhang Y, Hu Y, Fang JY et al. Gain-of-function miRNA signature by mutant p53 associates with poor cancer outcome. Oncotarget. 2016. doi: 10.18632/oncotarget.7090. [Epub ahead of print]http://p53.frhttp://p53.frLehman TA, Haffty BG, Carbone CJ et al. Elevated frequency and functional activity of a specific germ-line p53 intron mutation in familial breast cancer. Cancer Res. 2000;60(4):1062-1069.Lehman TA, Haffty BG, Carbone CJ et al. Elevated frequency and functional activity of a specific germ-line p53 intron mutation in familial breast cancer. Cancer Res. 2000;60(4):1062-1069.Slingerland JM, Jenkins JR, Benchimol S. The transforming and suppressor functions of p53 alleles: effects of mutations that disrupt phosphorylation, oligomerization and nuclear translocation. The EMBO Journal. 1993;12(3):1029 - 1037.Slingerland JM, Jenkins JR, Benchimol S. The transforming and suppressor functions of p53 alleles: effects of mutations that disrupt phosphorylation, oligomerization and nuclear translocation. The EMBO Journal. 1993;12(3):1029 - 1037.Tennis M, Krishnan S, Bonner M et al. Method p53 mutation analysis in breast tumors by a DNA microarray. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2006;15(1):80-85.Tennis M, Krishnan S, Bonner M et al. Method p53 mutation analysis in breast tumors by a DNA microarray. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2006;15(1):80-85.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.