medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.1234/XXXX-XXXX-2016-4-10-13medgen-108Research ArticleМЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ «АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ МЕДИЦИНСКОЙ ГЕНЕТИКИ», 29-30 СЕНТЯБРЯ 2016 Г., Г.ТОМСКВзаимоотношения популяций мира по SNP маркерам Х-хромосомы, входящим в состав тест-системы для ДНК-идентификации XSNPidRelationships of world populations by SNP markers of the X chromosome are part of the test system for DNA-identification XSNPidВагайцеваК. В.VagaitsevaK. V.kseniya.simonova@medgenetics.ruХарьковВ. Н.KharkovV. N.noemail@neicon.ruСтепановВ. А.StepanovV. A.noemail@neicon.ruНИИ медицинской генетики; ФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Томский государственный университет»РоссияНИИ медицинской генетикиRussian Federation2016071020161541013Copyright © Вагайцева К.В., Харьков В.Н., Степанов В.А., 20162016Вагайцева К.В., Харьков В.Н., Степанов В.А.Vagaitseva K.V., Kharkov V.N., Stepanov V.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/108

В статье представлены результаты анализа генетических взаимоотношений популяций по панели 66 X-SNP маркеров Х-хромосомы, входящих в состав тест-системы для ДНК-идентификации XSNPid, а также результаты оценки идентификационного потенциала данной системы для популяций мира. В исследование были включены такие популяции, как: русские, тувинцы, буряты, казахи, хакасы, сибирские татары, ханты, жители штата Юта центрально-европейского происхождения, итальянцы, мексиканцы, японцы, хань, индийцы, афроамериканцы. Анализ показал, что генетические отличия исследованных популяций демонстрируют географическую структурированность, при этом тест-система XSNPid является наиболее информативной для популяций, относящихся к европеоидному расовому типу. Ключевые слова: популяционная генетика, ДНК-идентификация, Х-хромосома, однонуклеотидные полиморфные маркеры, XSNPid

This paper presents results of analysis of the genetic relationships of populations on panel 66 X-SNP markers of the X chromosome included in the test system for DNA-identification XSNPid, and the results of evaluation of identification potential of this system for the populations of the world. The study included populations such as Russians, Tuvinians, Buryats, Kazakhs, Khakas, Siberian Tatars, Khanty, Utah residents of Central European origin, Italians, Mexicans, Japanese, Han, Indians, African Americans. The analysis showed that the genetic differences of the studied populations show geographic structuring. The test system XSNPid is the most informative for populations belonging to the Caucasoid racial type.

популяционная генетикаДНК-идентификацияХ-хромосомаоднонуклеотидные полиморфные маркерыXSNPidpopulation geneticsDNA identificationX-chromosomesingle nucleotide polymorphismXSNPidReferencesSchaffner SF. The X chromosome in population genetics. Nat Rev Genet. 2004; 5(1):43-51Schaffner SF. The X chromosome in population genetics. Nat Rev Genet. 2004; 5(1):43-51Szibor R. X-chromosomal markers: past, present and future. Forensic Sci Int Genet. 2007; 1(2):93-99Szibor R. X-chromosomal markers: past, present and future. Forensic Sci Int Genet. 2007; 1(2):93-99Petkovski E, Keyser-Tracqui C, Hienne R et al. SNPs and MALDI-TOF MS: tools for DNA typing in forensic paternity testing and anthropology. J. Forensic. Sci. 2005; 50(3):535-541.Petkovski E, Keyser-Tracqui C, Hienne R et al. SNPs and MALDI-TOF MS: tools for DNA typing in forensic paternity testing and anthropology. J. Forensic. Sci. 2005; 50(3):535-541.Lin Y, Li L, Liu Y et al. SNP typing of formalin-fixed tissue in individual identification. Fa. Yi. Xue. Za. Zhi. 2010; 26(6):446-448.Lin Y, Li L, Liu Y et al. SNP typing of formalin-fixed tissue in individual identification. Fa. Yi. Xue. Za. Zhi. 2010; 26(6):446-448.Li L, Liu Y, Lin Y et al. Genotyping and linkage disequilibrium analysis of 67 SNP loci on X chromosome.Fa. Yi. Xue. Za. Zhi. 2011; 27(5):337-341.Li L, Liu Y, Lin Y et al. Genotyping and linkage disequilibrium analysis of 67 SNP loci on X chromosome.Fa. Yi. Xue. Za. Zhi. 2011; 27(5):337-341.Li Y, Liu Y, Lin Y. Typing of 67 SNP Loci on X Chromosome by PCR and MALDI-TOF MS. Research in Genetics. 2015; Article ID 374688: 9.Li Y, Liu Y, Lin Y. Typing of 67 SNP Loci on X Chromosome by PCR and MALDI-TOF MS. Research in Genetics. 2015; Article ID 374688: 9.Butler JM, Coble MD, Vallone PM. STRs vs SNP: thoughts on the future of forensic DNA testing. Forensic. Sci. Med. Pathol. 2007; 3(3):200-205.Butler JM, Coble MD, Vallone PM. STRs vs SNP: thoughts on the future of forensic DNA testing. Forensic. Sci. Med. Pathol. 2007; 3(3):200-205.Степанов ВА, Вагайцева КВ, Харьков ВН и др. Панель однонуклеотидных, сцепленных с Х-хромосомой, полиморфных маркеров для ДНК-идентификации (XSNPid) на основе мультиплексного генотипирования с использованием методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF. Молекулярная биология. 2016; 50(3):1-12.Степанов ВА, Вагайцева КВ, Харьков ВН и др. Панель однонуклеотидных, сцепленных с Х-хромосомой, полиморфных маркеров для ДНК-идентификации (XSNPid) на основе мультиплексного генотипирования с использованием методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF. Молекулярная биология. 2016; 50(3):1-12.Степанов ВА, Вагайцева КВ, Харьков ВН и др. Вариабельность и идентификационный потенциалСтепанов ВА, Вагайцева КВ, Харьков ВН и др. Вариабельность и идентификационный потенциалX-хромосомных SNPs в двух популяциях коренного населения Сибири. Генетика. 2016; 52(4):493-496.X-хромосомных SNPs в двух популяциях коренного населения Сибири. Генетика. 2016; 52(4):493-496.Stepanov V, Vagaitseva K, Kharkov V, et al. Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations. Legal Medicine. 2016; 18:66-71.Stepanov V, Vagaitseva K, Kharkov V, et al. Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations. Legal Medicine. 2016; 18:66-71.Степанов В.А., Харьков В.Н., Трифонова Е.А., Марусин А.В. Методы статистического анализа в популяционной и эволюционной генетике человека. Томск. 2014. 99с.Степанов В.А., Харьков В.Н., Трифонова Е.А., Марусин А.В. Методы статистического анализа в популяционной и эволюционной генетике человека. Томск. 2014. 99с.Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia Univ. Press. 1987. 512 p. 13. Вагайцева КВ., Харьков ВН., Черпинская КВ и др. Генетическая вариабельность X-сцепленных STR-маркеров в популяциях Сибири. Молекулярная биология. 2015; 49(2): 305-312.Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia Univ. Press. 1987. 512 p. 13. Вагайцева КВ., Харьков ВН., Черпинская КВ и др. Генетическая вариабельность X-сцепленных STR-маркеров в популяциях Сибири. Молекулярная биология. 2015; 49(2): 305-312.Степанов ВА. Геномы, популяции, болезни: этническая геномика и персонифицированная медицина. Acta Naturae. 2010; 2(4):18-34.Степанов ВА. Геномы, популяции, болезни: этническая геномика и персонифицированная медицина. Acta Naturae. 2010; 2(4):18-34.Elhaik E, Tatarinova T, Chebotarev et al. Geographic population structure analysis of worldwide human populations infers their biogeographical origins. Nat Commun. 2014; 5:3513.Elhaik E, Tatarinova T, Chebotarev et al. Geographic population structure analysis of worldwide human populations infers their biogeographical origins. Nat Commun. 2014; 5:3513.Yunusbayev B, Metspalu M, Jarve M, et al. The Caucasus as an asymmetric semipermeable barrier to ancient human migrations. Mol Biol Evol. 2012; 29(1): 359-65.Yunusbayev B, Metspalu M, Jarve M, et al. The Caucasus as an asymmetric semipermeable barrier to ancient human migrations. Mol Biol Evol. 2012; 29(1): 359-65.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.